Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BIF5

Protein Details
Accession Q6BIF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-52LNSNPEILLRKRKNNDRKRLEKQEQARQRQLEQKKKNDQRSKKFVRAETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-45RKRKNNDRKRLEKQEQARQRQLEQKKKNDQRSK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036919  L30_ferredoxin-like_sf  
IPR018038  Ribosomal_L30_CS  
IPR016082  Ribosomal_L30_ferredoxin-like  
IPR039699  Ribosomal_L7/L30  
IPR035808  Ribosomal_L7_euk_arc  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG dha:DEHA2G10890g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00327  Ribosomal_L30  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00634  RIBOSOMAL_L30  
CDD cd01657  Ribosomal_L7_archeal_euk  
Amino Acid Sequences MAVLNSNPEILLRKRKNNDRKRLEKQEQARQRQLEQKKKNDQRSKKFVRAETLVSNYKSNELENKRIKHITKFEKQSQADKISQAKEDDESAKLLFIIRIPDHTKGLKVPSKARKVLHLLRLNRPNTGVFVKLTPATVPLLKLISPYIVAGKPSLNSIRKLFQKRACISVIDEETKEPRITKLDNNGVVEDKFGDDLGCICIEDLIHELATLGEHFKTVSNWILPFKLNAPVSGWGPQAKLAKLQYSNEHQRKISLAGDAKLNEIDIDQFIDEQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.67
3 0.77
4 0.83
5 0.88
6 0.88
7 0.9
8 0.91
9 0.93
10 0.9
11 0.89
12 0.87
13 0.87
14 0.86
15 0.85
16 0.83
17 0.75
18 0.73
19 0.74
20 0.75
21 0.75
22 0.74
23 0.75
24 0.78
25 0.84
26 0.89
27 0.89
28 0.9
29 0.9
30 0.91
31 0.9
32 0.88
33 0.86
34 0.79
35 0.76
36 0.69
37 0.63
38 0.57
39 0.54
40 0.5
41 0.44
42 0.42
43 0.35
44 0.34
45 0.3
46 0.26
47 0.29
48 0.29
49 0.37
50 0.44
51 0.47
52 0.49
53 0.55
54 0.56
55 0.55
56 0.59
57 0.59
58 0.6
59 0.64
60 0.66
61 0.69
62 0.69
63 0.67
64 0.64
65 0.6
66 0.53
67 0.49
68 0.47
69 0.4
70 0.4
71 0.35
72 0.29
73 0.25
74 0.25
75 0.23
76 0.18
77 0.17
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.11
85 0.1
86 0.14
87 0.17
88 0.19
89 0.21
90 0.21
91 0.21
92 0.19
93 0.26
94 0.26
95 0.27
96 0.34
97 0.4
98 0.47
99 0.51
100 0.5
101 0.48
102 0.51
103 0.55
104 0.55
105 0.53
106 0.51
107 0.54
108 0.61
109 0.56
110 0.49
111 0.44
112 0.35
113 0.3
114 0.27
115 0.2
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.11
141 0.16
142 0.16
143 0.18
144 0.2
145 0.25
146 0.32
147 0.38
148 0.43
149 0.43
150 0.5
151 0.49
152 0.51
153 0.47
154 0.4
155 0.36
156 0.34
157 0.32
158 0.24
159 0.22
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.2
164 0.15
165 0.14
166 0.16
167 0.18
168 0.22
169 0.29
170 0.34
171 0.36
172 0.37
173 0.37
174 0.35
175 0.32
176 0.28
177 0.2
178 0.13
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.11
206 0.14
207 0.15
208 0.17
209 0.19
210 0.2
211 0.2
212 0.21
213 0.21
214 0.25
215 0.22
216 0.21
217 0.22
218 0.23
219 0.24
220 0.26
221 0.26
222 0.2
223 0.2
224 0.25
225 0.26
226 0.25
227 0.28
228 0.28
229 0.33
230 0.35
231 0.38
232 0.4
233 0.45
234 0.55
235 0.56
236 0.59
237 0.53
238 0.51
239 0.5
240 0.47
241 0.4
242 0.36
243 0.34
244 0.3
245 0.35
246 0.33
247 0.32
248 0.29
249 0.26
250 0.19
251 0.15
252 0.15
253 0.11
254 0.12
255 0.1