FuNGI

A0A0C9Y3T2

Protein Details

Accession

A0A0C9Y3T2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12, nucl 8, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIIYPVEEEEEIKVPDENGDDITIPVNMALANPNGAEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEVFKYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKETARKESVAIWEALGKEVSDEEKNKVSWDSNAITPGTPFMDLLASSLRYWVVQKMNTDPGWKNIEVLISDAGVPGEGEHKIMDFIRRQRSNPGHDPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFANDTSPSACRMCGQEGHYAAQCTGTKAEIQKKPPSEKKPFIFLDVAILREYLEVELDVPNTPFPFMLEQAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKQELPRMGGYLTNHGHLELSRAQIILDGLAKREDEIFRKRREAEERQDQNAKRRKLENQNREGGFAGPSPTMALTAPPVAPSSAAPSLIHPSLPPRPTYDFAAKADSIGLGATPTPLSVQNAPIAAQALAGSNRDVVANRRAIRMANMSAAEMLKAELSGVSPVKPDPLPPKPPPPTTAATPTSNGDVIHMEEDEVPGLGNHNLTSHMSLDPPNTQTMKSETPADCDMDAEGDPDPDVVAGSSDAGIIGRDTSPNPKRKFEEGPGSNDVPEDVVVIEEEDDDAPSSLILKVNADGTVEQEDTVKLWEPGYKERYYRQKFGIELTDTEFRENLTKSYVEGLAWVLHYYYQGTPSWQWYYPYHFAPFAADFSNVDQMNIKFELGQPFKPFEQLMGVFPAASRKHIPEVFQPLMINEDSPILDFYPPTFEIDMNGKKMAWQGVALLPFINEKRLLEAMATEYPNLSDDEVRRNRWGNDVLFASDDHPLYPFYESLYGKRKSQEPAPIDTHLSRGMSGSVLPNPDCLPGSTYYSPLPSQNLADIKNDRSLSVLYFFPKQLTPHRSIMLPGVKKSSRVLSASDLEATRNGGRGRGRGGWDRGGGHRAGGGYNDRVGRNDPFHSRPNNYGQSSYGGERNSYNRTGYGGGYAGRGSGNAYQQTQYPSRPYSTQPPLSRGYSDSGFAGGRGGPRLAQSHGNYGNAPPSRGGPYTHGGYGTPPTSSGYHPFSNTGGGDYGGYGGTQGHIPPSDGTNPDYERHGASKPMAFSGYGRRIHPCPEFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.69
5	0.65
6	0.63
7	0.61
8	0.56
9	0.49
10	0.46
11	0.4
12	0.36
13	0.31
14	0.25
15	0.2
16	0.17
17	0.17
18	0.18
19	0.16
20	0.14
21	0.15
22	0.14
23	0.14
24	0.15
25	0.13
26	0.11
27	0.09
28	0.08
29	0.07
30	0.07
31	0.09
32	0.09
33	0.1
34	0.1
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.12
39	0.1
40	0.11
41	0.12
42	0.12
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.11
47	0.1
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.27
58	0.32
59	0.36
60	0.41
61	0.4
62	0.4
63	0.39
64	0.42
65	0.36
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.22
70	0.17
71	0.15
72	0.11
73	0.1
74	0.07
75	0.09
76	0.09
77	0.13
78	0.14
79	0.17
80	0.2
81	0.28
82	0.37
83	0.44
84	0.46
85	0.46
86	0.47
87	0.47
88	0.46
89	0.42
90	0.34
91	0.29
92	0.29
93	0.25
94	0.25
95	0.21
96	0.21
97	0.18
98	0.16
99	0.12
100	0.14
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.77
113	0.77
114	0.75
115	0.78
116	0.72
117	0.69
118	0.72
119	0.67
120	0.63
121	0.61
122	0.58
123	0.51
124	0.49
125	0.46
126	0.42
127	0.46
128	0.42
129	0.34
130	0.28
131	0.27
132	0.25
133	0.25
134	0.21
135	0.14
136	0.11
137	0.12
138	0.14
139	0.16
140	0.18
141	0.21
142	0.25
143	0.25
144	0.27
145	0.28
146	0.27
147	0.24
148	0.28
149	0.27
150	0.25
151	0.28
152	0.27
153	0.24
154	0.23
155	0.22
156	0.17
157	0.14
158	0.12
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.13
167	0.12
168	0.12
169	0.13
