Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WDC4

Protein Details
Accession Q4WDC4    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-314DEETKKPKPGAKRKRAAPQVKPRKRGPRVEIEYETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-161RKIAKEEERLGEKIVPKLAPKIRRREETRERKAESA
284-307KKPKPGAKRKRAAPQVKPRKRGPR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 3, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR006958  Mak16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG afm:AFUA_6G04260  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04874  Mak16  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MSSDEIVWQVINQQFCSYKLKTTKGQNFCRNEYNVSGLCNRQSCPLANSRYATVRSDPETGVMYLYMKTIERAHMPSKLWERIRLSSNYAKALEQLDERLIYWPKFLIHKCKQRLTRLTQVAIRMRKIAKEEERLGEKIVPKLAPKIRRREETRERKAESAAKVERAIERELIERLRSGAYGDRPLNVEEGIWKKVLRGLERTGEGERDEDLDDGEEIEDEEEEGVGEVEYVSDLEDDEDLEDIEDWLGGDSADDSSDYDDDEEDEDSDEESGSEEASSDEETKKPKPGAKRKRAAPQVKPRKRGPRVEIEYETEGAGKESILA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.33
4 0.28
5 0.33
6 0.39
7 0.44
8 0.48
9 0.57
10 0.65
11 0.68
12 0.77
13 0.78
14 0.77
15 0.77
16 0.77
17 0.69
18 0.63
19 0.55
20 0.51
21 0.43
22 0.39
23 0.37
24 0.32
25 0.34
26 0.32
27 0.31
28 0.29
29 0.31
30 0.3
31 0.31
32 0.37
33 0.37
34 0.39
35 0.4
36 0.38
37 0.41
38 0.4
39 0.39
40 0.34
41 0.33
42 0.32
43 0.33
44 0.3
45 0.26
46 0.26
47 0.23
48 0.2
49 0.16
50 0.13
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.13
58 0.16
59 0.2
60 0.23
61 0.27
62 0.28
63 0.33
64 0.38
65 0.44
66 0.42
67 0.44
68 0.46
69 0.46
70 0.5
71 0.45
72 0.44
73 0.43
74 0.44
75 0.41
76 0.38
77 0.33
78 0.3
79 0.29
80 0.24
81 0.19
82 0.17
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.22
93 0.24
94 0.3
95 0.37
96 0.46
97 0.52
98 0.6
99 0.65
100 0.68
101 0.73
102 0.7
103 0.7
104 0.65
105 0.62
106 0.56
107 0.55
108 0.53
109 0.48
110 0.42
111 0.37
112 0.33
113 0.32
114 0.32
115 0.34
116 0.33
117 0.36
118 0.38
119 0.38
120 0.4
121 0.39
122 0.37
123 0.33
124 0.29
125 0.24
126 0.24
127 0.21
128 0.17
129 0.24
130 0.28
131 0.34
132 0.38
133 0.47
134 0.51
135 0.58
136 0.63
137 0.66
138 0.71
139 0.73
140 0.77
141 0.74
142 0.7
143 0.63
144 0.6
145 0.56
146 0.47
147 0.43
148 0.35
149 0.29
150 0.27
151 0.27
152 0.25
153 0.22
154 0.21
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.13
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.18
174 0.15
175 0.13
176 0.12
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.16
183 0.19
184 0.18
185 0.19
186 0.21
187 0.24
188 0.26
189 0.27
190 0.26
191 0.23
192 0.21
193 0.17
194 0.15
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.09
266 0.1
267 0.12
268 0.15
269 0.2
270 0.23
271 0.29
272 0.34
273 0.38
274 0.47
275 0.56
276 0.64
277 0.71
278 0.78
279 0.79
280 0.85
281 0.9
282 0.89
283 0.88
284 0.88
285 0.89
286 0.89
287 0.88
288 0.87
289 0.88
290 0.87
291 0.87
292 0.83
293 0.83
294 0.81
295 0.82
296 0.76
297 0.71
298 0.65
299 0.56
300 0.48
301 0.37
302 0.29
303 0.22
304 0.18