Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8NKF4

Protein Details
Accession Q8NKF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-42SLAFLPRKRAARHRGKVKSFPKDDPKKPVHBasic
111-140SDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYAKKHAEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-39PRKRAARHRGKVKSFPKDDPKK
126-128KKK
238-245KLPRKTHK
Subcellular Location(s) mito 20.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045077  L3_arc_euk  
IPR000597  Ribosomal_L3  
IPR019926  Ribosomal_L3_CS  
IPR044892  Ribosomal_L3_dom_3_arc_sf  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG afm:AFUA_2G11850  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00297  Ribosomal_L3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00474  RIBOSOMAL_L3  
Amino Acid Sequences MSHRKYEAPRHGSLAFLPRKRAARHRGKVKSFPKDDPKKPVHLTASMGYKAGMTTVVRDLDRPGAKMHKKEIVEAVTIIETPPLVAVGVVGYIETPRGLRSLTTVWAEHLSDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYAKKHAEENGASITRELERIKKYCTVVRVLAHTQIRKTPLKQKKAHLMEIQVNGGSVADKVDFARNLFEKPIEIDSIFEKDEMIDVIAVTKGHGFQGVTSRWGTKKLPRKTHKGLRKVACIGAWHPSHVQWTVARAGQMGYHHRTSCNHKVFRIGKGSDEGNASTDFDISKKQITPMGGFVRYGEVKNDYIMVKGSVPGVKKRVMTLRKTLYPQTSRRATEKVELKWIDTSSKFGHGAFQTPEEKRAFMGTLKKDLVTSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.42
4 0.45
5 0.46
6 0.53
7 0.58
8 0.64
9 0.64
10 0.67
11 0.73
12 0.79
13 0.83
14 0.84
15 0.88
16 0.88
17 0.88
18 0.83
19 0.82
20 0.82
21 0.82
22 0.82
23 0.81
24 0.78
25 0.76
26 0.73
27 0.72
28 0.66
29 0.59
30 0.55
31 0.5
32 0.5
33 0.42
34 0.38
35 0.3
36 0.25
37 0.21
38 0.18
39 0.15
40 0.09
41 0.11
42 0.14
43 0.17
44 0.17
45 0.18
46 0.2
47 0.26
48 0.28
49 0.26
50 0.27
51 0.33
52 0.4
53 0.44
54 0.47
55 0.46
56 0.45
57 0.47
58 0.49
59 0.42
60 0.38
61 0.33
62 0.29
63 0.22
64 0.21
65 0.18
66 0.11
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.03
75 0.04
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.1
88 0.12
89 0.15
90 0.17
91 0.17
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.16
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.2
100 0.22
101 0.25
102 0.28
103 0.31
104 0.34
105 0.43
106 0.51
107 0.54
108 0.62
109 0.67
110 0.74
111 0.8
112 0.87
113 0.87
114 0.86
115 0.86
116 0.85
117 0.85
118 0.87
119 0.88
120 0.88
121 0.86
122 0.78
123 0.74
124 0.7
125 0.68
126 0.57
127 0.5
128 0.44
129 0.37
130 0.35
131 0.29
132 0.24
133 0.15
134 0.17
135 0.16
136 0.17
137 0.21
138 0.23
139 0.26
140 0.3
141 0.32
142 0.32
143 0.34
144 0.32
145 0.31
146 0.3
147 0.32
148 0.28
149 0.31
150 0.32
151 0.31
152 0.28
153 0.27
154 0.31
155 0.3
156 0.32
157 0.37
158 0.42
159 0.51
160 0.55
161 0.58
162 0.63
163 0.65
164 0.67
165 0.59
166 0.54
167 0.5
168 0.45
169 0.4
170 0.3
171 0.24
172 0.18
173 0.15
174 0.11
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.18
220 0.18
221 0.22
222 0.23
223 0.25
224 0.34
225 0.42
226 0.52
227 0.56
228 0.65
229 0.71
230 0.79
231 0.8
232 0.79
233 0.79
234 0.75
235 0.75
236 0.68
237 0.6
238 0.52
239 0.44
240 0.36
241 0.33
242 0.28
243 0.22
244 0.2
245 0.19
246 0.2
247 0.19
248 0.2
249 0.13
250 0.16
251 0.17
252 0.17
253 0.16
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.16
258 0.19
259 0.21
260 0.24
261 0.24
262 0.26
263 0.3
264 0.36
265 0.44
266 0.48
267 0.46
268 0.44
269 0.53
270 0.54
271 0.57
272 0.57
273 0.47
274 0.4
275 0.4
276 0.39
277 0.32
278 0.3
279 0.24
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.13
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.2
293 0.22
294 0.24
295 0.27
296 0.31
297 0.28
298 0.27
299 0.26
300 0.27
301 0.27
302 0.26
303 0.21
304 0.19
305 0.19
306 0.2
307 0.22
308 0.17
309 0.16
310 0.17
311 0.15
312 0.13
313 0.13
314 0.16
315 0.16
316 0.19
317 0.24
318 0.27
319 0.3
320 0.3
321 0.34
322 0.42
323 0.46
324 0.49
325 0.53
326 0.58
327 0.6
328 0.64
329 0.65
330 0.64
331 0.65
332 0.65
333 0.64
334 0.64
335 0.62
336 0.62
337 0.6
338 0.54
339 0.55
340 0.57
341 0.52
342 0.53
343 0.5
344 0.48
345 0.48
346 0.45
347 0.43
348 0.35
349 0.36
350 0.29
351 0.34
352 0.32
353 0.28
354 0.33
355 0.29
356 0.33
357 0.31
358 0.34
359 0.36
360 0.37
361 0.43
362 0.38
363 0.37
364 0.32
365 0.33
366 0.29
367 0.27
368 0.35
369 0.34
370 0.4
371 0.41
372 0.41