Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WJ70

Protein Details
Accession Q4WJ70    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-48PSLPGKTRRFFRQHHRMTSEKKDDTHydrophilic
357-379ARDGKDRPALKKRERDRDREAAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
361-373KDRPALKKRERDR
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 11.5, nucl 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR043198  Cyclin/Ssn8  
IPR006671  Cyclin_N  
Gene Ontology GO:0008024  C:cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0061575  F:cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG afm:AFUA_1G07020  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00134  Cyclin_N  
CDD cd20546  CYCLIN_SpCG1C_ScCTK2-like_rpt2  
Amino Acid Sequences MRGQRFSRIHHASSWVLVHLPIYPSLPGKTRRFFRQHHRMTSEKKDDTTQPAGAEPSLPEPPAIHPSFIQVAKPYIFEQTIQKCIAAMGVNPLREEALRLQGVTWIDNVRRVLYLPIRTFNTAVVYYHKFRLIHPDTEYNYMDAAAAALFTACKIEDTLKKSREIVCAAYNLKLPPSEHMSPDNPVFEAHARGIIGLERLMLEASGFDFRTRHPQRTLIKLARHYGLSPQSEVSNLAYRISQDLYRTFAPIKQTTSTMAFCSLELAGRLLDQRLEPVEQGSDYEQWRTSREEVMETLFDLLELYTHNRNSTTVGPHFPPDRFLTVRIPLNKEAEDQRLPRYTHWVEDSRDSKPTDGARDGKDRPALKKRERDRDREAAAAPAVHPLTPVAANGERPKAGERGRDGAVRFMLDSECAKAEKARVAEYFKIEMEEYEVEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.31
3 0.25
4 0.23
5 0.2
6 0.18
7 0.18
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.18
12 0.21
13 0.27
14 0.32
15 0.38
16 0.46
17 0.51
18 0.59
19 0.66
20 0.71
21 0.75
22 0.78
23 0.79
24 0.81
25 0.81
26 0.79
27 0.78
28 0.81
29 0.8
30 0.73
31 0.65
32 0.6
33 0.59
34 0.58
35 0.56
36 0.48
37 0.39
38 0.36
39 0.35
40 0.3
41 0.26
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.15
47 0.15
48 0.18
49 0.25
50 0.25
51 0.23
52 0.21
53 0.24
54 0.29
55 0.29
56 0.28
57 0.21
58 0.24
59 0.23
60 0.25
61 0.22
62 0.2
63 0.2
64 0.2
65 0.26
66 0.28
67 0.32
68 0.31
69 0.3
70 0.26
71 0.25
72 0.25
73 0.18
74 0.14
75 0.17
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.21
80 0.19
81 0.18
82 0.21
83 0.14
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.2
89 0.21
90 0.19
91 0.18
92 0.15
93 0.15
94 0.19
95 0.2
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.21
100 0.23
101 0.3
102 0.28
103 0.32
104 0.33
105 0.34
106 0.34
107 0.3
108 0.27
109 0.21
110 0.19
111 0.2
112 0.22
113 0.23
114 0.25
115 0.28
116 0.25
117 0.25
118 0.35
119 0.34
120 0.34
121 0.35
122 0.4
123 0.38
124 0.42
125 0.43
126 0.32
127 0.27
128 0.23
129 0.19
130 0.12
131 0.1
132 0.05
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.09
143 0.15
144 0.2
145 0.29
146 0.31
147 0.33
148 0.36
149 0.39
150 0.39
151 0.36
152 0.33
153 0.27
154 0.29
155 0.29
156 0.27
157 0.25
158 0.21
159 0.19
160 0.18
161 0.16
162 0.14
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.24
167 0.24
168 0.25
169 0.26
170 0.24
171 0.17
172 0.15
173 0.15
174 0.12
175 0.13
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.18
198 0.21
199 0.25
200 0.26
201 0.33
202 0.37
203 0.44
204 0.52
205 0.46
206 0.47
207 0.46
208 0.47
209 0.4
210 0.37
211 0.3
212 0.26
213 0.26
214 0.23
215 0.21
216 0.19
217 0.17
218 0.17
219 0.18
220 0.15
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.12
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.1
230 0.11
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.16
236 0.2
237 0.2
238 0.22
239 0.2
240 0.2
241 0.21
242 0.23
243 0.22
244 0.17
245 0.17
246 0.15
247 0.13
248 0.14
249 0.12
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.12
269 0.12
270 0.14
271 0.16
272 0.16
273 0.18
274 0.21
275 0.21
276 0.22
277 0.22
278 0.22
279 0.2
280 0.22
281 0.2
282 0.17
283 0.15
284 0.11
285 0.1
286 0.08
287 0.07
288 0.05
289 0.06
290 0.09
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.15
296 0.17
297 0.2
298 0.24
299 0.23
300 0.26
301 0.27
302 0.3
303 0.33
304 0.3
305 0.29
306 0.26
307 0.28
308 0.26
309 0.28
310 0.29
311 0.31
312 0.37
313 0.39
314 0.41
315 0.39
316 0.41
317 0.39
318 0.37
319 0.36
320 0.36
321 0.36
322 0.33
323 0.36
324 0.39
325 0.39
326 0.37
327 0.42
328 0.38
329 0.37
330 0.4
331 0.4
332 0.36
333 0.43
334 0.45
335 0.38
336 0.42
337 0.39
338 0.34
339 0.33
340 0.35
341 0.32
342 0.36
343 0.39
344 0.39
345 0.45
346 0.47
347 0.47
348 0.5
349 0.49
350 0.51
351 0.56
352 0.61
353 0.62
354 0.7
355 0.74
356 0.78
357 0.82
358 0.82
359 0.81
360 0.8
361 0.75
362 0.69
363 0.61
364 0.53
365 0.46
366 0.39
367 0.3
368 0.26
369 0.23
370 0.18
371 0.17
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.13
377 0.15
378 0.19
379 0.24
380 0.28
381 0.26
382 0.27
383 0.3
384 0.32
385 0.35
386 0.38
387 0.38
388 0.39
389 0.42
390 0.45
391 0.43
392 0.41
393 0.39
394 0.32
395 0.27
396 0.24
397 0.21
398 0.19
399 0.19
400 0.17
401 0.17
402 0.16
403 0.17
404 0.19
405 0.22
406 0.26
407 0.27
408 0.29
409 0.32
410 0.37
411 0.41
412 0.43
413 0.42
414 0.37
415 0.37
416 0.32
417 0.28
418 0.26