Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WAQ0

Protein Details
Accession Q4WAQ0    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-75APAAVAEPERKRKHKHKDHSSKKKRKHDSNLIAETTVHETTSKKSSKSKEKSKQKSSGNAPLPHydrophilic
397-428ALEETPSKKKERKPEKEKKSKASKSKKKKEEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-39ERKRKHKHKDHSSKKKRKH
58-64SKSKEKS
403-428SKKKERKPEKEKKSKASKSKKKKEEK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.666, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG afm:AFUA_7G02080  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MTVDAMDVDSSPAPAAVAEPERKRKHKHKDHSSKKKRKHDSNLIAETTVHETTSKKSSKSKEKSKQKSSGNAPLPSGSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYYSPLQGVILAYSNASISSEPPSASSPSSDPQDNPQPLTLAKSADEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSDWKWVPPGEEEEGNGFNSSGKPKKKVFSSTEDEDDSEPSSHFDPEKEHFKPISLASDANPFSETMDPNNGPAADDDDDDKSAAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDIDVIPGSDRERGFLSIEGTMLSPEEEARVLDDERNGNYSSMTPRPQGQWEPSSTMSGALAGLSSAAPSTADADTGALEETPSKKKERKPEKEKKSKASKSKKKKEEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.11
4 0.17
5 0.24
6 0.32
7 0.42
8 0.51
9 0.59
10 0.68
11 0.73
12 0.79
13 0.82
14 0.86
15 0.87
16 0.9
17 0.94
18 0.96
19 0.97
20 0.96
21 0.96
22 0.96
23 0.95
24 0.94
25 0.94
26 0.94
27 0.93
28 0.92
29 0.89
30 0.8
31 0.7
32 0.59
33 0.51
34 0.44
35 0.33
36 0.23
37 0.17
38 0.16
39 0.19
40 0.28
41 0.3
42 0.29
43 0.37
44 0.47
45 0.57
46 0.66
47 0.74
48 0.75
49 0.82
50 0.89
51 0.91
52 0.91
53 0.87
54 0.87
55 0.83
56 0.83
57 0.8
58 0.72
59 0.63
60 0.55
61 0.48
62 0.41
63 0.33
64 0.23
65 0.16
66 0.14
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.06
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.09
122 0.11
123 0.1
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.16
129 0.14
130 0.16
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.22
135 0.31
136 0.31
137 0.3
138 0.28
139 0.26
140 0.24
141 0.28
142 0.23
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.15
166 0.17
167 0.2
168 0.2
169 0.22
170 0.16
171 0.22
172 0.23
173 0.2
174 0.19
175 0.17
176 0.16
177 0.15
178 0.13
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.02
193 0.03
194 0.04
195 0.05
196 0.08
197 0.08
198 0.11
199 0.12
200 0.14
201 0.19
202 0.22
203 0.3
204 0.34
205 0.37
206 0.39
207 0.38
208 0.38
209 0.33
210 0.32
211 0.25
212 0.2
213 0.16
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.1
219 0.08
220 0.09
221 0.13
222 0.18
223 0.2
224 0.25
225 0.29
226 0.33
227 0.38
228 0.44
229 0.45
230 0.46
231 0.49
232 0.48
233 0.48
234 0.44
235 0.4
236 0.32
237 0.28
238 0.22
239 0.16
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.13
247 0.16
248 0.24
249 0.24
250 0.27
251 0.26
252 0.27
253 0.28
254 0.26
255 0.26
256 0.19
257 0.18
258 0.16
259 0.22
260 0.21
261 0.19
262 0.19
263 0.15
264 0.15
265 0.17
266 0.17
267 0.12
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.19
272 0.17
273 0.15
274 0.14
275 0.16
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.14
294 0.16
295 0.17
296 0.16
297 0.18
298 0.19
299 0.27
300 0.31
301 0.33
302 0.35
303 0.34
304 0.34
305 0.35
306 0.34
307 0.28
308 0.24
309 0.21
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.13
314 0.13
315 0.15
316 0.14
317 0.13
318 0.15
319 0.16
320 0.17
321 0.18
322 0.19
323 0.14
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.08
336 0.1
337 0.11
338 0.13
339 0.17
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.22
344 0.2
345 0.19
346 0.2
347 0.22
348 0.25
349 0.27
350 0.26
351 0.29
352 0.32
353 0.38
354 0.41
355 0.42
356 0.43
357 0.43
358 0.46
359 0.43
360 0.42
361 0.36
362 0.31
363 0.24
364 0.19
365 0.15
366 0.1
367 0.08
368 0.05
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.06
385 0.06
386 0.1
387 0.14
388 0.21
389 0.24
390 0.31
391 0.38
392 0.46
393 0.57
394 0.65
395 0.72
396 0.77
397 0.85
398 0.89
399 0.93
400 0.95
401 0.94
402 0.94
403 0.93
404 0.93
405 0.93
406 0.93
407 0.93
408 0.94