Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B5RV26

Protein Details
Accession B5RV26    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-74PSSSGLPKLKIKPPKQKENKVTKKHQEAGTKHKKLKLNIKQKKPEIDNIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-69PKLKIKPPKQKENKVTKKHQEAGTKHKKLKLNIKQKKP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 13.166, cyto_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG dha:DEHA2G03520g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MALKLKLKVPSTGSSQSSGNGSNSQPSSSGLPKLKIKPPKQKENKVTKKHQEAGTKHKKLKLNIKQKKPEIDNIGIRGNGGHQPTRSVPKVRIKPTRVPGDGYDSEAPDLEDDPLIEQGIIIRFVNDANLDFVHNAVDSGDLTGLNVKWVTKVKAVVNVNGTLYSAKLLDLPTITELYKTIDKKNIFKTFDICQILLVLYPVNPSDLNLERDFEVPSDLTHVHPLYKMSPKHELKPAKTVLKNGLIYPFEEVYRRFKPRKVNHRVVEDIEQRIDELIRLDDEAEESHFEIVDLTKQQTNQHRFSNISGTSSAVATPSAIPIESQTQFNNGSEEEEEQEMLAQSDEGDLEEELAKALENDETMVGDINMENEVDGEGIEEEEGQEEEEEEEEEDEDEDDEEDDDDDENDENDDEDDESKADKEHVKMLEEEIADLENAVEVHRKGLASATHKMMKMKFQTSYNTLKASLDTKKRELAKIVSDQQQLQQKMDPNKDTNAETFESNQYLDDHDDQEEENATPDDNLDDIDDLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.37
4 0.35
5 0.33
6 0.28
7 0.25
8 0.24
9 0.28
10 0.29
11 0.28
12 0.26
13 0.25
14 0.27
15 0.27
16 0.34
17 0.32
18 0.37
19 0.44
20 0.51
21 0.57
22 0.63
23 0.69
24 0.72
25 0.77
26 0.83
27 0.86
28 0.89
29 0.91
30 0.92
31 0.93
32 0.92
33 0.93
34 0.92
35 0.91
36 0.88
37 0.85
38 0.83
39 0.79
40 0.8
41 0.81
42 0.8
43 0.76
44 0.75
45 0.74
46 0.72
47 0.77
48 0.76
49 0.76
50 0.77
51 0.82
52 0.85
53 0.86
54 0.87
55 0.81
56 0.79
57 0.76
58 0.73
59 0.68
60 0.62
61 0.58
62 0.48
63 0.42
64 0.34
65 0.28
66 0.25
67 0.23
68 0.22
69 0.2
70 0.24
71 0.29
72 0.36
73 0.39
74 0.38
75 0.43
76 0.5
77 0.59
78 0.64
79 0.7
80 0.69
81 0.73
82 0.77
83 0.79
84 0.71
85 0.65
86 0.58
87 0.56
88 0.51
89 0.46
90 0.39
91 0.3
92 0.29
93 0.25
94 0.23
95 0.15
96 0.15
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.07
104 0.06
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.12
136 0.16
137 0.18
138 0.18
139 0.23
140 0.24
141 0.31
142 0.33
143 0.33
144 0.32
145 0.31
146 0.29
147 0.24
148 0.23
149 0.15
150 0.13
151 0.1
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.12
165 0.17
166 0.18
167 0.21
168 0.26
169 0.29
170 0.35
171 0.44
172 0.49
173 0.46
174 0.45
175 0.45
176 0.41
177 0.46
178 0.42
179 0.33
180 0.25
181 0.22
182 0.21
183 0.18
184 0.15
185 0.08
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.1
193 0.13
194 0.17
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.19
199 0.19
200 0.14
201 0.13
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.21
214 0.23
215 0.23
216 0.33
217 0.34
218 0.38
219 0.45
220 0.48
221 0.44
222 0.5
223 0.52
224 0.49
225 0.48
226 0.47
227 0.43
228 0.42
229 0.41
230 0.33
231 0.32
232 0.25
233 0.24
234 0.23
235 0.19
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.16
240 0.22
241 0.28
242 0.28
243 0.32
244 0.42
245 0.5
246 0.6
247 0.64
248 0.68
249 0.67
250 0.7
251 0.68
252 0.6
253 0.57
254 0.49
255 0.4
256 0.3
257 0.25
258 0.19
259 0.17
260 0.15
261 0.09
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.17
284 0.25
285 0.31
286 0.33
287 0.35
288 0.36
289 0.36
290 0.36
291 0.38
292 0.29
293 0.25
294 0.21
295 0.19
296 0.17
297 0.16
298 0.14
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.14
313 0.16
314 0.16
315 0.16
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.12
407 0.15
408 0.16
409 0.22
410 0.24
411 0.25
412 0.26
413 0.27
414 0.29
415 0.25
416 0.24
417 0.18
418 0.16
419 0.13
420 0.12
421 0.1
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.15
432 0.2
433 0.22
434 0.27
435 0.32
436 0.35
437 0.37
438 0.41
439 0.4
440 0.43
441 0.45
442 0.45
443 0.43
444 0.42
445 0.47
446 0.48
447 0.53
448 0.49
449 0.44
450 0.4
451 0.36
452 0.35
453 0.34
454 0.37
455 0.38
456 0.41
457 0.43
458 0.49
459 0.53
460 0.55
461 0.55
462 0.51
463 0.5
464 0.52
465 0.56
466 0.57
467 0.55
468 0.53
469 0.53
470 0.56
471 0.5
472 0.43
473 0.42
474 0.41
475 0.47
476 0.53
477 0.54
478 0.49
479 0.52
480 0.54
481 0.52
482 0.47
483 0.43
484 0.36
485 0.31
486 0.31
487 0.3
488 0.28
489 0.25
490 0.23
491 0.2
492 0.2
493 0.23
494 0.22
495 0.21
496 0.2
497 0.21
498 0.2
499 0.21
500 0.21
501 0.16
502 0.16
503 0.14
504 0.14
505 0.13
506 0.13
507 0.12
508 0.1
509 0.1
510 0.09