Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4X1R8

Protein Details
Accession Q4X1R8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-194SDVQPLQKRRRKSSRGAEAAPHydrophilic
716-735GYEPSKRSRNWLKVKKDYLAHydrophilic
860-879LRFPRFIKSRDDKKPEQATTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-188KRRRKSSR
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 12.833, mito_nucl 11.666, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000977  DNA_ligase_ATP-dep  
IPR012309  DNA_ligase_ATP-dep_C  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0071897  P:DNA biosynthetic process  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006273  P:lagging strand elongation  
GO:1903461  P:Okazaki fragment processing involved in mitotic DNA replication  
KEGG afm:AFUA_2G09010  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04679  DNA_ligase_A_C  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07900  Adenylation_DNA_ligase_I_Euk  
cd07969  OBF_DNA_ligase_I  
Amino Acid Sequences MTILRISASIAPVSHYCRGPVAFTPKARISHRTSLRTFTGYTRPPFLSGATRSVVSTTHCSFAITTLPTMADSKGRKQATLGRFFGSNAEGPKTAPKKQTTLSFSSKKDKKSDVVDEQAEAREFSGIPEAKSEPANSEDVKMEDLSETEVAHMNGSPGSKSLKREKSSDEESDSDVQPLQKRRRKSSRGAEAAPTIRRESPSPMISEISKAEVKESSPPAILKKASGEETPEKETEHSEEEEVATASEEEDEDEKPEVMKKTMEKVQATLKATGTEPYPDWKPGEPVPYAALCKTFSLIEMTTKRLIILAHCSLFLRQVLRLTPQDLLPTVQLMINKLAADYAGIELGIGESFIMKAIGESTGRSLAVIKADQHEIGDLGLVAAKSRSNQPTMFKPKPLTVRGVHEGLIAIAKIQGQGSQDKKISAIKKLLEAKFIVRFLEGKLRLGLAEKTVLVALAQAVVAHEAAVRGEKTPSPEKMAQGEAVLKTVYSELPAYEVIIPAMLEHGLFNLPKVCKLQPGIPIKPMLAKPTKSITEVLNRFEGKNFTCEYKYDGERAQIHYDSKGLSAIFSRNSEDLSKKYPDVLAKLETWVKDGVKSFVLDCETVAWDTVNKKVLPFQQLMTRKRKDVKAEDVKVKVCIFAFDLLFLNGEPTVKKTLRERRELLHKSFEVVEGEFQFAQHGDTNDLEEIQNLLDESVKASCEGLMVKMLDTEESGYEPSKRSRNWLKVKKDYLAGVGDSLDLVVLGAYYGRGKRTSVYGAFLLAAYNSSTQTYETICNIGTGFSEALLEELYKELSPLTIDRPKPFYSHSNVPKDQPDVWFEPRLVWEVKTADLTLSPRYKAAADEFVGTAGGGKGVSLRFPRFIKSRDDKKPEQATTTRAVAEMYRKQEAVLKENTSKGGVDDDFEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.25
4 0.28
5 0.29
6 0.29
7 0.34
8 0.37
9 0.39
10 0.41
11 0.47
12 0.48
13 0.54
14 0.55
15 0.55
16 0.55
17 0.58
18 0.64
19 0.66
20 0.63
21 0.63
22 0.63
23 0.59
24 0.52
25 0.47
26 0.48
27 0.46
28 0.47
29 0.47
30 0.44
31 0.43
32 0.42
33 0.39
34 0.38
35 0.34
36 0.34
37 0.31
38 0.3
39 0.28
40 0.28
41 0.26
42 0.22
43 0.25
44 0.23
45 0.23
46 0.23
47 0.23
48 0.23
49 0.23
50 0.24
51 0.2
52 0.18
53 0.17
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.18
58 0.2
59 0.22
60 0.27
61 0.35
62 0.36
63 0.35
64 0.37
65 0.46
66 0.48
67 0.54
68 0.49
69 0.43
70 0.42
71 0.42
72 0.41
73 0.34
74 0.28
75 0.22
76 0.23
77 0.21
78 0.22
79 0.31
80 0.34
81 0.38
82 0.43
83 0.44
84 0.47
85 0.51
86 0.59
87 0.56
88 0.59
89 0.61
90 0.61
91 0.61
92 0.67
93 0.67
94 0.65
95 0.65
96 0.63
97 0.6
98 0.61
99 0.65
100 0.62
101 0.64
102 0.59
103 0.54
104 0.5
105 0.47
106 0.39
107 0.3
108 0.22
109 0.15
110 0.14
111 0.13
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.21
116 0.22
117 0.22
118 0.24
119 0.24
120 0.18
121 0.2
122 0.23
123 0.2
124 0.21
125 0.21
126 0.21
127 0.22
128 0.19
129 0.17
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.16
