Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0B2J4

Protein Details
Accession A0A0D0B2J4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-168ESDWNPPKKAKKMSKKHRSSGHMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-163PKKAKKMSKKHR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023251  Brr1  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0030532  C:small nuclear ribonucleoprotein complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MISIGLKRKREDTEYDSDDDEPSFGKQILPVANLPMDFDREPEDGLQYLFTVRRDARRLPHVTRVVNPYELPEPVPPPDLVQPDSSGSNLPSELWRSTFLTHFRYFRKNIAQPTIHVHIDPHGSRKAMPDKKERDLWWAFLAGSPESDWNPPKKAKKMSKKHRSSGHMSAYCDEVEVEYDTNNQQNCPETHETWRINSEGDVELAEDNPAGTPSSAAHPRPNGCGLSMSQAETEFRNTSPLSTHPGPEQLCEAREITPSLLRKIDHNLSLHLLMYFAHWMNIHLQHPAEPTFAILESHARWMFALLAKVEDFISADDMSQLRSLARACLELLVRRRKAGGPGVPDNLSSKNGMAETSCWMIFTAVSGIWGQKDLWRDAETLLASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.55
3 0.51
4 0.46
5 0.41
6 0.34
7 0.27
8 0.18
9 0.15
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.13
14 0.18
15 0.21
16 0.23
17 0.22
18 0.23
19 0.25
20 0.24
21 0.25
22 0.21
23 0.22
24 0.19
25 0.19
26 0.21
27 0.19
28 0.21
29 0.19
30 0.2
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.11
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.18
39 0.2
40 0.27
41 0.32
42 0.38
43 0.42
44 0.5
45 0.57
46 0.55
47 0.62
48 0.62
49 0.6
50 0.6
51 0.59
52 0.53
53 0.48
54 0.43
55 0.37
56 0.32
57 0.29
58 0.25
59 0.22
60 0.21
61 0.2
62 0.23
63 0.19
64 0.2
65 0.24
66 0.25
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.23
72 0.21
73 0.17
74 0.14
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.14
80 0.15
81 0.15
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.23
86 0.25
87 0.28
88 0.31
89 0.34
90 0.37
91 0.43
92 0.43
93 0.45
94 0.51
95 0.5
96 0.52
97 0.56
98 0.52
99 0.47
100 0.5
101 0.48
102 0.39
103 0.33
104 0.28
105 0.22
106 0.26
107 0.25
108 0.23
109 0.21
110 0.21
111 0.22
112 0.28
113 0.36
114 0.37
115 0.42
116 0.47
117 0.51
118 0.56
119 0.62
120 0.56
121 0.54
122 0.5
123 0.46
124 0.37
125 0.32
126 0.27
127 0.22
128 0.22
129 0.14
130 0.13
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.13
135 0.15
136 0.17
137 0.21
138 0.27
139 0.33
140 0.4
141 0.48
142 0.56
143 0.64
144 0.72
145 0.78
146 0.83
147 0.86
148 0.85
149 0.84
150 0.8
151 0.76
152 0.73
153 0.71
154 0.64
155 0.56
156 0.49
157 0.42
158 0.36
159 0.29
160 0.2
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.05
166 0.07
167 0.07
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.18
175 0.21
176 0.2
177 0.24
178 0.31
179 0.31
180 0.3
181 0.31
182 0.25
183 0.22
184 0.2
185 0.18
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.09
202 0.12
203 0.14
204 0.16
205 0.2
206 0.21
207 0.24
208 0.26
209 0.22
210 0.19
211 0.19
212 0.17
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.14
221 0.11
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.15
228 0.19
229 0.2
230 0.21
231 0.19
232 0.25
233 0.24
234 0.23
235 0.26
236 0.2
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.15
241 0.16
242 0.16
243 0.14
244 0.17
245 0.18
246 0.19
247 0.2
248 0.19
249 0.2
250 0.26
251 0.29
252 0.28
253 0.28
254 0.27
255 0.27
256 0.27
257 0.25
258 0.19
259 0.15
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.14
268 0.18
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.18
273 0.21
274 0.21
275 0.18
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.17
290 0.17
291 0.18
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.15
297 0.12
298 0.1
299 0.08
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.09
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.16
316 0.19
317 0.23
318 0.31
319 0.38
320 0.39
321 0.39
322 0.42
323 0.41
324 0.45
325 0.48
326 0.45
327 0.43
328 0.47
329 0.51
330 0.48
331 0.46
332 0.43
333 0.36
334 0.31
335 0.25
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.15
342 0.17
343 0.19
344 0.18
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.14
349 0.14
350 0.12
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.14
359 0.19
360 0.2
361 0.24
362 0.25
363 0.26
364 0.25
365 0.29