Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WXW4

Protein Details
Accession Q4WXW4    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-274EAYIKGKEEKAKREKQRKEKNVLEVDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-76PAPRHGKRDAPKEPA
252-267KGKEEKAKREKQRKEK
280-307PRGGSAGRGRGGRGGRGGRGGRGNGAPR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG afm:AFUA_3G10920  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKKRETNWGGVRFELSIDSAGQKKRSKQHNLYELLGNDPELDPNREPEPPTRAVDRPAPRHGKRDAPKEPATKPNLHENNARRGSRFTGNEAAFRDRQAGSRNNREKPLDEGKEPQRRAFHARGDRGERYRNDRQSRTGQVDTRKQVNQGWGAQTGDKAGDKAWDDERAAENLAQNESEPQTPANEEPAEPAEKTKTYAEYLAEKAAQGDLAAKPIRAPNEGSNLDKKWANAKELKRTPEEEEAYIKGKEEKAKREKQRKEKNVLEVDMRFVESPRGGSAGRGRGGRGGRGGRGGRGNGAPRGEQQQRGAPPVTVDEKNFPSLGAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.62
3 0.56
4 0.46
5 0.39
6 0.3
7 0.21
8 0.14
9 0.13
10 0.15
11 0.19
12 0.23
13 0.3
14 0.35
15 0.41
16 0.49
17 0.58
18 0.66
19 0.7
20 0.76
21 0.78
22 0.78
23 0.73
24 0.7
25 0.61
26 0.53
27 0.44
28 0.34
29 0.25
30 0.2
31 0.21
32 0.18
33 0.22
34 0.19
35 0.22
36 0.24
37 0.26
38 0.28
39 0.29
40 0.33
41 0.33
42 0.35
43 0.37
44 0.37
45 0.38
46 0.45
47 0.48
48 0.49
49 0.54
50 0.61
51 0.58
52 0.63
53 0.63
54 0.64
55 0.64
56 0.67
57 0.65
58 0.64
59 0.68
60 0.68
61 0.69
62 0.68
63 0.65
64 0.6
65 0.55
66 0.58
67 0.56
68 0.53
69 0.56
70 0.52
71 0.57
72 0.59
73 0.57
74 0.48
75 0.45
76 0.46
77 0.46
78 0.43
79 0.37
80 0.37
81 0.37
82 0.39
83 0.39
84 0.39
85 0.32
86 0.31
87 0.29
88 0.22
89 0.23
90 0.26
91 0.31
92 0.33
93 0.43
94 0.51
95 0.52
96 0.56
97 0.56
98 0.51
99 0.5
100 0.53
101 0.46
102 0.4
103 0.43
104 0.48
105 0.55
106 0.54
107 0.51
108 0.45
109 0.44
110 0.49
111 0.46
112 0.46
113 0.45
114 0.49
115 0.51
116 0.53
117 0.55
118 0.52
119 0.54
120 0.48
121 0.48
122 0.51
123 0.55
124 0.56
125 0.54
126 0.56
127 0.56
128 0.58
129 0.56
130 0.51
131 0.46
132 0.46
133 0.5
134 0.49
135 0.47
136 0.42
137 0.38
138 0.36
139 0.35
140 0.32
141 0.28
142 0.26
143 0.22
144 0.22
145 0.2
146 0.18
147 0.14
148 0.12
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.08
153 0.08
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.15
159 0.16
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.17
196 0.15
197 0.14
198 0.13
199 0.11
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.15
208 0.17
209 0.16
210 0.19
211 0.18
212 0.26
213 0.28
214 0.3
215 0.32
216 0.32
217 0.33
218 0.31
219 0.28
220 0.29
221 0.3
222 0.32
223 0.36
224 0.4
225 0.48
226 0.53
227 0.57
228 0.53
229 0.53
230 0.52
231 0.52
232 0.49
233 0.4
234 0.37
235 0.35
236 0.34
237 0.31
238 0.27
239 0.22
240 0.23
241 0.29
242 0.32
243 0.4
244 0.48
245 0.58
246 0.68
247 0.75
248 0.82
249 0.85
250 0.9
251 0.89
252 0.89
253 0.87
254 0.86
255 0.83
256 0.75
257 0.7
258 0.59
259 0.53
260 0.44
261 0.38
262 0.28
263 0.21
264 0.21
265 0.16
266 0.17
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.17
271 0.23
272 0.27
273 0.3
274 0.29
275 0.29
276 0.33
277 0.35
278 0.35
279 0.35
280 0.33
281 0.31
282 0.38
283 0.39
284 0.37
285 0.41
286 0.39
287 0.36
288 0.37
289 0.4
290 0.36
291 0.38
292 0.35
293 0.33
294 0.4
295 0.41
296 0.4
297 0.39
298 0.43
299 0.44
300 0.47
301 0.45
302 0.38
303 0.34
304 0.35
305 0.38
306 0.33
307 0.32
308 0.33
309 0.35
310 0.37
311 0.35