Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F7ZTW5

Protein Details
Accession A0A0F7ZTW5    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-40SSDSPALKAEKKHKKDKSHKSEKKRAREEDAQADABasic
59-90AQSQPELKKEHKEKTKKSKEHKIKKDTLSSVDHydrophilic
93-119ETPATDASPEKKKKKKRHTEGEAAVNPHydrophilic
123-146SNEPEMQKTPKKKKKSTELSALQDHydrophilic
148-173GNVGSERKTKKEKKSKSTKQAPEEGAHydrophilic
441-466ARTAQMRRLKKGEQRQRRRVPDFSMTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-47KAEKKHKKDKSHKSEKKRAREEDAQADAERKLKKS
66-83KKEHKEKTKKSKEHKIKK
102-110EKKKKKKRH
132-137PKKKKK
154-164RKTKKEKKSKS
450-451KK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.333, mito 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MATPASSDSPALKAEKKHKKDKSHKSEKKRAREEDAQADAERKLKKSKSVPADLNQEEAQSQPELKKEHKEKTKKSKEHKIKKDTLSSVDNAETPATDASPEKKKKKKRHTEGEAAVNPPTASNEPEMQKTPKKKKKSTELSALQDVGNVGSERKTKKEKKSKSTKQAPEEGAANAALQNEQQKTPPPSTDADIMDVDQAAKPSQSSSIYQPPDMPADPHFPFFAQTVSLYEPLYPVGWAQPVTNSKYQHLQHLQDKYVPSLRGVLLDYKNVAVGPVPGRDGAATDDDTPTTVVSRNEYAVGFGWITADVELFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPAWKWVSNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWVDGSGSKVKGKVRFRIRNFDAGTSGDTSYLSLEGTMLDRDSEKKLVQEEARTAQMRRLKKGEQRQRRRVPDFSMTRFAVEEKETTQGADDGAAESQTASRVQSEEAAARATSAEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.52
3 0.59
4 0.68
5 0.74
6 0.81
7 0.87
8 0.9
9 0.91
10 0.91
11 0.93
12 0.93
13 0.95
14 0.94
15 0.94
16 0.93
17 0.89
18 0.86
19 0.86
20 0.82
21 0.81
22 0.76
23 0.68
24 0.58
25 0.53
26 0.46
27 0.42
28 0.38
29 0.32
30 0.36
31 0.37
32 0.45
33 0.51
34 0.59
35 0.62
36 0.68
37 0.71
38 0.69
39 0.75
40 0.67
41 0.63
42 0.53
43 0.44
44 0.35
45 0.29
46 0.24
47 0.16
48 0.18
49 0.16
50 0.2
51 0.24
52 0.27
53 0.37
54 0.43
55 0.51
56 0.59
57 0.68
58 0.73
59 0.81
60 0.88
61 0.88
62 0.9
63 0.91
64 0.92
65 0.92
66 0.93
67 0.91
68 0.9
69 0.88
70 0.87
71 0.8
72 0.75
73 0.68
74 0.59
75 0.51
76 0.43
77 0.36
78 0.27
79 0.23
80 0.17
81 0.14
82 0.13
83 0.09
84 0.09
85 0.11
86 0.15
87 0.25
88 0.34
89 0.43
90 0.52
91 0.62
92 0.72
93 0.81
94 0.87
95 0.88
96 0.91
97 0.91
98 0.92
99 0.88
100 0.87
101 0.8
102 0.7
103 0.59
104 0.49
105 0.39
106 0.29
107 0.24
108 0.15
109 0.13
110 0.14
111 0.19
112 0.2
113 0.23
114 0.27
115 0.3
116 0.37
117 0.46
118 0.54
119 0.58
120 0.67
121 0.72
122 0.78
123 0.83
124 0.86
125 0.84
126 0.83
127 0.82
128 0.77
129 0.72
130 0.64
131 0.52
132 0.42
133 0.34
134 0.23
135 0.17
136 0.11
137 0.08
138 0.1
139 0.15
140 0.17
141 0.22
142 0.33
143 0.4
144 0.51
145 0.61
146 0.69
147 0.74
148 0.84
149 0.89
150 0.9
151 0.92
152 0.89
153 0.85
154 0.83
155 0.75
156 0.65
157 0.56
158 0.46
159 0.36
160 0.27
161 0.2
162 0.12
163 0.11
164 0.08
165 0.07
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.19
171 0.22
172 0.25
173 0.25
174 0.24
175 0.24
176 0.25
177 0.29
178 0.23
179 0.22
180 0.2
181 0.19
182 0.16
183 0.14
184 0.12
185 0.08
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.08
192 0.1
193 0.11
194 0.15
195 0.23
196 0.24
197 0.25
198 0.25
199 0.24
200 0.25
201 0.24
202 0.2
203 0.14
204 0.19
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.15
209 0.16
210 0.15
211 0.13
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.1
229 0.13
230 0.17
231 0.21
232 0.21
233 0.21
234 0.27
235 0.28
236 0.31
237 0.33
238 0.33
239 0.35
240 0.38
241 0.38
242 0.34
243 0.34
244 0.29
245 0.28
246 0.24
247 0.19
248 0.18
249 0.17
250 0.15
251 0.15
252 0.18
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.13
257 0.13
258 0.11
259 0.1
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.1
288 0.11
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.1
311 0.09
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.07
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.13
330 0.14
331 0.16
332 0.19
333 0.24
334 0.23
335 0.25
336 0.26
337 0.22
338 0.23
339 0.31
340 0.33
341 0.32
342 0.35
343 0.39
344 0.43
345 0.44
346 0.44
347 0.37
348 0.35
349 0.31
350 0.29
351 0.23
352 0.18
353 0.15
354 0.12
355 0.11
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.1
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.12
381 0.14
382 0.15
383 0.15
384 0.16
385 0.2
386 0.25
387 0.32
388 0.36
389 0.42
390 0.51
391 0.6
392 0.65
393 0.72
394 0.71
395 0.72
396 0.68
397 0.61
398 0.52
399 0.43
400 0.39
401 0.31
402 0.27
403 0.18
404 0.16
405 0.14
406 0.12
407 0.11
408 0.09
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.12
418 0.16
419 0.18
420 0.18
421 0.21
422 0.23
423 0.29
424 0.31
425 0.34
426 0.35
427 0.36
428 0.42
429 0.41
430 0.39
431 0.39
432 0.42
433 0.43
434 0.45
435 0.48
436 0.49
437 0.56
438 0.67
439 0.71
440 0.75
441 0.81
442 0.85
443 0.89
444 0.92
445 0.89
446 0.84
447 0.8
448 0.79
449 0.77
450 0.72
451 0.69
452 0.59
453 0.54
454 0.49
455 0.42
456 0.35
457 0.29
458 0.24
459 0.18
460 0.21
461 0.2
462 0.19
463 0.2
464 0.17
465 0.15
466 0.14
467 0.13
468 0.1
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.13
479 0.14
480 0.17
481 0.19
482 0.2
483 0.2
484 0.21
485 0.19
486 0.18