146 0.19
147 0.24
148 0.34
149 0.42
150 0.45
151 0.49
152 0.54
153 0.56
154 0.59
155 0.58
156 0.53
157 0.45
158 0.46
159 0.46
160 0.4
161 0.33
162 0.28
163 0.26
164 0.27
165 0.35
166 0.42
167 0.44
168 0.51
169 0.6
170 0.69
171 0.74
172 0.78
173 0.8
174 0.8
175 0.82
176 0.78
177 0.71
178 0.66
179 0.64
180 0.57
181 0.49
182 0.4
183 0.35
184 0.33
185 0.31
186 0.31
187 0.33
188 0.32
189 0.32
190 0.31
191 0.3
192 0.29
193 0.29
194 0.23
195 0.21
196 0.2
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.22
202 0.24
203 0.22
204 0.23
205 0.24
206 0.25
207 0.29
208 0.28
209 0.23
210 0.23
211 0.24
212 0.24
213 0.24
214 0.27
215 0.28
216 0.32
217 0.34
218 0.32
219 0.29
220 0.28
221 0.29
222 0.25
223 0.23
224 0.2
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.12
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.18
247 0.19
248 0.25
249 0.3
250 0.36
251 0.33
252 0.33
253 0.39
254 0.42
255 0.43
256 0.39
257 0.33
258 0.29
259 0.29
260 0.27
261 0.21
262 0.17
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.2
268 0.2
269 0.22
270 0.23
271 0.26
272 0.23
273 0.22
274 0.22
275 0.22
276 0.22
277 0.19
278 0.18
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.12
283 0.1
284 0.12
285 0.12
286 0.17
287 0.18
288 0.21
289 0.21
290 0.21
291 0.21
292 0.19
293 0.18
294 0.13
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.13
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.17
308 0.18
309 0.18
310 0.18
311 0.17
312 0.18
313 0.16
314 0.16
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.02
338 0.02
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.1
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.11
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.05
366 0.04
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.11
374 0.14
375 0.15
376 0.18
377 0.21
378 0.31
379 0.4
380 0.42
381 0.4
382 0.4
383 0.42
384 0.46
385 0.45
386 0.41
387 0.34
388 0.37
389 0.36
390 0.36
391 0.31
392 0.24
393 0.22
394 0.17
395 0.14
396 0.09
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.13
405 0.15
406 0.18
407 0.19
408 0.19
409 0.2
410 0.24
411 0.25
412 0.24
413 0.26
414 0.23
415 0.29
416 0.36
417 0.36
418 0.32
419 0.31
420 0.29
421 0.28
422 0.28
423 0.22
424 0.14
425 0.14
426 0.13
427 0.21
428 0.19
429 0.16
430 0.16
431 0.16
432 0.16
433 0.17
434 0.16
435 0.08
436 0.09
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.07
459 0.12
460 0.16
461 0.17
462 0.22
463 0.24
464 0.25
465 0.26
466 0.26
467 0.22
468 0.19
469 0.2
470 0.14
471 0.13
472 0.11
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.04
489 0.05
490 0.04
491 0.03
492 0.03
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.14
501 0.14
502 0.17
503 0.19
504 0.23
505 0.26
506 0.34
507 0.34
508 0.34
509 0.34
510 0.31
511 0.34
512 0.3
513 0.28
514 0.26
515 0.25
516 0.25
517 0.29
518 0.3
519 0.27
520 0.28
521 0.25
522 0.29
523 0.31
524 0.3
525 0.3
526 0.29
527 0.28
528 0.28
529 0.28
530 0.2
531 0.21
532 0.2
533 0.18
534 0.18
535 0.18
536 0.2
537 0.22
538 0.23
539 0.22
540 0.23
541 0.25
542 0.27
543 0.3
544 0.3
545 0.27
546 0.26
547 0.24
548 0.23
549 0.19
550 0.16
551 0.14
552 0.1
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.14
559 0.13
560 0.15
561 0.17
562 0.17
563 0.18
564 0.21
565 0.22
566 0.21
567 0.22
568 0.23
569 0.23
570 0.24
571 0.24
572 0.22
573 0.2
574 0.22
575 0.23
576 0.21
577 0.2
578 0.2
579 0.17
580 0.17
581 0.18
582 0.17
583 0.16
584 0.16
585 0.15
586 0.15
587 0.16
588 0.13
589 0.12
590 0.12
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.08
595 0.09
596 0.1
597 0.14
598 0.17
599 0.16
600 0.16
601 0.21
602 0.26
603 0.28
604 0.29
605 0.27
606 0.31
607 0.4
608 0.47
609 0.51
610 0.49
611 0.51
612 0.56
613 0.6
614 0.59
615 0.58
616 0.62
617 0.63
618 0.67
619 0.68
620 0.65
621 0.61
622 0.56
623 0.48
624 0.39
625 0.28
626 0.22
627 0.17
628 0.16
629 0.14
630 0.13
631 0.13
632 0.12
633 0.12
634 0.11
635 0.1
636 0.07
637 0.08
638 0.07
639 0.09
640 0.15
641 0.16
642 0.19
643 0.27
644 0.37
645 0.44
646 0.52
647 0.53
648 0.53
649 0.63
650 0.68
651 0.63
652 0.61
653 0.54
654 0.48
655 0.46
656 0.41
657 0.31
658 0.25
659 0.23
660 0.15
661 0.17
662 0.15
663 0.14
664 0.12
665 0.11
666 0.12
667 0.12
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.14
672 0.14
673 0.15
674 0.13
675 0.11
676 0.1
677 0.08
678 0.08
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.08
689 0.08
690 0.09
691 0.08
692 0.1
693 0.1
694 0.1
695 0.11
696 0.11
697 0.1
698 0.1
699 0.1
700 0.08
701 0.09
702 0.1
703 0.1
704 0.12
705 0.15
706 0.2
707 0.26
708 0.26
709 0.34
710 0.43
711 0.53
712 0.62
713 0.69
714 0.73
715 0.76
716 0.81
717 0.77
718 0.7
719 0.61
720 0.54
721 0.46
722 0.37
723 0.27
724 0.21
725 0.17
726 0.13
727 0.11
728 0.07
729 0.04
730 0.04
731 0.03
732 0.02
733 0.02
734 0.03
735 0.03
736 0.06
737 0.08
738 0.11
739 0.12
740 0.13
741 0.15
742 0.19
743 0.26
744 0.25
745 0.27
746 0.25
747 0.25
748 0.25
749 0.23
750 0.19
751 0.12
752 0.11
753 0.08
754 0.09
755 0.08
756 0.09
757 0.09
758 0.1
759 0.11
760 0.13
761 0.14
762 0.15
763 0.16
764 0.15
765 0.15
766 0.15
767 0.14
768 0.12
769 0.11
770 0.1
771 0.08
772 0.09
773 0.08
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.06
778 0.06
779 0.08
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.07
784 0.09
785 0.1
786 0.17
787 0.24
788 0.28
789 0.32
790 0.37
791 0.38
792 0.4
793 0.43
794 0.43
795 0.42
796 0.49
797 0.54
798 0.59
799 0.6
800 0.62
801 0.62
802 0.59
803 0.55
804 0.47
805 0.44
806 0.41
807 0.43
808 0.42
809 0.37
810 0.36
811 0.35
812 0.35
813 0.31
814 0.25
815 0.25
816 0.23
817 0.25
818 0.23
819 0.22
820 0.18
821 0.2
822 0.21
823 0.24
824 0.27
825 0.26
826 0.25
827 0.26
828 0.26
829 0.26
830 0.28
831 0.27
832 0.24
833 0.26
834 0.25
835 0.24
836 0.23
837 0.2
838 0.16
839 0.1
840 0.09
841 0.06
842 0.06
843 0.09
844 0.09
845 0.15
846 0.19
847 0.22
848 0.28
849 0.3
850 0.37
851 0.4
852 0.44
853 0.49
854 0.54
855 0.61
856 0.66
857 0.74
858 0.74
859 0.77
860 0.84
861 0.77
862 0.75
863 0.69
864 0.63
865 0.59
866 0.56
867 0.47
868 0.37
869 0.34
870 0.29
871 0.33
872 0.36
873 0.36
874 0.36
875 0.35
876 0.35
877 0.41
878 0.42
879 0.4
880 0.39
881 0.4
882 0.41
883 0.44
884 0.46
885 0.41
886 0.37
887 0.31
888 0.3
889 0.24