FuNGI

A0A0C9XYF3

Protein Details

Accession

A0A0C9XYF3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-31	SMLFHPKKGTKQEKSSTPKPVP	Hydrophilic
155-174	KGVANGKKRFQKKTRQVFFV	Hydrophilic
560-585	VASPNAAQPPKPKKRKGHPAGPVPVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
149-167	KGKDKGKGVANGKKRFQKK
569-578	PKPKKRKGHP

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAPKAQPSLSMLFHPKKGTKQEKSSTPKPVPSNSRLKPFQEEDEDELKLPDGPFQDFRLLSSALNGWKYDVIKFDSRKPVEISKWTAPIKLNRKDLRRDEGVTNGAPEAVGPMLGPDGKPVVGADGKMVMVDVDGRPINTRDGSLGTGKGKDKGKGVANGKKRFQKKTRQVFFVPEEVRQLRREERYPWVMEDSSPTHNELWTGQMEDASKSETHAFFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKRLKHDLPTDTAKVESLYNLSQKRDPQAWLASRNGGKGPSAATSAMFKAEAEGRIGNPVVASEGQSLGPGGRKLKTVDSGMNGLFDDEDDGAQRRKEKELGEEGDLDEQVYEEDFADDEEKMDLDEHDEEAKELEERLKREYKAANKQRDTGVDDSDEKEEPTKSKQAKAMQKMIRNREGNDAYESDEDKNPYASSEEEEEEEEELPVPTGPAIQQQQVDSSLNTPKPHPNRPNVISKPGSRATSPSNLPGLGGHTMVAKRATSPKVPKPKPVGSASGGNSPLGSRANSPVAGSRATSPARLDSINGSQKKRKADDSLNSTVASPNAAQPPKPKKRKGHPAGPVPVAVSPAELEMMLVEWLKNTPNATTRDCIQHFTPYLTDGDKKTGFSAMVRKVAQLKGGVLALRTIVT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.47
3	0.51
4	0.6
5	0.65
6	0.66
7	0.71
8	0.75
9	0.79
10	0.83
11	0.83
12	0.83
13	0.79
14	0.77
15	0.73
16	0.74
17	0.73
18	0.72
19	0.75
20	0.71
21	0.73
22	0.71
23	0.69
24	0.68
25	0.63
26	0.62
27	0.59
28	0.57
29	0.54
30	0.52
31	0.49
32	0.41
33	0.37
34	0.3
35	0.26
36	0.21
37	0.19
38	0.17
39	0.2
40	0.22
41	0.24
42	0.3
43	0.27
44	0.28
45	0.28
46	0.26
47	0.22
48	0.22
49	0.24
50	0.21
51	0.23
52	0.22
53	0.2
54	0.22
55	0.24
56	0.23
57	0.23
58	0.25
59	0.31
60	0.34
61	0.42
62	0.48
63	0.49
64	0.51
65	0.52
66	0.54
67	0.52
68	0.56
69	0.55
70	0.5
71	0.56
72	0.53
73	0.53
74	0.51
75	0.54
76	0.57
77	0.58
78	0.62
79	0.62
80	0.68
81	0.73
82	0.75
83	0.73
84	0.69
85	0.65
86	0.58
87	0.56
88	0.53
89	0.44
90	0.38
91	0.3
92	0.24
93	0.19
94	0.16
95	0.12
96	0.07
97	0.06
98	0.05
99	0.05
100	0.06
101	0.07
102	0.07
103	0.07
104	0.09
105	0.08
106	0.09
107	0.09
108	0.11
109	0.11
110	0.12
111	0.11
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.07
117	0.06
118	0.08
119	0.07
120	0.1
121	0.1
122	0.11
123	0.13
124	0.15
125	0.18
126	0.16
127	0.16
128	0.14
129	0.16
130	0.17
131	0.17
132	0.2
133	0.19
134	0.23
135	0.24
136	0.28
137	0.3
138	0.31
139	0.31
140	0.34
141	0.38
142	0.41
143	0.48
144	0.5
145	0.57
146	0.62
147	0.66
148	0.68
149	0.7
150	0.71
151	0.72
152	0.75
153	0.76
154	0.79
155	0.81
156	0.79
157	0.74
158	0.72
159	0.67
160	0.64
161	0.55
162	0.44
163	0.43
164	0.38
165	0.38
166	0.33
167	0.34
168	0.31
169	0.35
170	0.38
171	0.35
172	0.4
173	0.44
174	0.44
175	0.42
176	0.4
177	0.34
178	0.31
179	0.31
180	0.27
181	0.24
182	0.23
183	0.23
184	0.19
185	0.19
186	0.19
187	0.16
188	0.15
189	0.12
190	0.13
191	0.11
192	0.13
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.12
197	0.11
198	0.11
199	0.15
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.15
204	0.14
205	0.15
206	0.15
207	0.13
208	0.13
209	0.12
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.1
214	0.11
215	0.1
216	0.18
217	0.21
218	0.27
219	0.27
220	0.34
221	0.39
222	0.48
223	0.58
224	0.57
225	0.62
226	0.65
227	0.73
228	0.72
229	0.76
230	0.7
231	0.65
232	0.62
233	0.58
234	0.51
235	0.42
236	0.36
237	0.27
238	0.23
239	0.18
240	0.13
241	0.1
242	0.11
243	0.16
244	0.18
245	0.19
246	0.21
247	0.23
248	0.27
249	0.27
250	0.27
251	0.25
252	0.3
253	0.32
254	0.32
255	0.31
256	0.33
257	0.31
258	0.3
259	0.28
260	0.21
261	0.18
262	0.15
263	0.14
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.07
273	0.07
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.11
281	0.1
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.06
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.13
299	0.15
300	0.18
301	0.18
302	0.18
303	0.18
304	0.19
305	0.18
306	0.17
307	0.15
308	0.12
309	0.09
310	0.07
311	0.07
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.12
319	0.13
320	0.15
321	0.18
322	0.19
323	0.23
324	0.28
325	0.3
326	0.28
327	0.27
328	0.26
329	0.23
330	0.21
331	0.16
332	0.09
333	0.07
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.07
358	0.07
359	0.11
360	0.13
361	0.14
362	0.2
363	0.25
364	0.25
365	0.29
366	0.35
367	0.39
368	0.47
369	0.55
370	0.59
371	0.56
372	0.59
373	0.57
374	0.54
375	0.5
376	0.4
377	0.33
378	0.25
379	0.24
380	0.23
381	0.22
382	0.2
383	0.15
384	0.15
385	0.15
386	0.14
387	0.17
388	0.24
389	0.25
390	0.29
391	0.34
392	0.41
393	0.49
394	0.54
395	0.6
396	0.57
397	0.62
398	0.65
399	0.66
400	0.66
401	0.59
402	0.54
403	0.53
404	0.49
405	0.44
406	0.39
407	0.33
408	0.27
409	0.26
410	0.26
411	0.2
412	0.2
413	0.19
414	0.17
415	0.17
416	0.15
417	0.13
418	0.13
419	0.12
420	0.11
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.14
425	0.14
426	0.14
427	0.13
428	0.11
429	0.09
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.1
438	0.12
439	0.14
440	0.16
441	0.16
442	0.18
443	0.2
444	0.2
445	0.15
446	0.16
447	0.2
448	0.22
449	0.23
450	0.24
451	0.31
452	0.37
453	0.47
454	0.52
455	0.54
456	0.6
457	0.63
458	0.71
459	0.66
460	0.67
461	0.62
462	0.56
463	0.55
464	0.5
465	0.48
466	0.38
467	0.37
468	0.34
469	0.36
470	0.35
471	0.32
472	0.29
473	0.27
474	0.27
475	0.24
476	0.22
477	0.16
478	0.14
479	0.11
480	0.12
481	0.12
482	0.14
483	0.15
484	0.12
485	0.14
486	0.21
487	0.24
488	0.29
489	0.37
490	0.45
491	0.55
492	0.59
493	0.64
494	0.66
495	0.69
496	0.68
497	0.64
498	0.6
499	0.52
500	0.56
501	0.49
502	0.47
503	0.4
504	0.34
505	0.29
506	0.24
507	0.23
508	0.18
509	0.16
510	0.12
511	0.16
512	0.19
513	0.19
514	0.2
515	0.22
516	0.22
517	0.22
518	0.21
519	0.19
520	0.22
521	0.23
522	0.24
523	0.21
524	0.22
525	0.23
526	0.23
527	0.22
528	0.2
529	0.28
530	0.35
531	0.39
532	0.42
533	0.47
534	0.51
535	0.58
536	0.59
537	0.56
538	0.55
539	0.59
540	0.63
541	0.64
542	0.66
543	0.6
544	0.56
545	0.5
546	0.43
547	0.34
548	0.26
549	0.18
550	0.17
551	0.23
552	0.25
553	0.26
554	0.35
555	0.46
556	0.55
557	0.64
558	0.69
559	0.71
560	0.8
561	0.9
562	0.9
563	0.89
564	0.88
565	0.88
566	0.86
567	0.78
568	0.68
569	0.58
570	0.49
571	0.4
572	0.3
573	0.2
574	0.13
575	0.11
576	0.1
577	0.08
578	0.07
579	0.06
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.06
584	0.07
585	0.08
586	0.1
587	0.12
588	0.12
589	0.15
590	0.21
591	0.27
592	0.3
593	0.33
594	0.35
595	0.43
596	0.44
597	0.44
598	0.4
599	0.43
600	0.4
601	0.4
602	0.37
603	0.3
604	0.3
605	0.3
606	0.32
607	0.26
608	0.31
609	0.3
610	0.3
611	0.29
612	0.3
613	0.27
614	0.27
615	0.34
616	0.33
617	0.39
618	0.38
619	0.4
620	0.43
621	0.44
622	0.43
623	0.37
624	0.32
625	0.27
626	0.29
627	0.27
628	0.21
629	0.2

A0A0C9XYF3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer