Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9Y2U4

Protein Details
Accession A0A0C9Y2U4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-395EESRKIRDQMRQEKRRERERELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-235RFKHKKIPRGPPSPPPPVLRSPPRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MAALASILPQPVHAPAFSDDDDQPQAPAPSHTLVIRAVTPPYRQRAGWKPTSQEDFGDGGSYPECHVAQYPLGMGKKKASSGNTLALQVDSEGNVRYDAIAHQGQRPGKIVQSQFKDLVPLFHRKDIDDSERSMDRPSEEDVQETAEKTRAALEKLVNGKIKAAQPKNVPDSQGKTAFIRYTPGQQNGEAGLKQRIIKMTEVVEDPLEPPRFKHKKIPRGPPSPPPPVLRSPPRKATAAEQKEWMIPPCISNWKNNKGFTIPLDKRLAADGRGLQDIHINDNFAKFSEALFVADRHAREEVRQRSLMQQKLAQKEKESKEESLRLLAQRAREERGGLAPKPTAQSQAALKSSLAAYGSDDESGAESDEDSEDDEESRKIRDQMRQEKRRERERELRMNNMGTEQRAKQMARQQNRDISEKVALGLAKPTLSKESMLDSRLFNQESLSGNFADEDSYNLYDRPLFHGSTAAAAIYKARGNIAEGNEESFGGGTEEGIGKALDNDRFNLGQARVGFEGAADQEIKEGPVQFEKDTGDVFGLNQFLDEAKTGKKRGLDTGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.23
4 0.24
5 0.27
6 0.24
7 0.27
8 0.3
9 0.27
10 0.25
11 0.23
12 0.23
13 0.2
14 0.22
15 0.21
16 0.19
17 0.21
18 0.21
19 0.2
20 0.19
21 0.2
22 0.21
23 0.19
24 0.21
25 0.23
26 0.29
27 0.34
28 0.4
29 0.41
30 0.4
31 0.46
32 0.52
33 0.57
34 0.61
35 0.6
36 0.59
37 0.63
38 0.68
39 0.61
40 0.52
41 0.47
42 0.39
43 0.33
44 0.28
45 0.21
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.14
54 0.15
55 0.15
56 0.16
57 0.16
58 0.19
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.28
63 0.3
64 0.33
65 0.36
66 0.34
67 0.37
68 0.39
69 0.44
70 0.41
71 0.39
72 0.36
73 0.3
74 0.27
75 0.21
76 0.17
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.13
87 0.16
88 0.17
89 0.21
90 0.27
91 0.29
92 0.3
93 0.33
94 0.29
95 0.28
96 0.34
97 0.36
98 0.38
99 0.42
100 0.44
101 0.43
102 0.41
103 0.42
104 0.35
105 0.36
106 0.31
107 0.35
108 0.33
109 0.37
110 0.38
111 0.35
112 0.39
113 0.38
114 0.41
115 0.35
116 0.34
117 0.33
118 0.34
119 0.34
120 0.31
121 0.27
122 0.21
123 0.2
124 0.22
125 0.24
126 0.22
127 0.23
128 0.21
129 0.24
130 0.23
131 0.22
132 0.2
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.19
137 0.18
138 0.19
139 0.22
140 0.22
141 0.26
142 0.3
143 0.35
144 0.32
145 0.3
146 0.29
147 0.3
148 0.34
149 0.37
150 0.36
151 0.37
152 0.4
153 0.47
154 0.51
155 0.49
156 0.47
157 0.41
158 0.43
159 0.43
160 0.41
161 0.35
162 0.31
163 0.31
164 0.3
165 0.26
166 0.24
167 0.2
168 0.25
169 0.29
170 0.33
171 0.32
172 0.3
173 0.31
174 0.29
175 0.3
176 0.22
177 0.19
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.2
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.17
190 0.15
191 0.13
192 0.13
193 0.17
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.27
198 0.32
199 0.34
200 0.44
201 0.47
202 0.55
203 0.65
204 0.75
205 0.73
206 0.76
207 0.78
208 0.77
209 0.75
210 0.71
211 0.66
