FuNGI

Q4WM23

Protein Details

Accession

Q4WM23

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-44	QKNTSTTSRKAPKPPAPRLKLLV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
34-36	KPP
203-242	EKKANKAKEASSKSSRHAKGEKESKSEKVQAKKLLQRQDK
248-271	PTGDKAEKKSRASDKASKEAVKAA
546-561	RGPRGGRGSRNKGGSK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay GO:0045727 P:positive regulation of translation
KEGG	afm:AFUA_6G11460 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MTQTSDGKSTGGVLQIPAAATQKNTSTTSRKAPKPPAPRLKLLVRRLPPGLTQSEFENAMGPEWMVGAGKVDWYQYKPGKVSKDYAKPSRPSRAYIHVTSSEHIAPLSDKVRQTSFVDARNTFNDPVLLGPPSLEFAPYAKIPGSRVRKDARQGTIDQDPEFIAFLESLTQPITKPTTVDTPTDAEEKKETVTTTPLVQYIKEKKANKAKEASSKSSRHAKGEKESKSEKVQAKKLLQRQDKDAALAPTGDKAEKKSRASDKASKEAVKAANRAANAAAKQAAKPAATQNTSKDTAQPASTERKRERNNIAVAAKILQRDLGLAPSGGRRRAGKGGSTETDSSKKEPDAAITADSGKKDTKSGKPMSPSTPRSKANATPPSGEPAPSRAQSGPNAGPTSAPSAQKQSKSAKGKPAAPITSPTATQAFLKHANPSQGVTEPLLETAFAPFGKILKVEIDKKKGFGYIDFAEPDGLQKAIAASPVTVAQSQVVVLERKANPGAEKTRGKGRSEQPAPNNGSNSNSNSNRGAKQGSDGGSGPATPSSSRGPRGGRGSRNKGGSKGNGANASSNTPSGKTGGETK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.16
3	0.16
4	0.16
5	0.15
6	0.14
7	0.14
8	0.16
9	0.18
10	0.21
11	0.24
12	0.29
13	0.33
14	0.38
15	0.47
16	0.54
17	0.59
18	0.64
19	0.72
20	0.76
21	0.8
22	0.85
23	0.86
24	0.83
25	0.81
26	0.79
27	0.79
28	0.78
29	0.76
30	0.75
31	0.69
32	0.67
33	0.63
34	0.59
35	0.52
36	0.48
37	0.44
38	0.37
39	0.33
40	0.3
41	0.3
42	0.29
43	0.26
44	0.23
45	0.18
46	0.16
47	0.16
48	0.13
49	0.1
50	0.09
51	0.09
52	0.06
53	0.06
54	0.07
55	0.07
56	0.08
57	0.09
58	0.11
59	0.14
60	0.16
61	0.25
62	0.28
63	0.33
64	0.36
65	0.41
66	0.47
67	0.48
68	0.53
69	0.54
70	0.59
71	0.62
72	0.67
73	0.69
74	0.69
75	0.72
76	0.76
77	0.69
78	0.64
79	0.61
80	0.61
81	0.6
82	0.55
83	0.54
84	0.49
85	0.48
86	0.43
87	0.41
88	0.33
89	0.26
90	0.23
91	0.18
92	0.13
93	0.16
94	0.17
95	0.19
96	0.19
97	0.22
98	0.24
99	0.26
100	0.27
101	0.32
102	0.34
103	0.36
104	0.41
105	0.39
106	0.41
107	0.41
108	0.42
109	0.34
110	0.3
111	0.24
112	0.18
113	0.18
114	0.17
115	0.14
116	0.11
117	0.1
118	0.1
119	0.11
120	0.1
121	0.09
122	0.08
123	0.08
124	0.11
125	0.1
126	0.12
127	0.12
128	0.13
129	0.15
130	0.24
131	0.32
132	0.33
133	0.39
134	0.43
135	0.48
136	0.55
137	0.6
138	0.56
139	0.52
140	0.5
141	0.48
142	0.49
143	0.45
144	0.37
145	0.3
146	0.25
147	0.21
148	0.19
149	0.15
150	0.09
151	0.07
152	0.06
153	0.08
154	0.07
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.11
160	0.14
161	0.12
162	0.12
163	0.14
164	0.2
165	0.22
166	0.23
167	0.23
168	0.22
169	0.23
170	0.27
171	0.25
172	0.2
173	0.19
174	0.19
175	0.18
176	0.17
177	0.16
178	0.13
179	0.15
180	0.15
181	0.15
182	0.16
183	0.18
184	0.16
185	0.17
186	0.23
187	0.28
188	0.34
189	0.4
190	0.41
191	0.47
192	0.56
193	0.62
194	0.6
195	0.59
196	0.57
197	0.59
198	0.63
199	0.62
200	0.6
201	0.57
202	0.56
203	0.59
204	0.56
205	0.52
206	0.51
207	0.49
208	0.5
209	0.56
210	0.56
211	0.53
212	0.54
213	0.51
214	0.51
215	0.54
216	0.51
217	0.49
218	0.5
219	0.51
220	0.55
221	0.59
222	0.6
223	0.62
224	0.63
225	0.58
226	0.57
