Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9Y1T8

Protein Details
Accession A0A0C9Y1T8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-105LDYRPQRSKEPTPDKPDRTRVIHydrophilic
695-717QQPPQQIKQPPPPQQPQPQQQLHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASYNRTRYAEELLEKTESQPPSFTIHLHPDYWVLNNGSKFLYHNQIASLLDDIQAHRIPVDFLELFDSAKVPFYDGCMVVELLDYRPQRSKEPTPDKPDRTRVILHPNPETLWTDICAMNKSHGNKWTDKDALEIEAKLLASTSPPLCLDPDPHLTRIANHVLRVSTPTVPISLKRKAVALEPEEDETEKIRRAKIMAYMTPRLNRNHAPSYRLLDAVNSTRRAKTAQGAPTQIPGHQYMSTPPQPSPAPPTPASMAQHAHSPDNSPDKTAIKIKIRPDTPQMPTGFARANGSHTPIPPQPTHQFVHQLAPQPTPAPGANSPMQPKVYANVQAATEAANRSATPSQLTSQQGLQHHTQLNLLQQQQQQQLVQQQLQLSQQQSQHTSLPQQQQQHPQHLQQQQRQMYTQSPKPPQASTGPQMYPQATPQTHPTSIPNFPQPNFQFAQPLQVPRNPNNVPVAAQQPQQPQSQPPPPNSQNANAQPQQFSLPYMNYQHHIAQNAVQMAQQQADANQKRNQKVTQQQPQKNGRATPQLSAAVANLSRGKATPSPVRSSPMVANQQLAGRSPMVPNQQLAPRSPMPPSAQQSPQMQQQQQHPQRQQPQQTQQQLQFPQYNSPSHLRPGTAEGHASSPQLQAQIAAAASQLRANANARVNARATPSPALNAPAATATSVAAAMVPTADGQQQQLANAPQQQPPQQIKQPPPPQQPQPQQQLHPQMHAAYQQQLYGFQLSQMNYQVAQAQGRILPYWQPMSAAGMGRGMPMQGMGGPAHPPHPHPQAAAAQQVVGKQAAVPGGVPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.38
4 0.38
5 0.34
6 0.3
7 0.28
8 0.27
9 0.28
10 0.29
11 0.29
12 0.27
13 0.34
14 0.36
15 0.35
16 0.34
17 0.31
18 0.32
19 0.32
20 0.31
21 0.25
22 0.27
23 0.27
24 0.28
25 0.26
26 0.25
27 0.25
28 0.25
29 0.3
30 0.27
31 0.27
32 0.26
33 0.28
34 0.28
35 0.26
36 0.23
37 0.16
38 0.16
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.19
49 0.15
50 0.14
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.17
56 0.11
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.15
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.16
68 0.17
69 0.15
70 0.12
71 0.19
72 0.18
73 0.2
74 0.27
75 0.29
76 0.33
77 0.4
78 0.48
79 0.53
80 0.62
81 0.68
82 0.71
83 0.8
84 0.82
85 0.83
86 0.82
87 0.76
88 0.71
89 0.67
90 0.63
91 0.64
92 0.6
93 0.57
94 0.52
95 0.49
96 0.45
97 0.42
98 0.38
99 0.29
100 0.25
101 0.22
102 0.2
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.21
108 0.25
109 0.28
110 0.31
111 0.35
112 0.39
113 0.42
114 0.45
115 0.49
116 0.46
117 0.42
118 0.4
119 0.35
120 0.34
121 0.3
122 0.26
123 0.19
124 0.18
125 0.17
126 0.14
127 0.13
128 0.09
129 0.08
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.19
138 0.2
139 0.28
140 0.29
141 0.3
142 0.32
143 0.31
144 0.31
145 0.34
146 0.37
147 0.31
148 0.28
149 0.3
150 0.27
151 0.27
152 0.29
153 0.26
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.23
160 0.26
161 0.3
162 0.31
163 0.3
164 0.32
165 0.3
166 0.34
167 0.37
168 0.34
169 0.32
170 0.3
171 0.31
172 0.3
173 0.29
174 0.25
175 0.19
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.21
181 0.22
182 0.24
183 0.29
184 0.33
185 0.34
186 0.37
187 0.41
188 0.43
