Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WJT7

Protein Details
Accession Q4WJT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-116STAGKALKRKRDGDNTQKDPHydrophilic
162-187SEKVEEHSHKQRKKPRVDDVPKAAHDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-90EKHRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto 10, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034482  Mrd1_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003730  F:mRNA 3'-UTR binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:0008266  F:poly(U) RNA binding  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
KEGG afm:AFUA_1G04840  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12566  RRM2_MRD1  
cd12568  RRM3_MRD1  
cd12570  RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MENTRVFVSGLPPTFTNDQLRMHFSSRFQITDAHVLPKRRIGFVGFKSSEAAQQAASYFNKTYVKMSKISVEIAKPIDSEPVKKAEKHRKGSTSNDSTAGKALKRKRDGDNTQKDPQLQEYLSVIERPSKTKTWANGDDFLNTIQNQPATSELREEQRDDTSEKVEEHSHKQRKKPRVDDVPKAAHDREPEPMVLDKTEEEHERANADGQVEAIPPTQEEAEPVSDADWLRSKTSRLLGLLDEDEQAEFDSTAQRKPDPSSEPETVSKAGAQHSDDDKAAVESSVEEEEVDTNIEHIRLSSRLFVRNLPYDASESDLEPVFSKFGKIEEIHVAFDTRSTTSKGFAYVQYIEPDAAVQAYKELDGKHFQGRLMHILPATAKKTYKIDEHELSKLPLKKQKQIKRKLEASSSTFSWNSLYMNTDAVMSSVAERLGVSKADLLDPTSADAAVKQAHAETHVIQETKAYFTANGVNLDAFKQRERGNTAILVKNFSYGVKVDDLRKLFEPYGQITRLLMPPSGTIAIVEFARPDEAQKAFKGLAYRKVGDSILFLEKAPANLFDATTAPQTSVLETKAVSQGFSTADTFAAEDGDEPVVTSTLFVKNLNFSTTNERFTEVFKPLDGFVSARIKTKPDPKRPGKTLSMGFGFVDFRTKAQAQAALAAMDGYKLDQHELVVRASNKAMDAAEERRREDTAKKIAARRTKIIIKNLPFQATKKDVRSLFGAYGQLRSVRVPKKFDRSARGFGFADFVSAREAENAMDALKNTHLLGRRLVLEFANEEAVDPEQEIEQIEKKVGEQLDRVKLQKLTGTGRKKFTVGAQEDEEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.35
4 0.32
5 0.35
6 0.36
7 0.41
8 0.4
9 0.41
10 0.41
11 0.37
12 0.41
13 0.4
14 0.38
15 0.33
16 0.33
17 0.34
18 0.39
19 0.39
20 0.39
21 0.4
22 0.42
23 0.44
24 0.47
25 0.46
26 0.39
27 0.39
28 0.36
29 0.41
30 0.43
31 0.51
32 0.45
33 0.43
34 0.43
35 0.42
36 0.4
37 0.33
38 0.27
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.2
43 0.2
44 0.19
45 0.18
46 0.22
47 0.26
48 0.25
49 0.31
50 0.34
51 0.37
52 0.36
53 0.38
54 0.38
55 0.37
56 0.4
57 0.39
58 0.33
59 0.34
60 0.33
61 0.31
62 0.26
63 0.25
64 0.29
65 0.26
66 0.28
67 0.27
68 0.33
69 0.36
70 0.4
71 0.5
72 0.53
73 0.61
74 0.67
75 0.72
76 0.73
77 0.75
78 0.79
79 0.8
80 0.76
81 0.69
82 0.65
83 0.57
84 0.49
85 0.47
86 0.42
87 0.35
88 0.35
89 0.41
90 0.45
91 0.52
92 0.57
93 0.62
94 0.68
95 0.75
96 0.78
97 0.81
98 0.78
99 0.77
100 0.75
101 0.68
102 0.59
103 0.53
104 0.48
105 0.37
106 0.32
107 0.26
108 0.25
109 0.24
110 0.23
111 0.2
112 0.21
113 0.22
114 0.24
115 0.28
116 0.29
117 0.33
118 0.38
119 0.44
120 0.47
121 0.53
122 0.55
123 0.56
124 0.54
125 0.5
126 0.44
127 0.39
128 0.32