170	0.18
171	0.21
172	0.23
173	0.26
174	0.3
175	0.37
176	0.37
177	0.42
178	0.37
179	0.37
180	0.4
181	0.37
182	0.33
183	0.27
184	0.28
185	0.22
186	0.23
187	0.18
188	0.12
189	0.12
190	0.11
191	0.1
192	0.07
193	0.07
194	0.05
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.09
201	0.11
202	0.15
203	0.2
204	0.27
205	0.37
206	0.41
207	0.42
208	0.51
209	0.58
210	0.62
211	0.65
212	0.66
213	0.64
214	0.67
215	0.71
216	0.67
217	0.68
218	0.59
219	0.5
220	0.41
221	0.34
222	0.29
223	0.25
224	0.2
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.12
240	0.14
241	0.14
242	0.18
243	0.21
244	0.22
245	0.23
246	0.23
247	0.21
248	0.23
249	0.23
250	0.19
251	0.16
252	0.14
253	0.12
254	0.12
255	0.14
256	0.11
257	0.11
258	0.12
259	0.14
260	0.17
261	0.21
262	0.23
263	0.27
264	0.28
265	0.3
266	0.31
267	0.28
268	0.25
269	0.25
270	0.23
271	0.18
272	0.17
273	0.15
274	0.16
275	0.22
276	0.31
277	0.33
278	0.38
279	0.44
280	0.5
281	0.59
282	0.65
283	0.69
284	0.69
285	0.72
286	0.7
287	0.71
288	0.65
289	0.6
290	0.52
291	0.42
292	0.4
293	0.32
294	0.3
295	0.21
296	0.2
297	0.16
298	0.14
299	0.15
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.08
312	0.08
313	0.09
314	0.1
315	0.11
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.12
320	0.11
321	0.09
322	0.08
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.05
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.12
341	0.13
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.11
348	0.07
349	0.06
350	0.08
351	0.1
352	0.09
353	0.09
354	0.1
355	0.14
356	0.16
357	0.21
358	0.23
359	0.26
360	0.27
361	0.28
362	0.27
363	0.25
364	0.24
365	0.26
366	0.22
367	0.19
368	0.18
369	0.17
370	0.17
371	0.15
372	0.18
373	0.13
374	0.14
375	0.13
376	0.13
377	0.13
378	0.14
379	0.14
380	0.1
381	0.11
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.1
387	0.13
388	0.14
389	0.17
390	0.26
391	0.33
392	0.36
393	0.41
394	0.43
395	0.47
396	0.53
397	0.56
398	0.55
399	0.59
400	0.6
401	0.6
402	0.66
403	0.62
404	0.63
405	0.63
406	0.58
407	0.52
408	0.51
409	0.56
410	0.59
411	0.68
412	0.68
413	0.67
414	0.72
415	0.67
416	0.63
417	0.55
418	0.45
419	0.35
420	0.25
421	0.19
422	0.11
423	0.1
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.11
438	0.1
439	0.11
440	0.11
441	0.11
442	0.15
443	0.14
444	0.14
445	0.1
446	0.14
447	0.19
448	0.21
449	0.21
450	0.21
451	0.25
452	0.27
453	0.31
454	0.32
455	0.29
456	0.29
457	0.31
458	0.27
459	0.23
460	0.22
461	0.17
462	0.12
463	0.08
464	0.07
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.07
473	0.08
474	0.09
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.11
479	0.11
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.07
491	0.09
492	0.13
493	0.18
494	0.19
495	0.2
496	0.21
497	0.21
498	0.22
499	0.23
500	0.19
501	0.15
502	0.14
503	0.13
504	0.13
505	0.13
506	0.11
507	0.08
508	0.07
