Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0C9Y1T8

Protein Details
Accession A0A0C9Y1T8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-105LDYRPQRSKEPTPDKPDRTRVIHydrophilic
695-717QQPPQQIKQPPPPQQPQPQQQLHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASYNRTRYAEELLEKTESQPPSFTIHLHPDYWVLNNGSKFLYHNQIASLLDDIQAHRIPVDFLELFDSAKVPFYDGCMVVELLDYRPQRSKEPTPDKPDRTRVILHPNPETLWTDICAMNKSHGNKWTDKDALEIEAKLLASTSPPLCLDPDPHLTRIANHVLRVSTPTVPISLKRKAVALEPEEDETEKIRRAKIMAYMTPRLNRNHAPSYRLLDAVNSTRRAKTAQGAPTQIPGHQYMSTPPQPSPAPPTPASMAQHAHSPDNSPDKTAIKIKIRPDTPQMPTGFARANGSHTPIPPQPTHQFVHQLAPQPTPAPGANSPMQPKVYANVQAATEAANRSATPSQLTSQQGLQHHTQLNLLQQQQQQQLVQQQLQLSQQQSQHTSLPQQQQQHPQHLQQQQRQMYTQSPKPPQASTGPQMYPQATPQTHPTSIPNFPQPNFQFAQPLQVPRNPNNVPVAAQQPQQPQSQPPPPNSQNANAQPQQFSLPYMNYQHHIAQNAVQMAQQQADANQKRNQKVTQQQPQKNGRATPQLSAAVANLSRGKATPSPVRSSPMVANQQLAGRSPMVPNQQLAPRSPMPPSAQQSPQMQQQQQHPQRQQPQQTQQQLQFPQYNSPSHLRPGTAEGHASSPQLQAQIAAAASQLRANANARVNARATPSPALNAPAATATSVAAAMVPTADGQQQQLANAPQQQPPQQIKQPPPPQQPQPQQQLHPQMHAAYQQQLYGFQLSQMNYQVAQAQGRILPYWQPMSAAGMGRGMPMQGMGGPAHPPHPHPQAAAAQQVVGKQAAVPGGVPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.38
4 0.38
5 0.34
6 0.3
7 0.28
8 0.27
9 0.28
10 0.29
11 0.29
12 0.27
13 0.34
14 0.36
15 0.35
16 0.34
17 0.31
18 0.32
19 0.32
20 0.31
21 0.25
22 0.27
23 0.27
24 0.28
25 0.26
26 0.25
27 0.25
28 0.25
29 0.3
30 0.27
31 0.27
32 0.26
33 0.28
34 0.28
35 0.26
36 0.23
37 0.16
38 0.16
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.19
49 0.15
50 0.14
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.17
56 0.11
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.15
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.16
68 0.17
69 0.15
70 0.12
71 0.19
72 0.18
73 0.2
74 0.27
75 0.29
76 0.33
77 0.4
78 0.48
79 0.53
80 0.62
81 0.68
82 0.71
83 0.8
84 0.82
85 0.83
86 0.82
87 0.76
88 0.71
89 0.67
90 0.63
91 0.64
92 0.6
93 0.57
94 0.52
95 0.49
96 0.45
97 0.42
98 0.38
99 0.29
100 0.25
101 0.22
102 0.2
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.21
108 0.25
109 0.28
110 0.31
111 0.35
112 0.39
113 0.42
114 0.45
115 0.49
116 0.46
117 0.42
118 0.4
119 0.35
120 0.34
121 0.3
122 0.26
123 0.19
124 0.18
125 0.17
126 0.14
127 0.13
128 0.09
129 0.08
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.19
138 0.2
139 0.28
140 0.29
141 0.3
142 0.32
143 0.31
144 0.31
145 0.34
146 0.37
147 0.31
148 0.28
149 0.3
150 0.27
151 0.27
152 0.29
153 0.26
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.23
160 0.26
161 0.3
162 0.31
163 0.3
164 0.32
165 0.3
166 0.34
167 0.37
168 0.34
169 0.32
170 0.3
171 0.31
172 0.3
173 0.29
174 0.25
175 0.19
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.21
181 0.22
182 0.24
183 0.29
184 0.33
185 0.34
186 0.37
187 0.41
188 0.43
