Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WJE0

Protein Details
Accession Q4WJE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-74HPNDAVQRRSRKPTDKNIPDGIHydrophilic
196-218AEKAKKPAAKRPKQRFSHFFKSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-209KAKKPAAKRPKQ
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016514  C:SWI/SNF complex  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG afm:AFUA_1G06310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd10568  SWIB_like  
Amino Acid Sequences MQPNYARGFPQAAQRSPATPRRGPPAPGPAMPVPMPQHAVPPQYIPPQRNMPHPNDAVQRRSRKPTDKNIPDGIEDVIIGEGVQQYKSLRDLEKRLDASIVRKRLDIQDSISKTVKKYRTMRIWISNTVENQPWQTGAGQNGAAPGSNPGSGRYKVRIEGRLLDDDTDPTAPDHSEDEGENAEENGDTMEHDGQDAEKAKKPAAKRPKQRFSHFFKSITIDFDKSPSSNPEETKTISWTKPQLPANAVTLPPIAEFDSLQFSRASQENLSVTISLVRDEAPERYKLSKELAEVLDVEEETRSGIVLGIWDYIRAMGLQEDEEKRLVRCDHRLRAIFGRDQMFFPQIPESIGPHTSPLDPIKLPYTIRVDEDFHKDPTPTVYDIQVAVEDPLRAKMLALTQNPQYTAGLRQIAALDDQLALIVQALTHSRAKHSFYTALSKDPATFLRRWVNSQRRDLETILGEATRGGGEDGSGPEFRRGGAESVWDTQVAREAVRYMLAKPEAAAAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.47
4 0.53
5 0.51
6 0.48
7 0.5
8 0.55
9 0.58
10 0.58
11 0.58
12 0.6
13 0.58
14 0.53
15 0.54
16 0.48
17 0.47
18 0.43
19 0.4
20 0.33
21 0.31
22 0.33
23 0.27
24 0.32
25 0.31
26 0.34
27 0.3
28 0.3
29 0.33
30 0.39
31 0.45
32 0.41
33 0.43
34 0.49
35 0.51
36 0.57
37 0.59
38 0.56
39 0.59
40 0.59
41 0.59
42 0.58
43 0.61
44 0.59
45 0.62
46 0.65
47 0.63
48 0.7
49 0.73
50 0.73
51 0.77
52 0.8
53 0.82
54 0.81
55 0.82
56 0.79
57 0.72
58 0.63
59 0.56
60 0.45
61 0.34
62 0.25
63 0.18
64 0.11
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.14
75 0.18
76 0.2
77 0.26
78 0.32
79 0.37
80 0.45
81 0.45
82 0.43
83 0.42
84 0.39
85 0.41
86 0.43
87 0.44
88 0.36
89 0.36
90 0.38
91 0.41
92 0.43
93 0.38
94 0.34
95 0.37
96 0.39
97 0.43
98 0.44
99 0.39
100 0.37
101 0.44
102 0.44
103 0.44
104 0.48
105 0.54
106 0.6
107 0.65
108 0.7
109 0.71
110 0.7
111 0.66
112 0.63
113 0.57
114 0.5
115 0.45
116 0.4
117 0.31
118 0.28
119 0.23
120 0.19
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.12
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.12
137 0.17
138 0.18
139 0.21
140 0.24
141 0.25
142 0.28
143 0.34
144 0.36
145 0.35
146 0.39
147 0.4
148 0.4
149 0.38
150 0.34
151 0.29
152 0.25
153 0.23
154 0.17
155 0.14
156 0.09
157 0.1
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.09
182 0.13
183 0.15
184 0.18
185 0.19
186 0.21
187 0.25
188 0.27
189 0.34
190 0.42
191 0.49
192 0.55
193 0.66
194 0.74
195 0.78
196 0.83
197 0.82
198 0.8
199 0.8
200 0.74
201 0.65
202 0.56
203 0.53
204 0.45
205 0.41
206 0.33
207 0.25
208 0.2
209 0.2
210 0.2
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.18
215 0.2
216 0.21
217 0.22
218 0.23
219 0.25
220 0.24
221 0.25
222 0.24
223 0.22
224 0.24
225 0.26
226 0.27
227 0.32
228 0.33
229 0.32
230 0.3
231 0.31
232 0.3
233 0.27
234 0.24
235 0.18
236 0.15
237 0.13
238 0.11
239 0.1
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.1
253 0.12
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.12
267 0.11
268 0.13
269 0.15
270 0.17
271 0.18
272 0.19
273 0.21
274 0.2
275 0.19
276 0.22
277 0.2
278 0.18
279 0.18
280 0.17
281 0.14
282 0.12
283 0.11
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.04
291 0.03
292 0.04
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.1
306 0.11
307 0.13
308 0.14
309 0.15
310 0.14
311 0.17
312 0.2
313 0.2
314 0.28
315 0.35
316 0.41
317 0.47
318 0.49
319 0.49
320 0.53
321 0.53
322 0.46
323 0.42
324 0.39
325 0.33
326 0.31
327 0.3
328 0.26
329 0.22
330 0.2
331 0.17
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.16
346 0.18
347 0.19
348 0.2
349 0.2
350 0.22
351 0.25
352 0.23
353 0.25
354 0.26
355 0.27
356 0.28
357 0.35
358 0.33
359 0.3
360 0.3
361 0.28
362 0.26
363 0.26
364 0.26
365 0.21
366 0.19
367 0.18
368 0.18
369 0.18
370 0.18
371 0.15
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.1
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.11
382 0.16
383 0.22
384 0.24
385 0.26
386 0.29
387 0.31
388 0.32
389 0.31
390 0.26
391 0.2
392 0.21
393 0.22
394 0.2
395 0.18
396 0.19
397 0.18
398 0.18
399 0.17
400 0.15
401 0.11
402 0.09
403 0.08
404 0.07
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.03
410 0.05
411 0.06
412 0.09
413 0.13
414 0.14
415 0.18
416 0.22
417 0.26
418 0.29
419 0.32
420 0.34
421 0.34
422 0.42
423 0.4
424 0.4
425 0.38
426 0.35
427 0.31
428 0.3
429 0.32
430 0.27
431 0.27
432 0.29
433 0.37
434 0.38
435 0.43
436 0.52
437 0.57
438 0.6
439 0.68
440 0.69
441 0.65
442 0.66
443 0.61
444 0.55
445 0.47
446 0.4
447 0.32
448 0.25
449 0.2
450 0.16
451 0.15
452 0.1
453 0.08
454 0.07
455 0.06
456 0.06
457 0.09
458 0.11
459 0.13
460 0.15
461 0.16
462 0.18
463 0.18
464 0.18
465 0.18
466 0.19
467 0.18
468 0.18
469 0.22
470 0.23
471 0.26
472 0.27
473 0.25
474 0.23
475 0.21
476 0.26
477 0.21
478 0.18
479 0.16
480 0.17
481 0.17
482 0.22
483 0.22
484 0.17
485 0.24
486 0.25
487 0.24
488 0.23