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.03
513	0.04
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.07
519	0.09
520	0.09
521	0.12
522	0.17
523	0.23
524	0.3
525	0.33
526	0.42
527	0.45
528	0.47
529	0.47
530	0.45
531	0.41
532	0.36
533	0.39
534	0.34
535	0.3
536	0.29
537	0.27
538	0.23
539	0.21
540	0.18
541	0.13
542	0.1
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.05
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.09
565	0.1
566	0.12
567	0.12
568	0.14
569	0.13
570	0.13
571	0.14
572	0.17
573	0.17
574	0.16
575	0.21
576	0.19
577	0.21
578	0.22
579	0.22
580	0.18
581	0.16
582	0.15
583	0.1
584	0.1
585	0.07
586	0.06
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.04
592	0.04
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.04
604	0.04
605	0.05
606	0.06
607	0.14
608	0.21
609	0.3
610	0.33
611	0.37
612	0.41
613	0.45
614	0.5
615	0.47
616	0.5
617	0.44
618	0.47
619	0.47
620	0.44
621	0.39
622	0.34
623	0.28
624	0.18
625	0.15
626	0.09
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.05
641	0.05
642	0.06
643	0.06
644	0.07
645	0.07
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.07
650	0.07
651	0.09
652	0.09
653	0.09
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.09
658	0.08
659	0.07
660	0.07
661	0.09
662	0.11
663	0.18
664	0.22
665	0.24
666	0.25
667	0.31
668	0.42
669	0.45
670	0.47
671	0.45
672	0.44
673	0.43
674	0.43
675	0.43
676	0.33
677	0.29
678	0.28
679	0.29
680	0.25
681	0.25
682	0.22
683	0.16
684	0.18
685	0.18
686	0.15
687	0.12
688	0.12
689	0.12
690	0.14
691	0.14
692	0.11
693	0.11
694	0.11
695	0.09
696	0.09
697	0.09
698	0.06
699	0.06
700	0.07
701	0.08
702	0.07
703	0.09
704	0.09
705	0.11
706	0.12
707	0.16
708	0.19
709	0.18
710	0.21
711	0.2
712	0.27
713	0.29
714	0.3
715	0.28
716	0.25
717	0.24
718	0.24
719	0.23
720	0.17
721	0.15
722	0.13
723	0.11
724	0.12
725	0.18
726	0.15
727	0.14
728	0.16
729	0.14
730	0.17
731	0.17
732	0.16
733	0.11
734	0.13
735	0.22
736	0.21
737	0.24
738	0.23
739	0.26
740	0.26
741	0.27
742	0.25
743	0.17
744	0.19
745	0.17
746	0.16
747	0.16
748	0.15
749	0.13
750	0.14
751	0.19
752	0.15
753	0.16
754	0.17
755	0.16
756	0.22
757	0.24
758	0.26
759	0.27
760	0.35
761	0.33
762	0.33
763	0.31
764	0.25
765	0.26
766	0.24
767	0.18
768	0.1
769	0.1
770	0.08
771	0.09
772	0.09
773	0.07
774	0.08
775	0.08
776	0.08
777	0.11
778	0.12
779	0.13
780	0.13
781	0.12
782	0.14
783	0.21
784	0.24
785	0.21
786	0.21
787	0.19
788	0.19
789	0.22
790	0.22
791	0.16
792	0.13
793	0.12
794	0.15
795	0.16
796	0.15
797	0.13
798	0.11
799	0.13
800	0.13
801	0.13
802	0.11
803	0.1
804	0.13
805	0.14
806	0.14
807	0.11
808	0.12
809	0.13
810	0.16
811	0.17
812	0.14
813	0.13
814	0.13
815	0.14
816	0.14
817	0.11
818	0.1
819	0.12
820	0.22
821	0.27
822	0.3
823	0.33
824	0.36
825	0.36
826	0.38
827	0.42
828	0.33
829	0.32
830	0.31
831	0.28
832	0.25
833	0.24
834	0.2
835	0.17
836	0.16
837	0.12
838	0.11
839	0.11
840	0.11
841	0.12
842	0.11
843	0.1
844	0.16
845	0.17
846	0.21
847	0.29
848	0.3
849	0.32
850	0.36
851	0.39
852	0.37
853	0.42
854	0.46
855	0.42
856	0.46
857	0.47
858	0.46
859	0.45
860	0.41
861	0.37
862	0.3
863	0.26
864	0.2
865	0.16
866	0.15
867	0.11
868	0.12
869	0.12
870	0.13
871	0.15
872	0.15
873	0.16
874	0.16
875	0.17
876	0.17
877	0.15
878	0.15
879	0.14
880	0.21
881	0.2
882	0.22
883	0.21
884	0.23
885	0.24
886	0.22
887	0.23
888	0.19
889	0.19
890	0.22
891	0.24
892	0.23
893	0.27
894	0.29
895	0.28
896	0.33
897	0.32
898	0.27
899	0.25
900	0.24
901	0.21
902	0.2
903	0.2
904	0.16
905	0.19
906	0.19
907	0.2
908	0.21
909	0.23
910	0.29
911	0.34
912	0.38
913	0.39
914	0.4
915	0.39
916	0.37
917	0.42
918	0.41
919	0.38
920	0.34
921	0.38
922	0.37
923	0.38
924	0.4
925	0.37
926	0.33
927	0.31
928	0.32
929	0.29
930	0.31
931	0.31
932	0.31
933	0.26
934	0.23
935	0.22
936	0.22
937	0.17
938	0.19
939	0.18
940	0.2
941	0.22
942	0.24
943	0.28
944	0.31
945	0.35
946	0.38
947	0.42
948	0.42
949	0.43
950	0.43
951	0.41
952	0.39
953	0.34
954	0.27
955	0.24
956	0.2
957	0.17
958	0.17
959	0.18
960	0.16
961	0.2
962	0.23
963	0.22
964	0.23
965	0.26
966	0.28
967	0.29
968	0.32
969	0.35
970	0.36
971	0.43
972	0.48
973	0.49
974	0.5
975	0.55
976	0.58
977	0.54
978	0.51
979	0.45
980	0.42
981	0.41
982	0.38
983	0.32
984	0.25
985	0.24
986	0.26
987	0.29
988	0.3
989	0.29
990	0.28
991	0.25
992	0.27
993	0.27
994	0.24
995	0.22
996	0.18
997	0.16
998	0.16
999	0.15
1000	0.13
1001	0.12
1002	0.11
1003	0.11
1004	0.13
1005	0.17
1006	0.19
1007	0.21
1008	0.22
1009	0.25
1010	0.31
1011	0.32
1012	0.32
1013	0.33
1014	0.33
1015	0.35
1016	0.37
1017	0.39
1018	0.43
1019	0.49
1020	0.55
1021	0.53
1022	0.55
1023	0.56
1024	0.56
1025	0.53
1026	0.46
1027	0.41
1028	0.33
1029	0.3
1030	0.25
1031	0.22
1032	0.2
1033	0.17
1034	0.16
1035	0.13
1036	0.14
1037	0.15
1038	0.15
1039	0.14
1040	0.17
1041	0.19
1042	0.21
1043	0.26
1044	0.27
1045	0.33
1046	0.36
1047	0.37
1048	0.35
1049	0.34
1050	0.39
1051	0.34
1052	0.33
1053	0.25
1054	0.25
1055	0.28
1056	0.29
1057	0.3
1058	0.26
1059	0.3
1060	0.32
1061	0.32
1062	0.3
1063	0.25
1064	0.26
1065	0.29
1066	0.25
1067	0.2
1068	0.17
1069	0.18
1070	0.2
1071	0.22
1072	0.26
1073	0.26
1074	0.29
1075	0.3
1076	0.32
1077	0.3
1078	0.32
1079	0.29
1080	0.25
1081	0.2
1082	0.17
1083	0.16
1084	0.14
1085	0.14
1086	0.1
1087	0.09
1088	0.07
1089	0.07
1090	0.07
1091	0.08
1092	0.08
1093	0.11
1094	0.12
1095	0.14
1096	0.15
1097	0.19
1098	0.23
1099	0.24
1100	0.25
1101	0.29
1102	0.3
1103	0.31
1104	0.33
1105	0.31
1106	0.29
1107	0.3
1108	0.31
1109	0.29
1110	0.31
1111	0.34
1112	0.32
1113	0.33
1114	0.31
1115	0.28
1116	0.28
1117	0.34
1118	0.38
1119	0.37
1120	0.38
1121	0.4
1122	0.42
1123	0.48

A0A0C9Y3T2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer