Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9XTM8

Protein Details
Accession A0A0C9XTM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-144EEGKIRQKDKGDQKKERRRPVQLNEGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-136EGKIRQKDKGDQKKERRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MNSSNIDDIWDEPLAQQDGFEAPTRSKRPLFLVESDDDDDDQAPRRLARKPPPQQDIDIDALFQDVEEDDTTEFKPLPPALDIEAVRHRAEARHKQTLTPHEILPSSSPPHDTGDRREEGKIRQKDKGDQKKERRRPVQLNEGRLLGPSGFPQLIKDTKNFRIKGKGHEAADLNRLLQVYQFWTHSLYPKTPFRDTVERVEKLCHSRRMNVSLSVWRDEAHGIKKAMANTEDDMDDDVTRKASPSEEELDPVQPAPPIFSQTSSPMPSRPPSSASEYDLHDDDIEALIREESAPSQGKPPAPIEDDEESFWSTVDGYQPPRPSQPAPQATLMDEDHDMWDLVREIEMNTSTSQHEASSMPQVSTTEDWDDIYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.16
4 0.14
5 0.15
6 0.16
7 0.19
8 0.16
9 0.17
10 0.27
11 0.31
12 0.35
13 0.37
14 0.38
15 0.41
16 0.48
17 0.5
18 0.46
19 0.48
20 0.44
21 0.46
22 0.44
23 0.39
24 0.3
25 0.26
26 0.22
27 0.17
28 0.19
29 0.17
30 0.17
31 0.19
32 0.23
33 0.29
34 0.37
35 0.46
36 0.53
37 0.61
38 0.7
39 0.74
40 0.74
41 0.71
42 0.67
43 0.61
44 0.55
45 0.44
46 0.34
47 0.26
48 0.23
49 0.19
50 0.14
51 0.09
52 0.04
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.08
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.15
63 0.14
64 0.16
65 0.15
66 0.17
67 0.17
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.26
72 0.27
73 0.26
74 0.25
75 0.24
76 0.24
77 0.33
78 0.39
79 0.41
80 0.49
81 0.49
82 0.51
83 0.58
84 0.61
85 0.59
86 0.51
87 0.45
88 0.37
89 0.37
90 0.35
91 0.3
92 0.26
93 0.21
94 0.19
95 0.2
96 0.19
97 0.22
98 0.27
99 0.27
100 0.3
101 0.35
102 0.37
103 0.37
104 0.38
105 0.38
106 0.4
107 0.48
108 0.5
109 0.47
110 0.5
111 0.52
112 0.58
113 0.65
114 0.68
115 0.68
116 0.7
117 0.77
118 0.82
119 0.88
120 0.9
121 0.87
122 0.85
123 0.85
124 0.81
125 0.82
126 0.76
127 0.71
128 0.62
129 0.56
130 0.46
131 0.37
132 0.3
133 0.19
134 0.14
135 0.09
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.12
141 0.16
142 0.17
143 0.2
144 0.23
145 0.31
146 0.39
147 0.4
148 0.39
149 0.45
150 0.46
151 0.5
152 0.53
153 0.51
154 0.43
155 0.45
156 0.44
157 0.36
158 0.37
159 0.29
160 0.21
161 0.16
162 0.16
163 0.12
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.11
171 0.12
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.21
176 0.25
177 0.29
178 0.28
179 0.3
180 0.3
181 0.36
182 0.37
183 0.41
184 0.44
185 0.41
186 0.4
187 0.4
188 0.38
189 0.37
190 0.41
191 0.4
192 0.34
193 0.39
194 0.42
195 0.46
196 0.45
197 0.4
198 0.37
199 0.34
200 0.34
201 0.3
202 0.26
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.2
207 0.17
208 0.19
209 0.18
210 0.2
211 0.22
212 0.22
213 0.24
214 0.21
215 0.2
216 0.16
217 0.17
218 0.15
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.12
232 0.17
233 0.16
234 0.18
235 0.19
236 0.19
237 0.18
238 0.17
239 0.14
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.16
248 0.18
249 0.22
250 0.23
251 0.23
252 0.21
253 0.24
254 0.27
255 0.28
256 0.27
257 0.26
258 0.27
259 0.33
260 0.34
261 0.34
262 0.33
263 0.32
264 0.33
265 0.3
266 0.27
267 0.19
268 0.17
269 0.14
270 0.12
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.11
280 0.13
281 0.13
282 0.18
283 0.22
284 0.24
285 0.27
286 0.29
287 0.29
288 0.3
289 0.3
290 0.31
291 0.31
292 0.31
293 0.28
294 0.28
295 0.24
296 0.21
297 0.19
298 0.14
299 0.1
300 0.1
301 0.13
302 0.15
303 0.19
304 0.24
305 0.29
306 0.32
307 0.36
308 0.39
309 0.38
310 0.43
311 0.49
312 0.5
313 0.5
314 0.51
315 0.48
316 0.45
317 0.46
318 0.37
319 0.29
320 0.23
321 0.2
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.11
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.13
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.16
337 0.16
338 0.17
339 0.17
340 0.14
341 0.15
342 0.14
343 0.16
344 0.23
345 0.23
346 0.22
347 0.23
348 0.23
349 0.25
350 0.26
351 0.26
352 0.21
353 0.2