Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B5RTB9

Protein Details
Accession B5RTB9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-88LKNGKNKRTNTKSNGHQGDFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025762  DFDF  
IPR019050  FDF_dom  
IPR034107  Lsm16_N  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR004443  YjeF_N_dom  
IPR036652  YjeF_N_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0031087  P:deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
KEGG dha:DEHA2C14674g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09532  FDF  
PF03853  YjeF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51512  DFDF  
PS51385  YJEF_N  
CDD cd01737  LSm16_N  
Amino Acid Sequences MSEFLNYKVDLTLNDGSKSSGVITNVDNQQIVLSNAYQTTNPTQQLSNLKINSSQIADLKVVQLPPDMLKNGKNKRTNTKSNGHQGDFAIGGSPALLDDAIVFAKSSTPTSRDSSYKERNTHVTPKSSMTNSRSNTPRLKSNRIQQSASSAMTGDPDWGHEHEIQDIKHSNEFDFAANLAMFDKKSVFADFQKNDSVNPEDRLVGHNKSETNQNKNKKDKYDNDEMVLDVNKTDNWDLIGSSLSSKSKDSIDQIKSVPSNAHGYKEKSTISNMNKNFKLVNSQNLNIIPLCSPVQLLEIERLSTDSYGISPSIMVELCASNLSQLITTNILGGSTRLSKKKNHNLPPLVLLLIGSGRCGSRAFATGRHLTNHGVRVLAFVISNDDVDKELSTQWSLFEKCGGKVLTSSCAALINTINHELDTPVELIIDALQGYDDHLEDIFYQEEQQKELTRLMSWCNEPQQECKIMSLDIPSGIDGGSGTVSDPSLKLNCKWCVSMGLPITGLIHAYKNGHLAYDEDGQTLHYLVDVGIPNKVYISKGNLRKFDKFWFSAEYSIKLDVSTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.25
4 0.24
5 0.24
6 0.2
7 0.17
8 0.16
9 0.17
10 0.18
11 0.25
12 0.28
13 0.29
14 0.27
15 0.23
16 0.23
17 0.22
18 0.21
19 0.16
20 0.13
21 0.13
22 0.15
23 0.16
24 0.15
25 0.17
26 0.22
27 0.26
28 0.28
29 0.29
30 0.28
31 0.33
32 0.4
33 0.43
34 0.45
35 0.4
36 0.4
37 0.4
38 0.41
39 0.38
40 0.32
41 0.29
42 0.23
43 0.24
44 0.23
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.2
49 0.18
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.21
54 0.21
55 0.2
56 0.26
57 0.35
58 0.44
59 0.51
60 0.57
61 0.59
62 0.68
63 0.76
64 0.8
65 0.78
66 0.77
67 0.77
68 0.79
69 0.81
70 0.71
71 0.64
72 0.55
73 0.49
74 0.4
75 0.31
76 0.22
77 0.13
78 0.11
79 0.08
80 0.07
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.03
85 0.03
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.08
92 0.09
93 0.12
94 0.13
95 0.16
96 0.2
97 0.23
98 0.28
99 0.29
100 0.34
101 0.41
102 0.49
103 0.55
104 0.55
105 0.55
106 0.57
107 0.6
108 0.64
109 0.59
110 0.55
111 0.49
112 0.49
113 0.5
114 0.47
115 0.48
116 0.44
117 0.47
118 0.43
119 0.48
120 0.49
121 0.5
122 0.54
123 0.5
124 0.54
125 0.53
126 0.6
127 0.59
128 0.64
129 0.68
130 0.66
131 0.64
132 0.55
133 0.54
134 0.49
135 0.43
136 0.33
137 0.23
138 0.18
139 0.17
140 0.17
141 0.12
142 0.08
143 0.09
144 0.11
145 0.11
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.18
150 0.22
151 0.2
152 0.22
153 0.24
154 0.23
155 0.25
156 0.25
157 0.21
158 0.2
159 0.21
160 0.17
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.12
175 0.16
176 0.25
177 0.26
178 0.28
179 0.32
180 0.31
181 0.3
182 0.31
183 0.3
184 0.23
185 0.23
186 0.22
187 0.18
188 0.19
189 0.21
190 0.22
191 0.2
192 0.19
193 0.2
194 0.19
195 0.2
196 0.29
197 0.31
198 0.36
199 0.43
200 0.51
201 0.57
202 0.65
203 0.7
204 0.68
205 0.72
206 0.72
207 0.71
208 0.71
209 0.64
210 0.57
211 0.52
212 0.44
213 0.36
214 0.28
215 0.21
216 0.11
217 0.09
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.06
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.16
237 0.23
238 0.25
239 0.27
240 0.27
241 0.29
242 0.28
243 0.27
244 0.23
245 0.16
246 0.2
247 0.17
248 0.21
249 0.21
250 0.23
251 0.25
252 0.27
253 0.26
254 0.21
255 0.23
256 0.27
257 0.29
258 0.35
259 0.36
260 0.4
261 0.4
262 0.4
263 0.38
264 0.3
265 0.32
266 0.25
267 0.29
268 0.26
269 0.26
270 0.28
271 0.27
272 0.28
273 0.2
274 0.19
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.11
322 0.15
323 0.19
324 0.21
325 0.29
326 0.39
327 0.49
328 0.58
329 0.62
330 0.68
331 0.69
332 0.68
333 0.64
334 0.55
335 0.44
336 0.34
337 0.24
338 0.15
339 0.11
340 0.09
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.12
349 0.13
350 0.16
351 0.21
352 0.25
353 0.26
354 0.27
355 0.28
356 0.26
357 0.28
358 0.28
359 0.24
360 0.19
361 0.18
362 0.17
363 0.16
364 0.14
365 0.11
366 0.07
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.1
381 0.15
382 0.15
383 0.14
384 0.19
385 0.2
386 0.19
387 0.25
388 0.24
389 0.19
390 0.21
391 0.22
392 0.2
393 0.19
394 0.19
395 0.14
396 0.15
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.12
401 0.13
402 0.15
403 0.15
404 0.13
405 0.14
406 0.12
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.13
432 0.14
433 0.15
434 0.17
435 0.18
436 0.19
437 0.22
438 0.21
439 0.2
440 0.21
441 0.23
442 0.26
443 0.27
444 0.29
445 0.33
446 0.37
447 0.36
448 0.39
449 0.41
450 0.41
451 0.38
452 0.35
453 0.3
454 0.26
455 0.25
456 0.23
457 0.19
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.12
462 0.11
463 0.1
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.1
474 0.15
475 0.18
476 0.22
477 0.29
478 0.35
479 0.37
480 0.38
481 0.36
482 0.37
483 0.36
484 0.39
485 0.33
486 0.29
487 0.27
488 0.25
489 0.25
490 0.19
491 0.18
492 0.12
493 0.11
494 0.12
495 0.13
496 0.14
497 0.17
498 0.17
499 0.17
500 0.17
501 0.17
502 0.19
503 0.23
504 0.23
505 0.19
506 0.19
507 0.19
508 0.19
509 0.18
510 0.14
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.12
515 0.14
516 0.14
517 0.16
518 0.17
519 0.17
520 0.18
521 0.19
522 0.16
523 0.17
524 0.24
525 0.31
526 0.4
527 0.48
528 0.56
529 0.61
530 0.65
531 0.66
532 0.67
533 0.66
534 0.59
535 0.54
536 0.53
537 0.49
538 0.5
539 0.49
540 0.44
541 0.37
542 0.37
543 0.34