FuNGI

A0A0C9XTE0

Protein Details

Accession

A0A0C9XTE0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-35	MSTSPSRPKAPPTKPKKERERERERERKEKALQQS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-30	RPKAPPTKPKKERERERERERKEK
289-301	KPPKPARAPRAPP
366-376	KSRRERERERE
418-442	GKPAPPTSPRKGRRGSHGRGGGSGG
499-524	GRGGGGGPRRGRGGGGRGRGGAPRGG

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 11, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSTSPSRPKAPPTKPKKERERERERERKEKALQQSTERLKTVVRRLPPNLPEEVFWQSVQPWVTEEAVSWKVFYAGKARKRLSKENIPSRAYIAFKSEEKLAQFSREYDGHLFRDKAGNESYAIVEFAPYQKVPTEKRKPDVRNATIEKDEDYISFLESLNASANAEPPSLEALIASAQQPPPPKTTPLLEALKAEKSANKDKEAILRNHAHYKDQLPGAVARKDDKKKVPPAVQAQKVAEAAAVNKKAAGKKPQVAPTAAAVQNQKPGPAGLPKSVGNVPGPSNLGVKPPKPARAPRAPPAKPQNVVPTAIQQQPPGPSATPIPTSTQQQSPDGAATPTPRRARPVIGLASRQFEAALSGVGGGKSRREREREREKEREEGAVTPIAAVSPSLTSAPGLAQTPSIASTPAVNVKEAGKPAPPTSPRKGRRGSHGRGGGSGGGGVGRPPSAASAVNDTKVPGIIQRADGAGAGANAPLIIQKDVPVVGSPVVNIPMGGGRGGGGGPRRGRGGGGRGRGGAPRGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.91
3	0.92
4	0.92
5	0.93
6	0.93
7	0.94
8	0.93
9	0.94
10	0.94
11	0.92
12	0.91
13	0.86
14	0.85
15	0.82
16	0.8
17	0.79
18	0.79
19	0.75
20	0.71
21	0.75
22	0.73
23	0.71
24	0.63
25	0.53
26	0.48
27	0.51
28	0.54
29	0.51
30	0.5
31	0.52
32	0.56
33	0.64
34	0.65
35	0.61
36	0.57
37	0.51
38	0.45
39	0.41
40	0.4
41	0.33
42	0.28
43	0.25
44	0.2
45	0.23
46	0.23
47	0.19
48	0.16
49	0.16
50	0.17
51	0.16
52	0.16
53	0.18
54	0.21
55	0.2
56	0.19
57	0.16
58	0.18
59	0.19
60	0.2
61	0.24
62	0.29
63	0.37
64	0.46
65	0.5
66	0.55
67	0.61
68	0.7
69	0.69
70	0.71
71	0.74
72	0.75
73	0.8
74	0.74
75	0.68
76	0.61
77	0.57
78	0.48
79	0.38
80	0.32
81	0.27
82	0.26
83	0.27
84	0.27
85	0.25
86	0.25
87	0.28
88	0.25
89	0.26
90	0.26
91	0.26
92	0.27
93	0.25
94	0.27
95	0.26
96	0.29
97	0.28
98	0.31
99	0.31
100	0.27
101	0.33
102	0.3
103	0.29
104	0.27
105	0.25
106	0.21
107	0.22
108	0.21
109	0.15
110	0.15
111	0.11
112	0.09
113	0.09
114	0.1
115	0.11
116	0.1
117	0.11
118	0.13
119	0.19
120	0.24
121	0.34
122	0.44
123	0.48
124	0.56
125	0.65
126	0.67
127	0.73
128	0.77
129	0.71
130	0.7
131	0.68
132	0.65
133	0.58
134	0.53
135	0.44
136	0.35
137	0.3
138	0.21
139	0.18
140	0.14
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.08
150	0.08
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.1
158	0.09
159	0.07
160	0.06
161	0.07
162	0.08
163	0.08
164	0.09
165	0.09
166	0.12
167	0.16
168	0.18
169	0.22
170	0.24
171	0.26
172	0.25
173	0.27
174	0.28
175	0.31
176	0.31
177	0.27
178	0.27
179	0.27
180	0.26
181	0.25
182	0.22
183	0.18
184	0.2
185	0.29
186	0.3
187	0.3
188	0.31
189	0.31
190	0.39
191	0.43
192	0.39
193	0.36
194	0.38
195	0.39
196	0.44
197	0.43
198	0.37
199	0.33
200	0.33
201	0.31
202	0.26
203	0.24
204	0.18
205	0.21
206	0.23
207	0.23
208	0.22
209	0.2
210	0.27
211	0.31
212	0.37
213	0.4
214	0.44
215	0.49
216	0.56
217	0.59
218	0.58
219	0.63
220	0.65
221	0.63
222	0.58
223	0.51
224	0.45
225	0.39
226	0.32
227	0.23
228	0.14
229	0.12
230	0.13
231	0.13
232	0.11
233	0.12
234	0.15
235	0.17
236	0.21
237	0.26
238	0.27
239	0.32
240	0.38
241	0.44
242	0.44
243	0.41
244	0.38
245	0.33
246	0.34
247	0.29
248	0.25
249	0.2
250	0.19
251	0.22
252	0.21
253	0.2
254	0.14
255	0.14
256	0.13
257	0.16
258	0.17
259	0.14
260	0.16
261	0.16
262	0.19
263	0.19
264	0.19
265	0.15
266	0.15
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.12
271	0.13
272	0.12
273	0.17
274	0.18
275	0.17
276	0.23
277	0.25
278	0.3
279	0.34
280	0.39
281	0.42
282	0.5
283	0.55
284	0.56
285	0.63
286	0.59
287	0.62
288	0.65
289	0.63
290	0.54
291	0.51
292	0.51
293	0.42
294	0.42
295	0.34
296	0.3
297	0.28
298	0.32
299	0.3
300	0.23
301	0.23
302	0.23
303	0.24
304	0.21
305	0.17
306	0.14
307	0.15
308	0.16
309	0.16
310	0.16
311	0.18
312	0.18
313	0.22
314	0.24
315	0.26
316	0.26
317	0.25
318	0.25
319	0.22
320	0.21
321	0.18
322	0.16
323	0.13
324	0.15
325	0.17
326	0.23
327	0.26
328	0.26
329	0.3
330	0.32
331	0.34
332	0.34
333	0.37
334	0.36
335	0.36
336	0.39
337	0.36
338	0.37
339	0.34
340	0.29
341	0.22
342	0.16
343	0.13
344	0.09
345	0.08
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.12
353	0.17
354	0.23
355	0.29
356	0.36
357	0.44
358	0.53
359	0.64
360	0.7
361	0.73
362	0.77
363	0.74
364	0.74
365	0.68
366	0.62
367	0.52
368	0.43
369	0.37
370	0.29
371	0.25
372	0.18
373	0.16
374	0.11
375	0.1
376	0.08
377	0.06
378	0.04
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.08
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.1
392	0.1
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.11
397	0.17
398	0.17
399	0.16
400	0.17
401	0.19
402	0.22
403	0.23
404	0.22
405	0.2
406	0.22
407	0.23
408	0.31
409	0.35
410	0.39
411	0.47
412	0.56
413	0.59
414	0.65
415	0.72
416	0.68
417	0.73
418	0.76
419	0.73
420	0.72
421	0.73
422	0.65
423	0.57
424	0.54
425	0.43
426	0.33
427	0.26
428	0.17
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.09
438	0.11
439	0.12
440	0.2
441	0.22
442	0.23
443	0.23
444	0.23
445	0.22
446	0.2
447	0.19
448	0.13
449	0.16
450	0.18
451	0.19
452	0.19
453	0.19
454	0.19
455	0.18
456	0.16
457	0.12
458	0.1
459	0.08
460	0.07
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.07
465	0.08
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.12
470	0.13
471	0.14
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.13
478	0.14
479	0.13
480	0.12
481	0.11
482	0.12
483	0.12
484	0.12
485	0.09
486	0.08
487	0.09
488	0.09
489	0.12
490	0.13
491	0.2
492	0.22
493	0.25
494	0.27
495	0.27
496	0.29
497	0.32
498	0.38
499	0.39
500	0.43
501	0.44
502	0.44
503	0.46
504	0.47

A0A0C9XTE0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer