Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9YHI8

Protein Details
Accession A0A0C9YHI8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
201-228ELTAPKKKGRPTKRDKAKKARKALNELEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-222PKKKGRPTKRDKAKKARK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MSLAPAPTATRGEIVLQPNYFTSSIYVQALRDDISTLIHRYHEAYTNAQCVQPFPLFKSIWCSQGWHWLIFKVFDRRTRDKFLDTTLRLFLERMTKTESLFTQIVALFGLYTFFYSQPKGTSPPLYGVNNIPIPLDQYVWLRSFPETLTTPLLQPSVVFILTKLLNDQVFFIVPRSDLGTLNPRDLPREIFVDERSVDAVELTAPKKKGRPTKRDKAKKARKALNELEEWLTQEPLTGSTTAMDEYQSFKQELMATVDHSAIEKANGLVHERLKMAQAVVTMGTGGDWGIERVERAISEMTSTGSFGVLSLLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.26
4 0.26
5 0.26
6 0.29
7 0.26
8 0.2
9 0.19
10 0.16
11 0.18
12 0.2
13 0.2
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.17
18 0.15
19 0.14
20 0.11
21 0.13
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.21
29 0.24
30 0.25
31 0.28
32 0.3
33 0.33
34 0.33
35 0.32
36 0.29
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.23
41 0.22
42 0.28
43 0.27
44 0.27
45 0.34
46 0.31
47 0.31
48 0.3
49 0.3
50 0.24
51 0.34
52 0.36
53 0.3
54 0.29
55 0.28
56 0.28
57 0.28
58 0.31
59 0.3
60 0.32
61 0.37
62 0.44
63 0.5
64 0.54
65 0.6
66 0.58
67 0.53
68 0.51
69 0.51
70 0.52
71 0.46
72 0.43
73 0.38
74 0.35
75 0.31
76 0.29
77 0.24
78 0.23
79 0.22
80 0.21
81 0.24
82 0.24
83 0.24
84 0.27
85 0.25
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.12
93 0.12
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.17
108 0.19
109 0.19
110 0.21
111 0.24
112 0.23
113 0.23
114 0.21
115 0.22
116 0.2
117 0.19
118 0.16
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.11
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.12
133 0.11
134 0.12
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.1
166 0.18
167 0.18
168 0.2
169 0.22
170 0.21
171 0.22
172 0.23
173 0.23
174 0.17
175 0.19
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.17
181 0.15
182 0.14
183 0.12
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.13
191 0.14
192 0.16
193 0.21
194 0.28
195 0.37
196 0.45
197 0.55
198 0.61
199 0.71
200 0.8
201 0.87
202 0.9
203 0.92
204 0.92
205 0.91
206 0.91
207 0.89
208 0.85
209 0.83
210 0.79
211 0.74
212 0.65
213 0.58
214 0.51
215 0.42
216 0.37
217 0.28
218 0.22
219 0.15
220 0.14
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.11
233 0.14
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.18
238 0.19
239 0.2
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.19
244 0.19
245 0.17
246 0.15
247 0.14
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.1
253 0.11
254 0.14
255 0.18
256 0.19
257 0.22
258 0.22
259 0.22
260 0.22
261 0.22
262 0.19
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.14
284 0.13
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.08