Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4X095

Protein Details
Accession Q4X095    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-247GSDQNEQPKRKRGGRRPKDDSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-243PKRKRGGRRPK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0017054  C:negative cofactor 2 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001046  F:core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG afm:AFUA_2G14250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MTDQDSTYRPRSPDLSTFQSSIPPAVNSPIYPLASPLAHRASYDASPFFAPQYQQPPAPLGRVPQQYIPPFVDPNSPLSPDMARRSSRLARATEVAPMPEVSYAQPVLSEEPQQLPPPPPQPNPVASIEVKTKFPVARIKRIMQADEDVGKVAQVTPIAVSKALELFMISLVTKAAKEARDRNSKRVTATHLKQAVVKDEVLDFLADIIAKVPDQPAGGRKHDDDGSDQNEQPKRKRGGRRPKDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.49
3 0.47
4 0.47
5 0.43
6 0.44
7 0.39
8 0.33
9 0.27
10 0.21
11 0.18
12 0.2
13 0.21
14 0.17
15 0.21
16 0.23
17 0.22
18 0.21
19 0.21
20 0.2
21 0.19
22 0.2
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.22
29 0.23
30 0.25
31 0.2
32 0.18
33 0.19
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.16
38 0.17
39 0.24
40 0.25
41 0.25
42 0.26
43 0.28
44 0.27
45 0.28
46 0.25
47 0.21
48 0.26
49 0.29
50 0.3
51 0.3
52 0.35
53 0.35
54 0.37
55 0.37
56 0.31
57 0.28
58 0.27
59 0.28
60 0.22
61 0.25
62 0.24
63 0.23
64 0.21
65 0.21
66 0.22
67 0.22
68 0.26
69 0.26
70 0.25
71 0.24
72 0.3
73 0.33
74 0.37
75 0.38
76 0.35
77 0.32
78 0.33
79 0.33
80 0.3
81 0.26
82 0.21
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.1
87 0.1
88 0.07
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.09
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.22
105 0.26
106 0.25
107 0.27
108 0.29
109 0.29
110 0.31
111 0.29
112 0.26
113 0.21
114 0.22
115 0.23
116 0.22
117 0.2
118 0.17
119 0.18
120 0.15
121 0.18
122 0.25
123 0.25
124 0.33
125 0.37
126 0.39
127 0.43
128 0.44
129 0.42
130 0.35
131 0.32
132 0.25
133 0.21
134 0.19
135 0.13
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.1
163 0.12
164 0.18
165 0.25
166 0.34
167 0.45
168 0.48
169 0.56
170 0.6
171 0.6
172 0.58
173 0.55
174 0.54
175 0.53
176 0.53
177 0.54
178 0.5
179 0.48
180 0.48
181 0.45
182 0.42
183 0.34
184 0.31
185 0.22
186 0.19
187 0.19
188 0.16
189 0.14
190 0.09
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.12
203 0.18
204 0.23
205 0.27
206 0.3
207 0.31
208 0.35
209 0.36
210 0.36
211 0.34
212 0.35
213 0.37
214 0.38
215 0.38
216 0.41
217 0.45
218 0.49
219 0.51
220 0.53
221 0.57
222 0.61
223 0.71
224 0.74
225 0.79
226 0.85
227 0.89