Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WYM4

Protein Details
Accession Q4WYM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-339EAGQKPSHRAHRHSHHGRKHGRCHAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
331-331R
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 11, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008397  Alginate_lyase_dom  
IPR008929  Chondroitin_lyas  
Gene Ontology GO:0042597  C:periplasmic space  
GO:0016829  F:lyase activity  
KEGG afm:AFUA_3G13570  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05426  Alginate_lyase  
Amino Acid Sequences MANTVFIPMHYKWLRHEEPSQHNILHFFANWELCNVASAMAMGVLTDNQTVWDFAVEYFKEGEGTGSIHNAITDIVEEPGTGAPLGQGQEAGRDQGHSALDVQLLAVVGQQAWNQGEDLFALNDSRILRGAEYWARYNLGHDDPFVPYSNGIVSFTELSSASRGAMRPTWELLYNHYVTIKGMDAPWTTKFLNESLNYYGGAEGGAGSWGEGSGHYDGLGWGSLLHRLDREDVAAQGSGANTLIASPNDKATSKLPQSTPDASRAGSSGANSTSMSTSVASSTPTPLSSPSSPLPGTSTPASTPDSQPTPCPPEAGQKPSHRAHRHSHHGRKHGRCHAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.53
4 0.52
5 0.59
6 0.63
7 0.62
8 0.53
9 0.5
10 0.47
11 0.4
12 0.33
13 0.24
14 0.21
15 0.2
16 0.21
17 0.2
18 0.19
19 0.18
20 0.15
21 0.16
22 0.13
23 0.1
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.04
30 0.05
31 0.04
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.14
49 0.15
50 0.09
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.06
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.07
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.07
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.13
83 0.13
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.13
118 0.14
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.18
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.17
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.17
132 0.16
133 0.13
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.1
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.17
160 0.2
161 0.18
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.13
166 0.14
167 0.11
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.13
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.17
185 0.16
186 0.15
187 0.1
188 0.09
189 0.06
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.04
229 0.05
230 0.07
231 0.06
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.13
236 0.14
237 0.16
238 0.17
239 0.25
240 0.27
241 0.33
242 0.32
243 0.34
244 0.4
245 0.43
246 0.43
247 0.39
248 0.37
249 0.31
250 0.3
251 0.26
252 0.22
253 0.17
254 0.15
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.13
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.2
275 0.2
276 0.24
277 0.23
278 0.27
279 0.26
280 0.27
281 0.29
282 0.25
283 0.28
284 0.25
285 0.25
286 0.21
287 0.24
288 0.27
289 0.25
290 0.27
291 0.29
292 0.32
293 0.31
294 0.34
295 0.38
296 0.42
297 0.39
298 0.39
299 0.34
300 0.4
301 0.46
302 0.5
303 0.51
304 0.52
305 0.59
306 0.64
307 0.72
308 0.69
309 0.68
310 0.72
311 0.73
312 0.76
313 0.8
314 0.83
315 0.82
316 0.85
317 0.89
318 0.89
319 0.89