Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WNT0

Protein Details
Accession Q4WNT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-123FYIGEKRQRGGRKKRKKNREAQAFVQNWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-114KRQRGGRKKRKKNR
412-421RGKIIGGKRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.833, cyto 7, cyto_mito 5.333, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG afm:AFUA_4G06840  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
CDD cd12374  RRM_UHM_SPF45_PUF60  
Amino Acid Sequences MTSESTPSKGGGLSLYANLLDPSSNASSPGTISRAPVVFKQASEGDSQTDDSAAKKQQLSAALPKSTPGAASAPAPPVKTTLADWAATEEDDVNGFYIGEKRQRGGRKKRKKNREAQAFVQNWDDIYDPSRPNIYEEYKHSDEQIAEVREWKDRLYAHRMARSPSRSSHSADESRPMNSKLFFAWRSTVKNAHEFFAEQFAPPQSFAPPPNLNDIPPAPLDEATGDDAFARRARMTAGQSDALMSGRTPPAPPPPPEEAPAPISDDPTGEDAYLRRVQMAAAAQPTLQAPTRPPPRPLDALQPASATISRAPVRYTLPPPPEDIPATEAELEEVFAKEEPAGDAPDEEDGQRSLRPGQKGFAERLLAKYGWTKGSGLGATGSGIVKPLQVKVEKQKKRPDSEGGGFVTPAGRGKIIGGKRKAEEEEGKFGRMSEVIILKGMLDGMDVDAELEGDQDGGLIQEIGEECSEKYGRVERVFISRESGPPVPVFVKFTNQLSALRAVNALEGRVFNGNTITARFYDTQKFEEGIYDDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.1
8 0.08
9 0.13
10 0.15
11 0.15
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.18
16 0.21
17 0.2
18 0.17
19 0.19
20 0.23
21 0.24
22 0.26
23 0.27
24 0.31
25 0.29
26 0.28
27 0.31
28 0.28
29 0.28
30 0.29
31 0.27
32 0.22
33 0.21
34 0.23
35 0.18
36 0.17
37 0.16
38 0.15
39 0.19
40 0.2
41 0.24
42 0.24
43 0.26
44 0.29
45 0.34
46 0.38
47 0.41
48 0.44
49 0.41
50 0.4
51 0.39
52 0.36
53 0.31
54 0.26
55 0.19
56 0.15
57 0.13
58 0.16
59 0.18
60 0.21
61 0.23
62 0.24
63 0.22
64 0.23
65 0.23
66 0.22
67 0.2
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.22
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.19
76 0.12
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.1
85 0.13
86 0.19
87 0.21
88 0.22
89 0.29
90 0.39
91 0.49
92 0.57
93 0.65
94 0.7
95 0.8
96 0.89
97 0.93
98 0.94
99 0.94
100 0.93
101 0.93
102 0.89
103 0.84
104 0.83
105 0.74
106 0.65
107 0.57
108 0.46
109 0.35
110 0.29
111 0.23
112 0.13
113 0.14
114 0.18
115 0.16
116 0.17
117 0.2
118 0.19
119 0.21
120 0.26
121 0.29
122 0.28
123 0.32
124 0.39
125 0.4
126 0.4
127 0.38
128 0.35
129 0.3
130 0.28
131 0.3
132 0.23
133 0.2
134 0.24
135 0.25
136 0.26
137 0.26
138 0.24
139 0.21
140 0.22
141 0.27
142 0.31
143 0.37
144 0.38
145 0.45
146 0.46
147 0.46
148 0.51
149 0.5
150 0.46
151 0.43
152 0.43
153 0.39
154 0.4
155 0.41
156 0.41
157 0.41
158 0.38
159 0.39
160 0.35
161 0.35
162 0.34
163 0.31
164 0.27
165 0.22
166 0.22
167 0.19
168 0.23
169 0.22
170 0.21
171 0.23
172 0.25
173 0.28
174 0.31
175 0.34
176 0.31
177 0.38
178 0.36
179 0.33
180 0.3
181 0.27
182 0.25
183 0.24
184 0.22
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.11
192 0.13
193 0.14
194 0.19
195 0.21
196 0.21
197 0.27
198 0.27
199 0.25
200 0.26
201 0.25
202 0.2
203 0.18
204 0.18
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.07
219 0.07
220 0.09
221 0.12
222 0.14
223 0.16
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.16
229 0.12
230 0.1
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.1
237 0.17
238 0.22
239 0.23
240 0.27
241 0.31
242 0.32
243 0.34
244 0.33
245 0.28
246 0.25
247 0.24
248 0.22
249 0.16
250 0.16
251 0.14
252 0.13
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.11
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.07
276 0.08
277 0.17
278 0.25
279 0.27
280 0.3
281 0.33
282 0.37
283 0.4
284 0.41
285 0.41
286 0.39
287 0.39
288 0.36
289 0.32
290 0.28
291 0.25
292 0.23
293 0.15
294 0.09
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.17
301 0.21
302 0.24
303 0.27
304 0.29
305 0.29
306 0.32
307 0.31
308 0.31
309 0.27
310 0.24
311 0.2
312 0.17
313 0.17
314 0.14
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.1
340 0.14
341 0.19
342 0.23
343 0.23
344 0.25
345 0.3
346 0.33
347 0.34
348 0.32
349 0.31
350 0.27
351 0.29
352 0.3
353 0.23
354 0.21
355 0.23
356 0.22
357 0.2
358 0.21
359 0.19
360 0.16
361 0.19
362 0.18
363 0.15
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.09
374 0.11
375 0.15
376 0.17
377 0.22
378 0.32
379 0.42
380 0.49
381 0.56
382 0.64
383 0.68
384 0.73
385 0.74
386 0.7
387 0.68
388 0.65
389 0.62
390 0.54
391 0.46
392 0.39
393 0.34
394 0.27
395 0.19
396 0.16
397 0.11
398 0.09
399 0.08
400 0.1
401 0.17
402 0.23
403 0.31
404 0.35
405 0.39
406 0.4
407 0.45
408 0.45
409 0.44
410 0.46
411 0.42
412 0.47
413 0.44
414 0.43
415 0.39
416 0.37
417 0.32
418 0.24
419 0.2
420 0.15
421 0.15
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.07
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.03
448 0.06
449 0.06
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.14
455 0.14
456 0.13
457 0.16
458 0.22
459 0.28
460 0.3
461 0.33
462 0.3
463 0.38
464 0.41
465 0.38
466 0.36
467 0.32
468 0.32
469 0.35
470 0.34
471 0.28
472 0.25
473 0.28
474 0.25
475 0.25
476 0.28
477 0.23
478 0.28
479 0.29
480 0.31
481 0.31
482 0.31
483 0.31
484 0.29
485 0.31
486 0.26
487 0.24
488 0.23
489 0.19
490 0.21
491 0.2
492 0.18
493 0.15
494 0.14
495 0.15
496 0.19
497 0.18
498 0.15
499 0.16
500 0.17
501 0.16
502 0.18
503 0.18
504 0.15
505 0.2
506 0.22
507 0.25
508 0.32
509 0.34
510 0.35
511 0.36
512 0.36
513 0.32
514 0.34