189 0.47
190 0.48
191 0.44
192 0.43
193 0.42
194 0.43
195 0.47
196 0.46
197 0.45
198 0.44
199 0.46
200 0.43
201 0.39
202 0.32
203 0.24
204 0.25
205 0.27
206 0.29
207 0.28
208 0.28
209 0.28
210 0.29
211 0.29
212 0.28
213 0.28
214 0.31
215 0.34
216 0.37
217 0.39
218 0.39
219 0.42
220 0.4
221 0.35
222 0.29
223 0.24
224 0.21
225 0.19
226 0.19
227 0.17
228 0.23
229 0.27
230 0.26
231 0.25
232 0.26
233 0.26
234 0.27
235 0.33
236 0.31
237 0.32
238 0.31
239 0.34
240 0.32
241 0.35
242 0.35
243 0.3
244 0.26
245 0.21
246 0.24
247 0.23
248 0.23
249 0.19
250 0.2
251 0.21
252 0.27
253 0.26
254 0.23
255 0.25
256 0.25
257 0.27
258 0.3
259 0.33
260 0.32
261 0.38
262 0.42
263 0.47
264 0.47
265 0.47
266 0.48
267 0.49
268 0.45
269 0.46
270 0.42
271 0.37
272 0.36
273 0.35
274 0.3
275 0.23
276 0.22
277 0.17
278 0.2
279 0.18
280 0.21
281 0.21
282 0.2
283 0.23
284 0.23
285 0.27
286 0.23
287 0.28
288 0.26
289 0.29
290 0.3
291 0.28
292 0.31
293 0.28
294 0.32
295 0.3
296 0.34
297 0.31
298 0.31
299 0.29
300 0.24
301 0.23
302 0.21
303 0.18
304 0.15
305 0.13
306 0.17
307 0.18
308 0.21
309 0.23
310 0.23
311 0.23
312 0.2
313 0.2
314 0.17
315 0.18
316 0.19
317 0.18
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.13
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.1
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.17
335 0.18
336 0.17
337 0.18
338 0.22
339 0.22
340 0.24
341 0.24
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.22
346 0.19
347 0.2
348 0.21
349 0.21
350 0.21
351 0.22
352 0.26
353 0.28
354 0.28
355 0.25
356 0.23
357 0.26
358 0.23
359 0.21
360 0.18
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.19
365 0.16
366 0.18
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.21
371 0.21
372 0.19
373 0.22
374 0.24
375 0.27
376 0.29
377 0.32
378 0.35
379 0.44
380 0.46
381 0.51
382 0.47
383 0.44
384 0.48
385 0.5
386 0.52
387 0.47
388 0.52
389 0.48
390 0.47
391 0.45
392 0.38
393 0.37
394 0.35
395 0.35
396 0.35
397 0.35
398 0.38
399 0.39
400 0.38
401 0.35
402 0.34
403 0.34
404 0.29
405 0.3
406 0.26
407 0.26
408 0.27
409 0.26
410 0.22
411 0.19
412 0.22
413 0.17
414 0.18
415 0.21
416 0.24
417 0.23
418 0.23
419 0.25
420 0.23
421 0.25
422 0.27
423 0.29
424 0.27
425 0.27
426 0.35
427 0.33
428 0.33
429 0.32
430 0.3
431 0.26
432 0.23
433 0.3
434 0.23
435 0.26
436 0.24
437 0.27
438 0.3
439 0.29
440 0.38
441 0.32
442 0.32
443 0.31
444 0.29
445 0.26
446 0.25
447 0.25
448 0.19
449 0.2
450 0.23
451 0.25
452 0.27
453 0.27
454 0.26
455 0.26
456 0.3
457 0.37
458 0.37
459 0.37
460 0.43
461 0.43
462 0.48
463 0.47
464 0.43
465 0.43
466 0.43
467 0.46
468 0.4
469 0.39
470 0.34
471 0.33
472 0.32
473 0.24
474 0.21
475 0.16
476 0.14
477 0.14
478 0.17
479 0.17
480 0.16
481 0.18
482 0.2
483 0.2
484 0.2
485 0.19
486 0.18
487 0.2
488 0.19
489 0.17
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.11
495 0.08
496 0.09
497 0.18
498 0.21
499 0.25
500 0.29
501 0.36
502 0.38
503 0.42
504 0.43
505 0.42
506 0.48
507 0.54
508 0.59
509 0.63
510 0.65
511 0.71
512 0.76
513 0.74
514 0.69
515 0.62
516 0.56
517 0.55
518 0.5
519 0.42
520 0.38
521 0.32
522 0.28
523 0.26
524 0.22
525 0.15
526 0.13
527 0.13
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.13
533 0.13
534 0.18
535 0.24
536 0.27
537 0.32
538 0.33
539 0.36
540 0.34
541 0.35
542 0.33
543 0.33
544 0.35
545 0.31
546 0.3
547 0.28
548 0.29
549 0.26
550 0.24
551 0.18
552 0.13
553 0.14
554 0.14
555 0.17
556 0.2
557 0.21
558 0.21
559 0.23
560 0.26
561 0.27
562 0.27
563 0.29
564 0.27
565 0.28
566 0.28
567 0.29
568 0.29
569 0.34
570 0.37
571 0.37
572 0.37
573 0.4
574 0.43
575 0.42
576 0.45
577 0.45
578 0.44
579 0.42
580 0.47
581 0.54
582 0.58
583 0.64
584 0.61
585 0.62
586 0.69
587 0.73
588 0.74
589 0.73
590 0.74
591 0.74
592 0.78
593 0.75
594 0.7
595 0.69
596 0.63
597 0.58
598 0.54
599 0.45
600 0.44
601 0.41
602 0.39
603 0.35
604 0.37
605 0.34
606 0.33
607 0.34
608 0.28
609 0.26
610 0.28
611 0.27
612 0.25
613 0.24
614 0.2
615 0.21
616 0.22
617 0.21
618 0.18
619 0.16
620 0.16
621 0.15
622 0.14
623 0.12
624 0.11
625 0.12
626 0.1
627 0.09
628 0.08
629 0.07
630 0.08
631 0.08
632 0.09
633 0.08
634 0.11
635 0.13
636 0.18
637 0.21
638 0.26
639 0.26
640 0.28
641 0.29
642 0.29
643 0.32
644 0.28
645 0.28
646 0.26
647 0.26
648 0.24
649 0.24
650 0.25
651 0.21
652 0.18
653 0.16
654 0.13
655 0.13
656 0.11
657 0.1
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.06
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.05
669 0.07
670 0.07
671 0.08
672 0.12
673 0.13
674 0.13
675 0.18
676 0.19
677 0.2
678 0.27
679 0.29
680 0.3
681 0.35
682 0.39
683 0.44
684 0.48
685 0.52
686 0.53
687 0.58
688 0.62
689 0.67
690 0.72
691 0.74
692 0.77
693 0.77
694 0.78
695 0.81
696 0.83
697 0.81
698 0.82
699 0.78
700 0.73
701 0.74
702 0.75
703 0.67
704 0.61
705 0.53
706 0.44
707 0.4
708 0.4
709 0.34
710 0.29
711 0.28
712 0.26
713 0.24
714 0.24
715 0.24
716 0.22
717 0.19
718 0.16
719 0.2
720 0.2
721 0.22
722 0.24
723 0.23
724 0.2
725 0.21
726 0.21
727 0.19
728 0.19
729 0.17
730 0.16
731 0.17
732 0.18
733 0.18
734 0.16
735 0.18
736 0.21
737 0.24
738 0.22
739 0.21
740 0.2
741 0.24
742 0.26
743 0.24
744 0.2
745 0.19
746 0.19
747 0.18
748 0.18
749 0.14
750 0.1
751 0.08
752 0.08
753 0.07
754 0.09
755 0.09
756 0.1
757 0.12
758 0.13
759 0.18
760 0.19
761 0.22
762 0.28
763 0.34
764 0.36
765 0.34
766 0.39
767 0.42
768 0.44
769 0.45
770 0.38
771 0.32
772 0.31
773 0.31
774 0.28
775 0.21
776 0.17
777 0.13
778 0.14
779 0.14
780 0.13
781 0.12