FuNGI

A0A0D0B0Y4

Protein Details

Accession

A0A0D0B0Y4

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
497-527	TISRPRDESKEDKKARKQAVKAERQVRRIEK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
275-277	RRR
506-527	KEDKKARKQAVKAERQVRRIEK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPKKSIFRQPGAQHFQLVHRSQRDPLIHDPDASQHVLKAFVRGNDKKGKTRADLESLLSPDDVAHDAHAHVGEASLYGVYFDDTEYDYMQHLRTAGAEEEGVESVLIEAPATSQKSKGKGKSKDPISLRDLPPEALPSASEIPRNYESHEAIPSSIAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDDGLEDDFFGELVAEGQRDEDDEFNYQFFEDGDTAQDAPSTEDHEDPDSWEARFAQFKKEQQDVPPPSDSDDELHSDGGDTIGTLPKLPVIGGKRRRKGTSDASGYSMSSSSMYRTETLMTLDERFDQLMENEYGSGEGEEVEEENDDLSSELSDEAPELVTSREDFEAMMDDFMDNYELLGRKLKPVLPGDSGPEKLNTLRQAMGQDERVRIRSADDDDDELDDDRLFAGYNAAEKEDTWDCETVLTTYSNLENHPRVIRARALKPVPKITLDPKTGLPTVNSDREAAESRKGRQRLQAVAEDEQDSQEPSVVKQTISRPRDESKEDKKARKQAVKAERQVRRIEKKATQEQFSTEMKHQAQGLANKAQSSRTRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.55
3	0.55
4	0.51
5	0.49
6	0.46
7	0.47
8	0.47
9	0.53
10	0.51
11	0.47
12	0.52
13	0.52
14	0.48
15	0.46
16	0.44
17	0.4
18	0.4
19	0.37
20	0.29
21	0.22
22	0.21
23	0.25
24	0.24
25	0.25
26	0.25
27	0.28
28	0.38
29	0.4
30	0.46
31	0.52
32	0.57
33	0.6
34	0.64
35	0.65
36	0.61
37	0.65
38	0.63
39	0.6
40	0.58
41	0.52
42	0.5
43	0.44
44	0.39
45	0.31
46	0.25
47	0.18
48	0.17
49	0.15
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.12
55	0.12
56	0.1
57	0.09
58	0.09
59	0.08
60	0.07
61	0.07
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.06
68	0.05
69	0.06
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.13
76	0.13
77	0.13
78	0.12
79	0.11
80	0.11
81	0.13
82	0.13
83	0.12
84	0.11
85	0.11
86	0.12
87	0.12
88	0.11
89	0.08
90	0.07
91	0.06
92	0.07
93	0.06
94	0.05
95	0.05
96	0.06
97	0.1
98	0.13
99	0.13
100	0.17
101	0.21
102	0.29
103	0.38
104	0.46
105	0.52
106	0.58
107	0.66
108	0.71
109	0.73
110	0.74
111	0.7
112	0.68
113	0.65
114	0.65
115	0.57
116	0.54
117	0.5
118	0.42
119	0.39
120	0.34
121	0.27
122	0.18
123	0.17
124	0.14
125	0.17
126	0.17
127	0.19
128	0.17
129	0.22
130	0.26
131	0.27
132	0.26
133	0.27
134	0.27
135	0.27
136	0.29
137	0.23
138	0.2
139	0.19
140	0.17
141	0.13
142	0.12
143	0.1
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.1
148	0.1
149	0.12
150	0.12
151	0.13
152	0.13
153	0.17
154	0.17
155	0.15
156	0.16
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.13
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.07
166	0.05
167	0.05
168	0.03
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.03
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.03
178	0.03
179	0.04
180	0.05
181	0.04
182	0.04
183	0.05
184	0.05
185	0.06
186	0.07
187	0.07
188	0.08
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.09
195	0.08
196	0.09
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.08
203	0.09
204	0.07
205	0.08
206	0.08
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.12
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.15
215	0.14
216	0.12
217	0.13
218	0.12
219	0.12
220	0.18
221	0.17
222	0.22
223	0.26
224	0.3
225	0.34
226	0.38
227	0.38
228	0.36
229	0.45
230	0.41
231	0.4
232	0.38
233	0.33
234	0.31
235	0.3
236	0.27
237	0.18
238	0.16
239	0.14
240	0.13
241	0.13
242	0.11
243	0.1
244	0.09
245	0.08
246	0.06
247	0.04
248	0.04
249	0.06
250	0.06
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.09
257	0.11
258	0.21
259	0.3
260	0.39
261	0.45
262	0.49
263	0.51
264	0.51
265	0.53
266	0.52
267	0.51
268	0.48
269	0.43
270	0.41
271	0.4
272	0.36
273	0.3
274	0.22
275	0.14
276	0.09
277	0.08
278	0.07
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.1
284	0.1
285	0.1
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.07
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.04
344	0.04
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.13
349	0.13
350	0.15
351	0.18
352	0.21
353	0.24
354	0.27
355	0.3
356	0.29
357	0.29
358	0.31
359	0.32
360	0.31
361	0.26
362	0.24
363	0.21
364	0.19
365	0.22
366	0.2
367	0.18
368	0.18
369	0.19
370	0.2
371	0.21
372	0.23
373	0.23
374	0.25
375	0.26
376	0.27
377	0.28
378	0.27
379	0.24
380	0.24
381	0.23
382	0.23
383	0.23
384	0.22
385	0.22
386	0.22
387	0.22
388	0.21
389	0.17
390	0.14
391	0.1
392	0.09
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.15
405	0.16
406	0.18
407	0.18
408	0.18
409	0.16
410	0.17
411	0.18
412	0.14
413	0.13
414	0.11
415	0.09
416	0.1
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.18
421	0.18
422	0.21
423	0.23
424	0.25
425	0.25
426	0.28
427	0.33
428	0.36
429	0.38
430	0.43
431	0.48
432	0.51
433	0.55
434	0.58
435	0.54
436	0.49
437	0.49
438	0.48
439	0.49
440	0.46
441	0.43
442	0.38
443	0.4
444	0.39
445	0.36
446	0.3
447	0.28
448	0.31
449	0.34
450	0.33
451	0.29
452	0.28
453	0.3
454	0.34
455	0.29
456	0.32
457	0.31
458	0.36
459	0.45
460	0.48
461	0.48
462	0.51
463	0.55
464	0.55
465	0.56
466	0.56
467	0.52
468	0.51
469	0.5
470	0.44
471	0.37
472	0.31
473	0.26
474	0.2
475	0.16
476	0.16
477	0.14
478	0.12
479	0.19
480	0.19
481	0.19
482	0.23
483	0.32
484	0.4
485	0.43
486	0.47
487	0.45
488	0.49
489	0.56
490	0.58
491	0.59
492	0.59
493	0.67
494	0.71
495	0.76
496	0.8
497	0.82
498	0.86
499	0.85
500	0.81
501	0.81
502	0.82
503	0.83
504	0.83
505	0.84
506	0.81
507	0.78
508	0.8
509	0.8
510	0.78
511	0.76
512	0.75
513	0.72
514	0.74
515	0.79
516	0.76
517	0.71
518	0.64
519	0.6
520	0.57
521	0.53
522	0.48
523	0.41
524	0.43
525	0.39
526	0.39
527	0.37
528	0.36
529	0.4
530	0.4
531	0.43
532	0.41
533	0.41
534	0.41
535	0.41
536	0.43
537	0.45

A0A0D0B0Y4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer