Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4X183

Protein Details
Accession Q4X183    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-44PASVRVARYEAKKRKKHSDDWGADNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-34KRK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 7, cyto 5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG afm:AFUA_2G10870  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MAFVPSASAFSLPLPSWQQPASVRVARYEAKKRKKHSDDWGADNGDGEGETTDGASEIAPIAPSLTLSPEEAHQYRVAGLSFDQELPGGLFPHAPAKSELPKKESRGDILESLSSLSPPIYPPQSSAYQGNLRLQHLAVITSILHRCLLQGDYIRAGRAWGLILREEFAGSPIDVRTDGRWGIGAEILLRRGRQAAENAPGIQPTGDGHESGGGHVSRPYFTRKGFEDAKHYYERLIVQHPYRKSAPDAICSLHFYPAMFGLWIYVVQEESTLAREDIHSRHEDSPGDFSEDEELGQVSDGESVSKHRKHHLITSVRARELEEAQQIAARMDEILVSPPYSDSPELLELRGMLSLWIGDLFVSCVPHQEEDEYDSDGRSSVREDTDHLHDSIQARRERRLAMEKRQSEILKSREFFEKARQRGRSVASTLEHFHIDDSASMASSGMGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.27
4 0.26
5 0.3
6 0.29
7 0.33
8 0.36
9 0.36
10 0.35
11 0.34
12 0.39
13 0.4
14 0.46
15 0.53
16 0.55
17 0.61
18 0.68
19 0.74
20 0.8
21 0.84
22 0.84
23 0.84
24 0.85
25 0.81
26 0.79
27 0.79
28 0.69
29 0.6
30 0.52
31 0.41
32 0.29
33 0.22
34 0.15
35 0.08
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.18
58 0.19
59 0.21
60 0.19
61 0.19
62 0.19
63 0.2
64 0.19
65 0.13
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.18
83 0.22
84 0.3
85 0.38
86 0.42
87 0.41
88 0.47
89 0.5
90 0.55
91 0.53
92 0.48
93 0.44
94 0.44
95 0.39
96 0.35
97 0.31
98 0.24
99 0.22
100 0.18
101 0.14
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.12
107 0.14
108 0.14
109 0.16
110 0.2
111 0.22
112 0.24
113 0.25
114 0.26
115 0.28
116 0.3
117 0.33
118 0.32
119 0.3
120 0.29
121 0.27
122 0.24
123 0.2
124 0.18
125 0.13
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.14
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.15
143 0.15
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.15
182 0.16
183 0.19
184 0.21
185 0.22
186 0.2
187 0.2
188 0.18
189 0.14
190 0.1
191 0.07
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.09
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.09
205 0.11
206 0.16
207 0.16
208 0.17
209 0.2
210 0.21
211 0.26
212 0.3
213 0.31
214 0.33
215 0.33
216 0.36
217 0.35
218 0.33
219 0.27
220 0.24
221 0.24
222 0.2
223 0.2
224 0.19
225 0.21
226 0.27
227 0.27
228 0.29
229 0.29
230 0.28
231 0.26
232 0.32
233 0.3
234 0.27
235 0.28
236 0.25
237 0.25
238 0.26
239 0.25
240 0.18
241 0.16
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.08
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.11
264 0.12
265 0.16
266 0.16
267 0.19
268 0.21
269 0.23
270 0.24
271 0.22
272 0.24
273 0.22
274 0.23
275 0.19
276 0.18
277 0.18
278 0.16
279 0.15
280 0.11
281 0.1
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.1
291 0.17
292 0.22
293 0.24
294 0.29
295 0.35
296 0.38
297 0.45
298 0.5
299 0.5
300 0.53
301 0.61
302 0.61
303 0.56
304 0.53
305 0.47
306 0.4
307 0.35
308 0.32
309 0.24
310 0.19
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.16
315 0.13
316 0.09
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.12
328 0.12
329 0.1
330 0.12
331 0.17
332 0.18
333 0.18
334 0.17
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.11
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.08
351 0.12
352 0.13
353 0.15
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.18
358 0.2
359 0.19
360 0.18
361 0.17
362 0.16
363 0.16
364 0.15
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.15
369 0.16
370 0.18
371 0.22
372 0.28
373 0.3
374 0.29
375 0.25
376 0.27
377 0.28
378 0.32
379 0.35
380 0.35
381 0.34
382 0.39
383 0.42
384 0.42
385 0.47
386 0.51
387 0.52
388 0.57
389 0.66
390 0.64
391 0.63
392 0.68
393 0.62
394 0.57
395 0.57
396 0.54
397 0.52
398 0.49
399 0.49
400 0.5
401 0.51
402 0.48
403 0.5
404 0.53
405 0.53
406 0.61
407 0.63
408 0.59
409 0.63
410 0.66
411 0.62
412 0.55
413 0.52
414 0.45
415 0.45
416 0.45
417 0.4
418 0.35
419 0.28
420 0.26
421 0.21
422 0.19
423 0.15
424 0.14
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.1