212 0.58
213 0.53
214 0.49
215 0.52
216 0.52
217 0.53
218 0.52
219 0.55
220 0.55
221 0.52
222 0.48
223 0.49
224 0.51
225 0.47
226 0.43
227 0.38
228 0.36
229 0.36
230 0.36
231 0.29
232 0.2
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.22
237 0.22
238 0.28
239 0.34
240 0.41
241 0.45
242 0.46
243 0.45
244 0.38
245 0.38
246 0.33
247 0.37
248 0.29
249 0.3
250 0.31
251 0.29
252 0.28
253 0.29
254 0.27
255 0.17
256 0.18
257 0.15
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.09
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.12
284 0.11
285 0.13
286 0.22
287 0.26
288 0.28
289 0.3
290 0.29
291 0.36
292 0.43
293 0.44
294 0.36
295 0.36
296 0.38
297 0.44
298 0.49
299 0.42
300 0.39
301 0.44
302 0.46
303 0.49
304 0.46
305 0.41
306 0.4
307 0.43
308 0.41
309 0.35
310 0.34
311 0.27
312 0.27
313 0.26
314 0.24
315 0.25
316 0.27
317 0.27
318 0.25
319 0.25
320 0.22
321 0.26
322 0.27
323 0.22
324 0.22
325 0.2
326 0.21
327 0.22
328 0.22
329 0.19
330 0.16
331 0.18
332 0.18
333 0.23
334 0.22
335 0.21
336 0.2
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.13
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.17
366 0.21
367 0.28
368 0.37
369 0.47
370 0.58
371 0.65
372 0.72
373 0.77
374 0.8
375 0.84
376 0.81
377 0.78
378 0.77
379 0.78
380 0.8
381 0.75
382 0.74
383 0.68
384 0.62
385 0.54
386 0.48
387 0.39
388 0.31
389 0.3
390 0.24
391 0.23
392 0.26
393 0.26
394 0.27
395 0.35
396 0.42
397 0.47
398 0.53
399 0.55
400 0.58
401 0.61
402 0.6
403 0.52
404 0.45
405 0.4
406 0.33
407 0.27
408 0.23
409 0.19
410 0.15
411 0.16
412 0.13
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.19
421 0.22
422 0.23
423 0.24
424 0.22
425 0.25
426 0.29
427 0.29
428 0.23
429 0.21
430 0.22
431 0.24
432 0.24
433 0.22
434 0.18
435 0.17
436 0.17
437 0.16
438 0.14
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.14
446 0.15
447 0.16
448 0.2
449 0.2
450 0.19
451 0.19
452 0.21
453 0.21
454 0.2
455 0.2
456 0.14
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.1
461 0.11
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.14
466 0.19
467 0.2
468 0.23
469 0.23
470 0.24
471 0.24
472 0.23
473 0.2
474 0.15
475 0.13
476 0.08
477 0.08
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.08
484 0.07
485 0.11
486 0.15
487 0.18
488 0.19
489 0.21
490 0.24
491 0.24
492 0.26
493 0.28
494 0.25
495 0.24
496 0.24
497 0.26
498 0.23
499 0.23
500 0.22
501 0.15
502 0.17
503 0.13
504 0.14
505 0.11
506 0.1
507 0.11
508 0.12
509 0.13
510 0.13
511 0.14
512 0.15
513 0.2
514 0.23
515 0.22
516 0.24
517 0.25
518 0.24
519 0.23
520 0.21
521 0.16
522 0.14
523 0.14
524 0.14
525 0.13
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.1
530 0.11
531 0.12
532 0.11
533 0.18
534 0.25
535 0.27
536 0.3
537 0.35
538 0.37