129 0.24
130 0.21
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.2
139 0.21
140 0.27
141 0.29
142 0.3
143 0.28
144 0.29
145 0.31
146 0.29
147 0.29
148 0.25
149 0.25
150 0.24
151 0.23
152 0.26
153 0.27
154 0.33
155 0.42
156 0.49
157 0.53
158 0.62
159 0.69
160 0.73
161 0.79
162 0.8
163 0.8
164 0.82
165 0.84
166 0.84
167 0.83
168 0.81
169 0.73
170 0.69
171 0.6
172 0.52
173 0.47
174 0.39
175 0.35
176 0.29
177 0.26
178 0.23
179 0.25
180 0.23
181 0.2
182 0.19
183 0.15
184 0.15
185 0.19
186 0.18
187 0.17
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.16
194 0.14
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.17
218 0.19
219 0.2
220 0.22
221 0.25
222 0.27
223 0.23
224 0.24
225 0.22
226 0.23
227 0.23
228 0.19
229 0.16
230 0.13
231 0.12
232 0.1
233 0.1
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.12
238 0.13
239 0.15
240 0.17
241 0.18
242 0.19
243 0.22
244 0.28
245 0.27
246 0.31
247 0.35
248 0.36
249 0.38
250 0.38
251 0.38
252 0.32
253 0.28
254 0.24
255 0.19
256 0.18
257 0.17
258 0.16
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.19
263 0.18
264 0.16
265 0.15
266 0.14
267 0.09
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.14
288 0.16
289 0.21
290 0.22
291 0.25
292 0.27
293 0.3
294 0.31
295 0.26
296 0.24
297 0.21
298 0.2
299 0.21
300 0.17
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.18
316 0.19
317 0.19
318 0.19
319 0.19
320 0.15
321 0.16
322 0.14
323 0.09
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.17
333 0.16
334 0.17
335 0.17
336 0.16
337 0.14
338 0.12
339 0.12
340 0.08
341 0.06
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.11
351 0.14
352 0.17
353 0.18
354 0.19
355 0.2
356 0.21
357 0.23
358 0.22
359 0.21
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.17
364 0.17
365 0.15
366 0.14
367 0.14
368 0.17
369 0.19
370 0.22
371 0.24
372 0.28
373 0.3
374 0.32
375 0.34
376 0.33
377 0.31
378 0.32
379 0.31
380 0.29
381 0.32
382 0.32
383 0.37
384 0.45
385 0.53
386 0.59
387 0.66
388 0.71
389 0.73
390 0.76
391 0.72
392 0.67
393 0.63
394 0.57
395 0.48
396 0.4
397 0.34
398 0.28
399 0.24
400 0.19
401 0.15
402 0.12
403 0.09
404 0.1
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.08
443 0.1
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.1
452 0.08
453 0.09
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.13
461 0.14
462 0.11
463 0.1
464 0.14
465 0.15
466 0.19
467 0.23
468 0.24
469 0.23
470 0.26
471 0.3
472 0.31
473 0.29
474 0.28
475 0.23
476 0.22
477 0.21
478 0.16
479 0.13
480 0.09
481 0.11
482 0.11
483 0.13
484 0.15
485 0.19
486 0.2
487 0.21
488 0.22
489 0.23
490 0.21
491 0.21
492 0.21
493 0.19
494 0.23
495 0.22
496 0.2
497 0.18
498 0.2
499 0.2
500 0.19
501 0.16
502 0.12
503 0.11
504 0.13
