Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0BBC2

Protein Details
Accession A0A0D0BBC2    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-44YVGRAMGMDKPKKRKSKKTKKRAGSHSPDPSEDBasic
71-105SESSDKATKRSSKRRAKKRKARKTKNTLKPIPPVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-35KPKKRKSKKTKKRAG
77-96ATKRSSKRRAKKRKARKTKN
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 12.832, cyto_nucl 12.333, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MEPIQQVAPRSYVGRAMGMDKPKKRKSKKTKKRAGSHSPDPSEDEPSSSSTSESSSSESSESSSSDETDSSESSDKATKRSSKRRAKKRKARKTKNTLKPIPPVNYDGAPDSRAFHQFLTEGTAYVKDGQVERKRRVFILAHYLKGRAREFYTREVSGDPYRWRLRKFFTELFNHCFPIDFRMRQREKLNRCYQNEKSVREYIYELSELWNMIGDVPERQKVTRLWTGFKPEIQTELWKKELNPESSTFREVSNAAEIIEIAHSVPISWMTWPGGSTPHPQMPRSCAETHTYSSSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.23
4 0.28
5 0.35
6 0.43
7 0.47
8 0.56
9 0.63
10 0.72
11 0.78
12 0.83
13 0.86
14 0.89
15 0.92
16 0.93
17 0.94
18 0.94
19 0.95
20 0.94
21 0.93
22 0.91
23 0.9
24 0.89
25 0.81
26 0.72
27 0.68
28 0.59
29 0.54
30 0.45
31 0.37
32 0.28
33 0.27
34 0.28
35 0.22
36 0.21
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.16
42 0.14
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.14
61 0.2
62 0.19
63 0.21
64 0.28
65 0.34
66 0.42
67 0.53
68 0.62
69 0.68
70 0.77
71 0.85
72 0.9
73 0.92
74 0.93
75 0.94
76 0.95
77 0.95
78 0.96
79 0.96
80 0.95
81 0.95
82 0.95
83 0.94
84 0.91
85 0.85
86 0.81
87 0.77
88 0.7
89 0.62
90 0.55
91 0.46
92 0.38
93 0.33
94 0.28
95 0.22
96 0.19
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.16
107 0.14
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.08
115 0.09
116 0.17
117 0.24
118 0.31
119 0.35
120 0.39
121 0.39
122 0.39
123 0.42
124 0.35
125 0.3
126 0.34
127 0.32
128 0.29
129 0.29
130 0.3
131 0.27
132 0.29
133 0.28
134 0.19
135 0.19
136 0.22
137 0.24
138 0.28
139 0.31
140 0.27
141 0.27
142 0.26
143 0.26
144 0.23
145 0.24
146 0.2
147 0.23
148 0.28
149 0.31
150 0.32
151 0.32
152 0.35
153 0.38
154 0.44
155 0.43
156 0.43
157 0.47
158 0.49
159 0.51
160 0.48
161 0.42
162 0.34
163 0.3
164 0.24
165 0.23
166 0.24
167 0.22
168 0.25
169 0.35
170 0.37
171 0.42
172 0.5
173 0.53
174 0.56
175 0.62
176 0.68
177 0.66
178 0.69
179 0.72
180 0.67
181 0.68
182 0.67
183 0.61
184 0.56
185 0.52
186 0.48
187 0.41
188 0.39
189 0.3
190 0.26
191 0.23
192 0.18
193 0.15
194 0.15
195 0.13
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.09
203 0.12
204 0.15
205 0.16
206 0.17
207 0.2
208 0.21
209 0.28
210 0.32
211 0.32
212 0.33
213 0.37
214 0.45
215 0.43
216 0.44
217 0.41
218 0.34
219 0.34
220 0.31
221 0.35
222 0.33
223 0.35
224 0.36
225 0.35
226 0.34
227 0.41
228 0.47
229 0.43
230 0.41
231 0.4
232 0.43
233 0.44
234 0.46
235 0.37
236 0.3
237 0.28
238 0.24
239 0.23
240 0.2
241 0.18
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.12
246 0.12
247 0.1
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.16
262 0.18
263 0.23
264 0.28
265 0.34
266 0.37
267 0.4
268 0.43
269 0.45
270 0.48
271 0.48
272 0.44
273 0.38
274 0.4
275 0.42
276 0.42