Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0B0M4

Protein Details
Accession A0A0D0B0M4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-323AKAKSAPKARTKKDEKVFIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-145RKEGRGRGRGRGDRGRGRP
305-364KAKSAPKARTKKDEKVFIEIEARFERPSRGGRGGRGGDRGGGERSRGERGRGRGGRGRGG
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MDPGSCLRGHHNSLQSHPYRLIDPSKRAMSVATRNPFALLDGRLLLFNVILSLTFTYKQRTGHPLLPLHLSLLRQHPLHNHNQLVVVDAEALPLVVADTTSVGALHPLLVPLRLMTNQLQSQNQGDRKEGRGRGRGRGDRGRGRPFDKHSQTGKTDSDKKVHNSWGGDDGETERKTEEAATNDAFAENANATGGLNNWASPAAEAPSNDWAAPADAPPADDWAAPPAAEGAEKPQSGEKRERRGDREEEEDNTLTFDQYLAQQREKENALVPKLDVRKPNDGADDDVFKGAAPLQKDELEYFAAKAKSAPKARTKKDEKVFIEIEARFERPSRGGRGGRGGDRGGGERSRGERGRGRGGRGRGGANGHSAQGASAVNVDDETAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.51
4 0.49
5 0.43
6 0.38
7 0.4
8 0.44
9 0.42
10 0.45
11 0.49
12 0.5
13 0.49
14 0.47
15 0.44
16 0.42
17 0.44
18 0.47
19 0.45
20 0.43
21 0.42
22 0.43
23 0.4
24 0.34
25 0.29
26 0.21
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.1
34 0.09
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.06
39 0.07
40 0.09
41 0.11
42 0.13
43 0.17
44 0.21
45 0.23
46 0.27
47 0.34
48 0.38
49 0.41
50 0.47
51 0.46
52 0.45
53 0.46
54 0.41
55 0.35
56 0.32
57 0.27
58 0.24
59 0.25
60 0.27
61 0.24
62 0.26
63 0.32
64 0.35
65 0.43
66 0.46
67 0.42
68 0.39
69 0.42
70 0.4
71 0.34
72 0.28
73 0.2
74 0.14
75 0.12
76 0.11
77 0.07
78 0.07
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.11
102 0.12
103 0.17
104 0.2
105 0.23
106 0.23
107 0.23
108 0.26
109 0.31
110 0.34
111 0.3
112 0.3
113 0.3
114 0.34
115 0.41
116 0.44
117 0.43
118 0.47
119 0.49
120 0.55
121 0.61
122 0.61
123 0.6
124 0.62
125 0.63
126 0.64
127 0.67
128 0.67
129 0.62
130 0.61
131 0.6
132 0.59
133 0.61
134 0.57
135 0.57
136 0.53
137 0.54
138 0.52
139 0.5
140 0.47
141 0.43
142 0.47
143 0.43
144 0.43
145 0.42
146 0.43
147 0.43
148 0.44
149 0.41
150 0.33
151 0.32
152 0.32
153 0.29
154 0.25
155 0.2
156 0.19
157 0.21
158 0.21
159 0.19
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.09
173 0.08
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.19
223 0.24
224 0.34
225 0.37
226 0.43
227 0.5
228 0.56
229 0.57
230 0.62
231 0.63
232 0.57
233 0.56
234 0.48
235 0.43
236 0.41
237 0.36
238 0.29
239 0.25
240 0.21
241 0.15
242 0.13
243 0.1
244 0.07
245 0.11
246 0.19
247 0.2
248 0.22
249 0.25
250 0.27
251 0.31
252 0.32
253 0.29
254 0.26
255 0.28
256 0.27
257 0.25
258 0.25
259 0.28
260 0.31
261 0.34
262 0.35
263 0.35
264 0.41
265 0.43
266 0.45
267 0.42
268 0.39
269 0.38
270 0.34
271 0.32
272 0.25
273 0.22
274 0.19
275 0.15
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.13
281 0.16
282 0.17
283 0.19
284 0.19
285 0.18
286 0.18
287 0.17
288 0.15
289 0.19
290 0.17
291 0.16
292 0.19
293 0.22
294 0.29
295 0.35
296 0.41
297 0.46
298 0.56
299 0.63
300 0.71
301 0.74
302 0.75
303 0.77
304 0.81
305 0.73
306 0.71
307 0.65
308 0.57
309 0.56
310 0.46
311 0.42
312 0.35
313 0.33
314 0.26
315 0.26
316 0.27
317 0.24
318 0.29
319 0.31
320 0.37
321 0.39
322 0.42
323 0.49
324 0.52
325 0.51
326 0.5
327 0.44
328 0.38
329 0.36
330 0.35
331 0.31
332 0.26
333 0.24
334 0.25
335 0.28
336 0.34
337 0.34
338 0.38
339 0.4
340 0.45
341 0.54
342 0.54
343 0.58
344 0.58
345 0.6
346 0.62
347 0.59
348 0.55
349 0.48
350 0.47
351 0.42
352 0.4
353 0.36
354 0.29
355 0.26
356 0.23
357 0.19
358 0.17
359 0.16
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.1