227	0.55
228	0.48
229	0.43
230	0.39
231	0.3
232	0.24
233	0.22
234	0.17
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.1
239	0.13
240	0.2
241	0.25
242	0.27
243	0.33
244	0.39
245	0.46
246	0.52
247	0.56
248	0.54
249	0.55
250	0.57
251	0.51
252	0.45
253	0.43
254	0.41
255	0.36
256	0.32
257	0.27
258	0.26
259	0.24
260	0.24
261	0.2
262	0.17
263	0.14
264	0.13
265	0.14
266	0.12
267	0.12
268	0.14
269	0.14
270	0.12
271	0.13
272	0.16
273	0.18
274	0.2
275	0.21
276	0.21
277	0.24
278	0.26
279	0.25
280	0.23
281	0.2
282	0.2
283	0.19
284	0.18
285	0.16
286	0.24
287	0.27
288	0.32
289	0.34
290	0.41
291	0.45
292	0.51
293	0.54
294	0.52
295	0.52
296	0.51
297	0.48
298	0.39
299	0.35
300	0.3
301	0.26
302	0.19
303	0.16
304	0.1
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.11
313	0.13
314	0.13
315	0.15
316	0.15
317	0.18
318	0.24
319	0.24
320	0.23
321	0.25
322	0.28
323	0.28
324	0.3
325	0.28
326	0.25
327	0.28
328	0.26
329	0.24
330	0.21
331	0.2
332	0.19
333	0.18
334	0.17
335	0.17
336	0.16
337	0.15
338	0.14
339	0.16
340	0.15
341	0.15
342	0.15
343	0.13
344	0.13
345	0.15
346	0.21
347	0.25
348	0.32
349	0.37
350	0.4
351	0.44
352	0.48
353	0.51
354	0.54
355	0.54
356	0.53
357	0.55
358	0.53
359	0.5
360	0.51
361	0.49
362	0.5
363	0.52
364	0.47
365	0.43
366	0.42
367	0.44
368	0.4
369	0.36
370	0.27
371	0.23
372	0.25
373	0.22
374	0.24
375	0.2
376	0.23
377	0.23
378	0.28
379	0.26
380	0.26
381	0.26
382	0.24
383	0.22
384	0.21
385	0.25
386	0.23
387	0.22
388	0.2
389	0.27
390	0.32
391	0.34
392	0.39
393	0.39
394	0.44
395	0.51
396	0.55
397	0.57
398	0.58
399	0.6
400	0.62
401	0.63
402	0.56
403	0.49
404	0.47
405	0.42
406	0.38
407	0.33
408	0.28
409	0.21
410	0.19
411	0.19
412	0.17
413	0.17
414	0.2
415	0.21
416	0.23
417	0.25
418	0.28
419	0.28
420	0.27
421	0.25
422	0.22
423	0.23
424	0.2
425	0.18
426	0.15
427	0.14
428	0.13
429	0.11
430	0.09
431	0.08
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.13
441	0.19
442	0.27
443	0.35
444	0.42
445	0.43
446	0.44
447	0.45
448	0.43
449	0.38
450	0.31
451	0.3
452	0.24
453	0.26
454	0.25
455	0.24
456	0.21
457	0.2
458	0.2
459	0.15
460	0.12
461	0.08
462	0.08
463	0.09
464	0.09
465	0.1
466	0.09
467	0.08
468	0.09
469	0.11
470	0.12
471	0.11
472	0.11
473	0.1
474	0.09
475	0.09
476	0.1
477	0.11
478	0.11
479	0.12
480	0.19
481	0.2
482	0.23
483	0.25
484	0.26
485	0.25
486	0.31
487	0.36
488	0.37
489	0.41
490	0.41
491	0.49
492	0.52
493	0.53
494	0.55
495	0.56
496	0.59
497	0.61
498	0.67
499	0.63
500	0.68
501	0.71
502	0.66
503	0.62
504	0.52
505	0.49
506	0.45
507	0.44
508	0.44
509	0.39
510	0.39
511	0.41
512	0.45
513	0.43
514	0.43
515	0.4
516	0.32
517	0.33
518	0.36
519	0.33
520	0.3
521	0.29
522	0.27
523	0.25
524	0.24
525	0.2
526	0.15
527	0.15
528	0.12
529	0.14
530	0.2
531	0.25
532	0.29
533	0.34
534	0.37
535	0.43
536	0.52
537	0.58
538	0.61
539	0.66
540	0.72
541	0.73
542	0.77
543	0.73
544	0.69
545	0.68
546	0.64
547	0.63
548	0.6
549	0.59
550	0.55
551	0.53
552	0.51
553	0.45
554	0.44
555	0.36
556	0.32
557	0.28
558	0.24
559	0.24
560	0.22
561	0.21

Q4WM23

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer