Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WNN3

Protein Details
Accession Q4WNN3    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-87QHTTTRNMAPDKKDKKRKAATTVTADSPAKKTKKVEAKPSEAPKETPKSILKKNKKDGPATEHydrophilic
129-154KADTEEKKQPSKKKSKKEDGTPAPATHydrophilic
235-262VPKIPDSKKAKRKILKKQKKHDEPEVPGBasic
348-375WKGANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTREBasic
449-475TVDETPKKLKKEKKASQSTPKQGTPKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-82KKDKKRKAATTVTADSPAKKTKKVEAKPSEAPKETPKSILKKNKKD
135-173KKQPSKKKSKKEDGTPAPATKAKTSATAAKPKATKAKKP
240-254DSKKAKRKILKKQKK
351-395ANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTREQWSERIEREQKRRLAKAEKL
455-509KKLKKEKKASQSTPKQGTPKQDGEKASTKKGVNGAAASPATKAGTKDKKAKKVKA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.333, mito_nucl 9.833, cyto 6.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG afm:AFUA_4G06350  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MGDQKKSFPHLVFGKGLIAVLQPSIQHTTTRNMAPDKKDKKRKAATTVTADSPAKKTKKVEAKPSEAPKETPKSILKKNKKDGPATEQNSTSKVKVNGEPTRQVKPRKRAADFLSDDESEPEVVASEPKADTEEKKQPSKKKSKKEDGTPAPATKAKTSATAAKPKATKAKKPEPVVEESDDEDNQQVPVVSDDSSEDEEDDTLDDQTAALIKGFESSGDEDESGDEGFDPDQPVPKIPDSKKAKRKILKKQKKHDEPEVPGTVYVGRIPHGFYEHQMRAYFSQFGDITRLRLSRNRITGRSKHYAFVEFASSTVAKIVAETMDNYLMYGHILKCKYVPSDQLHPEVWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTREQWSERIEREQKRRLAKAEKLKALGYEYELPQLKSVDEVPVQEETKAIEAADTTADEPKKAIEAPSAQESKEETTVDETPKKLKKEKKASQSTPKQGTPKQDGEKASTKKGVNGAAASPATKAGTKDKKAKKVKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.31
3 0.29
4 0.21
5 0.17
6 0.13
7 0.11
8 0.11
9 0.09
10 0.12
11 0.17
12 0.17
13 0.19
14 0.21
15 0.26
16 0.3
17 0.33
18 0.36
19 0.39
20 0.46
21 0.51
22 0.59
23 0.64
24 0.7
25 0.77
26 0.8
27 0.83
28 0.86
29 0.87
30 0.86
31 0.86
32 0.84
33 0.82
34 0.78
35 0.7
36 0.65
37 0.58
38 0.51
39 0.46
40 0.46
41 0.41
42 0.42
43 0.43
44 0.47
45 0.56
46 0.62
47 0.67
48 0.67
49 0.72
50 0.76
51 0.81
52 0.79
53 0.71
54 0.66
55 0.64
56 0.62
57 0.56
58 0.54
59 0.53
60 0.53
61 0.6
62 0.68
63 0.7
64 0.73
65 0.81
66 0.82
67 0.82
68 0.81
69 0.78
70 0.76
71 0.76
72 0.7
73 0.64
74 0.59
75 0.54
76 0.5
77 0.46
78 0.38
79 0.34
80 0.33
81 0.33
82 0.34
83 0.42
84 0.46
85 0.5
86 0.57
87 0.54
88 0.59
89 0.61
90 0.67
91 0.67
92 0.68
93 0.73
94 0.74
95 0.74
96 0.73
97 0.71
98 0.71
99 0.65
100 0.59
101 0.54
102 0.45
103 0.41
104 0.35
105 0.3
106 0.2
107 0.16
108 0.12
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.11
117 0.12
118 0.15
119 0.22
120 0.31
121 0.35
122 0.44
123 0.51
124 0.58
125 0.67
126 0.75
127 0.77
128 0.79
129 0.84
130 0.86
131 0.88
132 0.89
133 0.89
134 0.86
135 0.85
136 0.79
137 0.69
138 0.62
139 0.56
140 0.48
141 0.38
142 0.33
143 0.25
144 0.23
145 0.24
146 0.29
147 0.32
148 0.39
149 0.39
150 0.42
151 0.43
152 0.44
153 0.51
154 0.49
155 0.5
156 0.51
157 0.6
158 0.62
159 0.65
160 0.68
161 0.62
162 0.61
163 0.58
164 0.51
165 0.42
166 0.35
167 0.33
168 0.26
169 0.21
170 0.17
171 0.13
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.13
223 0.15
224 0.22
225 0.22
226 0.32
227 0.38
228 0.47
229 0.55
230 0.62
231 0.69
232 0.68
233 0.76
234 0.78
235 0.81
236 0.82
237 0.83
238 0.85
239 0.87
240 0.9
241 0.86
242 0.84
243 0.8
244 0.74
245 0.7
246 0.62
247 0.51
248 0.41
249 0.35
250 0.26
251 0.18
252 0.14
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.17
262 0.18
263 0.2
264 0.2
265 0.2
266 0.19
267 0.21
268 0.21
269 0.14
270 0.16
271 0.14
272 0.14
273 0.17
274 0.16
275 0.16
276 0.17
277 0.18
278 0.16
279 0.2
280 0.26
281 0.28
282 0.36
283 0.39
284 0.42
285 0.48
286 0.54
287 0.57
288 0.59
289 0.54
290 0.48
291 0.45
292 0.42
293 0.36
294 0.31
295 0.26
296 0.18
297 0.16
298 0.16
299 0.14
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.17
323 0.19
324 0.19
325 0.26
326 0.26
327 0.34
328 0.37
329 0.39
330 0.38
331 0.36
332 0.35
333 0.31
334 0.27
335 0.24
336 0.25
337 0.29
338 0.37
339 0.4
340 0.48
341 0.5
342 0.55
343 0.62
344 0.67
345 0.71
346 0.72
347 0.79
348 0.81
349 0.85
350 0.89
351 0.88
352 0.87
353 0.86
354 0.85
355 0.81
356 0.81
357 0.79
358 0.8
359 0.78
360 0.75
361 0.74
362 0.68
363 0.7
364 0.66
365 0.67
366 0.58
367 0.6
368 0.62
369 0.62
370 0.67
371 0.67
372 0.68
373 0.67
374 0.71
375 0.69
376 0.69
377 0.69
378 0.71
379 0.71
380 0.7
381 0.64
382 0.59
383 0.53
384 0.46
385 0.39
386 0.32
387 0.27
388 0.23
389 0.27
390 0.28
391 0.27
392 0.26
393 0.25
394 0.21
395 0.18
396 0.18
397 0.16
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.2
402 0.21
403 0.19
404 0.18
405 0.15
406 0.16
407 0.15
408 0.13
409 0.09
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.16
422 0.17
423 0.16
424 0.2
425 0.24
426 0.32
427 0.33
428 0.31
429 0.31
430 0.32
431 0.3
432 0.29
433 0.26
434 0.19
435 0.22
436 0.26
437 0.31
438 0.33
439 0.31
440 0.37
441 0.43
442 0.49
443 0.53
444 0.58
445 0.63
446 0.7
447 0.77
448 0.8
449 0.84
450 0.87
451 0.9
452 0.91
453 0.9
454 0.87
455 0.84
456 0.81
457 0.75
458 0.74
459 0.72
460 0.7
461 0.67
462 0.66
463 0.62
464 0.61
465 0.66
466 0.62
467 0.6
468 0.58
469 0.52
470 0.5
471 0.53
472 0.5
473 0.44
474 0.41
475 0.35
476 0.34
477 0.34
478 0.29
479 0.24
480 0.21
481 0.19
482 0.19
483 0.2
484 0.25
485 0.34
486 0.42
487 0.52
488 0.6
489 0.69