Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9WHD8

Protein Details
Accession A0A0C9WHD8    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-270AEKKVEEKEEKKKRRNDKEALENAEKEEKKKRRKDKEVEEEKEQEBasic
277-323VAEDTERKSKKEKKRKNKEESEEAAGPKEERKSKKDKKKEEDAPETEBasic
349-372TAEVGSREKKKTKKAKVEEANADVHydrophilic
392-415MDVDPVPEKKRKEKKEKKRSMAGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-140RGRG
213-261EKGGKKKRGEEKEAEKKVEEKEEKKKRRNDKEALENAEKEEKKKRRKDK
283-315RKSKKEKKRKNKEESEEAAGPKEERKSKKDKKK
333-364EKKKRKRAAEEAGRETTAEVGSREKKKTKKAK
399-412EKKRKEKKEKKRSM
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_mito 11.5, nucl 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MTGRLRTWAVGSWIYIAQTSSSFFLRLLVFLDGMVSFQCHTCGDVVKKPKLDTHRSRCHGGFDCIDCSTTFNTPAEYKGHTKCISEAEKYQKSLYKGPKTGTSGPKNNYPPQPPAEGGSWNQNQNHSSRGGFGARGRGRGRGGGNGWGRPMSYGTGANDTPLGTPTRASSPVVPVEPVSEMSVKVPEMNGAGGKAKEVDVDVPSSPVKGEEAEKGGKKKRGEEKEAEKKVEEKEEKKKRRNDKEALENAEKEEKKKRRKDKEVEEEKEQEPAKDEVVAEDTERKSKKEKKRKNKEESEEAAGPKEERKSKKDKKKEEDAPETETNGVEVNGGEKKKRKRAAEEAGRETTAEVGSREKKKTKKAKVEEANADVDMEGVEETRHKEKESKSDAMDVDPVPEKKRKEKKEKKRSMAGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.17
4 0.14
5 0.13
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.13
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.18
30 0.22
31 0.3
32 0.38
33 0.44
34 0.48
35 0.49
36 0.54
37 0.56
38 0.62
39 0.65
40 0.67
41 0.71
42 0.71
43 0.76
44 0.7
45 0.69
46 0.63
47 0.57
48 0.52
49 0.44
50 0.43
51 0.37
52 0.37
53 0.29
54 0.25
55 0.23
56 0.19
57 0.19
58 0.16
59 0.18
60 0.18
61 0.21
62 0.21
63 0.23
64 0.27
65 0.28
66 0.36
67 0.35
68 0.35
69 0.35
70 0.41
71 0.41
72 0.39
73 0.42
74 0.44
75 0.47
76 0.48
77 0.49
78 0.46
79 0.45
80 0.5
81 0.53
82 0.52
83 0.51
84 0.52
85 0.55
86 0.57
87 0.62
88 0.63
89 0.62
90 0.6
91 0.59
92 0.65
93 0.64
94 0.65
95 0.64
96 0.58
97 0.55
98 0.5
99 0.51
100 0.43
101 0.4
102 0.35
103 0.3
104 0.27
105 0.3
106 0.3
107 0.3
108 0.31
109 0.31
110 0.3
111 0.29
112 0.3
113 0.24
114 0.2
115 0.18
116 0.19
117 0.18
118 0.18
119 0.19
120 0.26
121 0.26
122 0.31
123 0.31
124 0.31
125 0.31
126 0.33
127 0.33
128 0.28
129 0.28
130 0.3
131 0.31
132 0.29
133 0.29
134 0.24
135 0.23
136 0.19
137 0.18
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.16
158 0.18
159 0.18
160 0.17
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.12
199 0.15
200 0.18
201 0.23
202 0.28
203 0.32
204 0.32
205 0.38
206 0.44
207 0.49
208 0.53
209 0.56
210 0.61
211 0.66
212 0.7
213 0.63
214 0.54
215 0.49
216 0.45
217 0.46
218 0.41
219 0.37
220 0.43
221 0.53
222 0.62
223 0.68
224 0.74
225 0.76
226 0.81
227 0.85
228 0.83
229 0.8
230 0.8
231 0.79
232 0.77
233 0.69
234 0.58
235 0.5
236 0.5
237 0.42
238 0.35
239 0.38
240 0.4
241 0.47
242 0.57
243 0.66
244 0.69
245 0.79
246 0.86
247 0.87
248 0.9
249 0.9
250 0.85
251 0.81
252 0.75
253 0.64
254 0.6
255 0.49
256 0.38
257 0.3
258 0.27
259 0.21
260 0.18
261 0.17
262 0.12
263 0.14
264 0.14
265 0.11
266 0.16
267 0.16
268 0.21
269 0.23
270 0.24
271 0.3
272 0.4
273 0.5
274 0.56
275 0.66
276 0.71
277 0.82
278 0.91
279 0.94
280 0.94
281 0.91
282 0.9
283 0.83
284 0.79
285 0.72
286 0.62
287 0.52
288 0.42
289 0.35
290 0.28
291 0.3
292 0.31
293 0.32
294 0.38
295 0.48
296 0.58
297 0.68
298 0.76
299 0.8
300 0.81
301 0.86
302 0.89
303 0.88
304 0.87
305 0.8
306 0.77
307 0.68
308 0.6
309 0.5
310 0.4
311 0.3
312 0.2
313 0.17
314 0.1
315 0.08
316 0.09
317 0.13
318 0.15
319 0.19
320 0.27
321 0.36
322 0.45
323 0.53
324 0.57
325 0.61
326 0.7
327 0.77
328 0.8
329 0.8
330 0.77
331 0.73
332 0.66
333 0.57
334 0.46
335 0.37
336 0.27
337 0.19
338 0.13
339 0.17
340 0.25
341 0.31
342 0.38
343 0.44
344 0.51
345 0.61
346 0.71
347 0.75
348 0.78
349 0.81
350 0.85
351 0.87
352 0.89
353 0.86
354 0.79
355 0.71
356 0.6
357 0.5
358 0.39
359 0.29
360 0.19
361 0.12
362 0.08
363 0.05
364 0.06
365 0.08
366 0.12
367 0.18
368 0.2
369 0.22
370 0.29
371 0.35
372 0.45
373 0.51
374 0.53
375 0.5
376 0.56
377 0.54
378 0.49
379 0.48
380 0.38
381 0.34
382 0.35
383 0.34
384 0.32
385 0.38
386 0.41
387 0.47
388 0.57
389 0.64
390 0.69
391 0.78
392 0.84
393 0.89
394 0.95
395 0.94