189 0.47
190 0.48
191 0.44
192 0.43
193 0.42
194 0.43
195 0.47
196 0.46
197 0.45
198 0.44
199 0.46
200 0.43
201 0.39
202 0.32
203 0.24
204 0.25
205 0.27
206 0.29
207 0.28
208 0.28
209 0.28
210 0.29
211 0.29
212 0.28
213 0.28
214 0.31
215 0.34
216 0.37
217 0.39
218 0.39
219 0.42
220 0.4
221 0.35
222 0.29
223 0.24
224 0.21
225 0.19
226 0.19
227 0.17
228 0.23
229 0.27
230 0.26
231 0.25
232 0.26
233 0.26
234 0.27
235 0.33
236 0.31
237 0.32
238 0.31
239 0.34
240 0.32
241 0.35
242 0.35
243 0.3
244 0.26
245 0.21
246 0.24
247 0.23
248 0.23
249 0.19
250 0.2
251 0.21
252 0.27
253 0.26
254 0.23
255 0.25
256 0.25
257 0.27
258 0.3
259 0.33
260 0.32
261 0.38
262 0.42
263 0.47
264 0.47
265 0.47
266 0.48
267 0.49
268 0.45
269 0.46
270 0.42
271 0.37
272 0.36
273 0.35
274 0.3
275 0.23
276 0.22
277 0.17
278 0.2
279 0.18
280 0.21
281 0.21
282 0.2
283 0.23
284 0.23
285 0.27
286 0.23
287 0.28
288 0.26
289 0.29
290 0.3
291 0.28
292 0.31
293 0.28
294 0.32
295 0.3
296 0.34
297 0.31
298 0.31
299 0.29
300 0.24
301 0.23
302 0.21
303 0.18
304 0.15
305 0.13
306 0.17
307 0.18
308 0.21
309 0.23
310 0.23
311 0.23
312 0.2
313 0.2
314 0.17
315 0.18
316 0.19
317 0.18
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.13
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.1
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.17
335 0.18
336 0.17
337 0.18
338 0.22
339 0.22
340 0.24
341 0.24
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.22
346 0.19
347 0.2
348 0.21
349 0.21
350 0.21
351 0.22
352 0.26
353 0.28
354 0.28
355 0.25
356 0.23
357 0.26
358 0.23
359 0.21
360 0.18
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.19
365 0.16
366 0.18
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.21
371 0.21
372 0.19
373 0.22
374 0.24
375 0.27
376 0.29
377 0.32
378 0.35
379 0.44
380 0.46
381 0.51
382 0.47
383 0.44
384 0.48
385 0.5
386 0.52
387 0.47
388 0.52
389 0.48
390 0.47
391 0.45
392 0.38
393 0.37
394 0.35
395 0.35
396 0.35
397 0.35
398 0.38
399 0.39
400 0.38
401 0.35
402 0.34
403 0.34
404 0.29
405 0.3
406 0.26
407 0.26
408 0.27
409 0.26
410 0.22
411 0.19
412 0.22
413 0.17
414 0.18
415 0.21
416 0.24
417 0.23
418 0.23
419 0.25
420 0.23
421 0.25
422 0.27
423 0.29
424 0.27
425 0.27
426 0.35
427 0.33
428 0.33
429 0.32
430 0.3
431 0.26
432 0.23
433 0.3
434 0.23
435 0.26
436 0.24
437 0.27
438 0.3
439 0.29
440 0.38
441 0.32
442 0.32
443 0.31
444 0.29
445 0.26
446 0.25
447 0.25
448 0.19
449 0.2
450 0.23
451 0.25
452 0.27
453 0.27
454 0.26
455 0.26
456 0.3
457 0.37
458 0.37
459 0.37
460 0.43
461 0.43
462 0.48
463 0.47
464 0.43
465 0.43
466 0.43
467 0.46
468 0.4
469 0.39
470 0.34
471 0.33
472 0.32
473 0.24
474 0.21
475 0.16
476 0.14
477 0.14
478 0.17
479 0.17
480 0.16
481 0.18
482 0.2
483 0.2
484 0.2
485 0.19
486 0.18
487 0.2
488 0.19
489 0.17
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.11
495 0.08
496 0.09
497 0.18
498 0.21
499 0.25
500 0.29
501 0.36
502 0.38
503 0.42
504 0.43
505 0.42
506 0.48
507 0.54
508 0.59
509 0.63
510 0.65
511 0.71
512 0.76
513 0.74
514 0.69
515 0.62
516 0.56
517 0.55
518 0.5
519 0.42
520 0.38
521 0.32
522 0.28
523 0.26
524 0.22
525 0.15
526 0.13
527 0.13
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.13
533 0.13
534 0.18
535 0.24
536 0.27
537 0.32
538 0.33
539 0.36
540 0.34
541 0.35
542 0.33
543 0.33
544 0.35
545 0.31
546 0.3
547 0.28
548 0.29
549 0.26
550 0.24
551 0.18
552 0.13
553 0.14
554 0.14
555 0.17
556 0.2
557 0.21
558 0.21
559 0.23
560 0.26
561 0.27
562 0.27
563 0.29
564 0.27
565 0.28
566 0.28
567 0.29
568 0.29
569 0.34
570 0.37
571 0.37
572 0.37
573 0.4
574 0.43
575 0.42
576 0.45
577 0.45
578 0.44
579 0.42
580 0.47
581 0.54
582 0.58
583 0.64
584 0.61
585 0.62
586 0.69
587 0.73
588 0.74
589 0.73
590 0.74
591 0.74
592 0.78
593 0.75
594 0.7
595 0.69
596 0.63
597 0.58
598 0.54
599 0.45
600 0.44
601 0.41
602 0.39
603 0.35
604 0.37
605 0.34
606 0.33
607 0.34
608 0.28
609 0.26
610 0.28
611 0.27
612 0.25
613 0.24
614 0.2
615 0.21
616 0.22
617 0.21
618 0.18
619 0.16
620 0.16
621 0.15
622 0.14
623 0.12
624 0.11
625 0.12
626 0.1
627 0.09
628 0.08
629 0.07
630 0.08
631 0.08
632 0.09
633 0.08
634 0.11
635 0.13
636 0.18
637 0.21
638 0.26
639 0.26
640 0.28
641 0.29
642 0.29
643 0.32
644 0.28
645 0.28
646 0.26
647 0.26
648 0.24
649 0.24
650 0.25
651 0.21
652 0.18
653 0.16
654 0.13
655 0.13
656 0.11
657 0.1
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.06
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.05
669 0.07
670 0.07
671 0.08
672 0.12
673 0.13
674 0.13
675 0.18
676 0.19
677 0.2
678 0.27
679 0.29
680 0.3
681 0.35
682 0.39
683 0.44
684 0.48
685 0.52
686 0.53
687 0.58
688 0.62
689 0.67
690 0.72
691 0.74
692 0.77
693 0.77
694 0.78
695 0.81
696 0.83
697 0.81
698 0.82
699 0.78
700 0.73
701 0.74
702 0.75
703 0.67
704 0.61
705 0.53
706 0.44
707 0.4
708 0.4
709 0.34
710 0.29
711 0.28
712 0.26
713 0.24
714 0.24
715 0.24
716 0.22
717 0.19
718 0.16
719 0.2
720 0.2
721 0.22
722 0.24
723 0.23
724 0.2
725 0.21
726 0.21
727 0.19
728 0.19
729 0.17
730 0.16
731 0.17
732 0.18
733 0.18
734 0.16
735 0.18
736 0.21
737 0.24
738 0.22
739 0.21
740 0.2
741 0.24
742 0.26
743 0.24
744 0.2
745 0.19
746 0.19
747 0.18
748 0.18
749 0.14
750 0.1
751 0.08
752 0.08
753 0.07
754 0.09
755 0.09
756 0.1
757 0.12
758 0.13
759 0.18
760 0.19
761 0.22
762 0.28
763 0.34
764 0.36
765 0.34
766 0.39
767 0.42
768 0.44
769 0.45
770 0.38
771 0.32
772 0.31
773 0.31
774 0.28
775 0.21
776 0.17
777 0.13
778 0.14
779 0.14
780 0.13
781 0.12