Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0ABJ3

Protein Details
Accession A0A0D0ABJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-213SSQHLRLHLYHLKRRRRRKRTRNTKSPLRTLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-208LKRRRRRKRTRNTKS
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 9, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFQCHSSYLLPCISRITLTPTHPGCSDVVKKPKLNQHHSFCHAAFDCIDCSTTFHTPAEYQGHTSCVTEAEKYQKTMYKGPRSAGTWGAAPRENGRNGFQSYGGYQARPPNRYQATGANGTPLGTPQRMSPMTVTPPEPSVIPPKPIEAQPPKDSAPAPETTEIKSQKKSKSESKKISLLSSQHLRLHLYHLKRRRRRKRTRNTKSPLRTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.23
4 0.21
5 0.24
6 0.24
7 0.27
8 0.35
9 0.33
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.29
14 0.31
15 0.35
16 0.35
17 0.43
18 0.47
19 0.5
20 0.55
21 0.62
22 0.65
23 0.68
24 0.69
25 0.67
26 0.69
27 0.7
28 0.69
29 0.6
30 0.57
31 0.48
32 0.4
33 0.32
34 0.26
35 0.22
36 0.17
37 0.18
38 0.11
39 0.12
40 0.15
41 0.16
42 0.16
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.2
47 0.22
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.16
55 0.13
56 0.14
57 0.12
58 0.13
59 0.19
60 0.2
61 0.22
62 0.24
63 0.25
64 0.28
65 0.35
66 0.42
67 0.43
68 0.44
69 0.44
70 0.46
71 0.44
72 0.43
73 0.37
74 0.29
75 0.22
76 0.21
77 0.21
78 0.19
79 0.17
80 0.18
81 0.21
82 0.21
83 0.2
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.22
88 0.19
89 0.15
90 0.14
91 0.18
92 0.17
93 0.13
94 0.14
95 0.19
96 0.23
97 0.25
98 0.25
99 0.28
100 0.29
101 0.3
102 0.3
103 0.29
104 0.29
105 0.29
106 0.28
107 0.22
108 0.2
109 0.19
110 0.17
111 0.13
112 0.11
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.17
121 0.2
122 0.22
123 0.23
124 0.18
125 0.18
126 0.18
127 0.17
128 0.15
129 0.2
130 0.2
131 0.22
132 0.21
133 0.23
134 0.25
135 0.26
136 0.33
137 0.33
138 0.38
139 0.39
140 0.42
141 0.41
142 0.41
143 0.4
144 0.34
145 0.3
146 0.26
147 0.25
148 0.25
149 0.25
150 0.25
151 0.33
152 0.36
153 0.36
154 0.41
155 0.45
156 0.49
157 0.55
158 0.59
159 0.62
160 0.67
161 0.74
162 0.75
163 0.75
164 0.75
165 0.7
166 0.68
167 0.63
168 0.55
169 0.52
170 0.49
171 0.47
172 0.43
173 0.42
174 0.4
175 0.35
176 0.4
177 0.4
178 0.41
179 0.46
180 0.52
181 0.62
182 0.7
183 0.8
184 0.84
185 0.87
186 0.91
187 0.93
188 0.95
189 0.95
190 0.97
191 0.97
192 0.95
193 0.95