505 0.13
506 0.1
507 0.08
508 0.07
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.05
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.1
518 0.13
519 0.15
520 0.15
521 0.17
522 0.16
523 0.18
524 0.22
525 0.22
526 0.28
527 0.31
528 0.32
529 0.3
530 0.32
531 0.3
532 0.25
533 0.23
534 0.18
535 0.16
536 0.15
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.15
541 0.15
542 0.12
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.1
547 0.1
548 0.11
549 0.12
550 0.11
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.12
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.12
564 0.13
565 0.13
566 0.14
567 0.13
568 0.09
569 0.1
570 0.1
571 0.1
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.07
585 0.09
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.15
590 0.16
591 0.19
592 0.18
593 0.18
594 0.26
595 0.28
596 0.31
597 0.28
598 0.29
599 0.27
600 0.28
601 0.31
602 0.25
603 0.23
604 0.2
605 0.21
606 0.19
607 0.2
608 0.18
609 0.13
610 0.15
611 0.21
612 0.22
613 0.24
614 0.25
615 0.27
616 0.32
617 0.41
618 0.47
619 0.51
620 0.61
621 0.67
622 0.76
623 0.78
624 0.8
625 0.76
626 0.72
627 0.65
628 0.59
629 0.51
630 0.42
631 0.36
632 0.3
633 0.25
634 0.18
635 0.2
636 0.15
637 0.13
638 0.18
639 0.18
640 0.19
641 0.2
642 0.23
643 0.19
644 0.22
645 0.22
646 0.16
647 0.16
648 0.14
649 0.11
650 0.08
651 0.08
652 0.05
653 0.06
654 0.06
655 0.08
656 0.08
657 0.09
658 0.13
659 0.15
660 0.16
661 0.2
662 0.21
663 0.21
664 0.22
665 0.22
666 0.17
667 0.17
668 0.16
669 0.13
670 0.16
671 0.21
672 0.29
673 0.31
674 0.33
675 0.33
676 0.35
677 0.35
678 0.36
679 0.39
680 0.4
681 0.45
682 0.49
683 0.54
684 0.61
685 0.67
686 0.67
687 0.63
688 0.61
689 0.63
690 0.63
691 0.66
692 0.67
693 0.63
694 0.66
695 0.66
696 0.63
697 0.56
698 0.52
699 0.5
700 0.49
701 0.5
702 0.46
703 0.49
704 0.45
705 0.45
706 0.47
707 0.42
708 0.36
709 0.33
710 0.34
711 0.27
712 0.28
713 0.27
714 0.25
715 0.22
716 0.23
717 0.29
718 0.31
719 0.36
720 0.42
721 0.49
722 0.57
723 0.65
724 0.69
725 0.71
726 0.71
727 0.73
728 0.69
729 0.67
730 0.58
731 0.49
732 0.45
733 0.34
734 0.3
735 0.21
736 0.18
737 0.15
738 0.14
739 0.14
740 0.12
741 0.13
742 0.1
743 0.11
744 0.11
745 0.1
746 0.11
747 0.11
748 0.11
749 0.12
750 0.13
751 0.12
752 0.16
753 0.21
754 0.22
755 0.25
756 0.27
757 0.3
758 0.3
759 0.31
760 0.27
761 0.24
762 0.23
763 0.22
764 0.2
765 0.16
766 0.15
767 0.14
768 0.15
769 0.13
770 0.12
771 0.11
772 0.09
773 0.1
774 0.1
775 0.12
776 0.15
777 0.16
778 0.18
779 0.17
780 0.18
781 0.24
782 0.25
783 0.26
784 0.28
785 0.35
786 0.42
787 0.47
788 0.48
789 0.47
790 0.47
791 0.45
792 0.44
793 0.41
794 0.41
795 0.46
796 0.54
797 0.56
798 0.6
799 0.61
800 0.58
801 0.55
802 0.52
803 0.53
804 0.48
805 0.46