FuNGI

A0A0C9Y544

Protein Details

Accession

A0A0C9Y544

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
91-116	QEELRVKKAIEEKKRKEREEEKMKMD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-108	KKAIEEKKRKER

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13, cyto 12.5, nucl 10.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSPPGSPRLIDSYTAPKEILQEFADLAEEENVDPFAETASKRQIAARQSDYHNRRFARVAVDSADAFQQNEEGKEVEGGYKDAMRLSRLEQEELRVKKAIEEKKRKEREEEKMKMDLDKTPPAAEIEAVSRELTAARELANKDAGMKRKRRWDVSEPSDENADPNQRDTGEWSKEALEASAPKKRRSRWDATPAEAAIGETPKRSRWDQTPVASNVDVPMTPIIMNAPGFMQEDKHNRYLTDEELDAVLPTSGYAIVTPPPGYAPMVAPRKFMATPITEVGGFQIQEGSDAAAAAAAAGLAPELPTEIPGVGNLAFFKAEDAQYFAKILKEEDETELSVDEMKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKAREFGAGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHADEYVRNTTARAFSVVASALGIPSLLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAVLPHLRNLVDCIAHGLSDEQQKVRTMTALGLAALAEAAAPYGIESFDNVLKPLWLGIRLHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDPEYASYYTKEVTVILIREFQTSDEEMKKIVLKVVKQCAATEGVTPQYIKNDILPDFFKAFWVRRMALDRRNYRQVVETTVELAQKSGVAEIVGRIVNELKDEAEPYRKMVMETITKVVATLGASDIDERLEVRLVDGIIYSFQEQTTEDQVMLDGFGTVVNALGIRVKPYLTQIVSTILWRLNNKSAKVRQQAADLTTRLAVVIKQCGEDQLLSKLGLVLFEQLGEEYPDTLGSIIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADRGAEFVPAREWMRICFELLDLLKAHKKGIRRAAVNSFGYIAKSLGPQDVLSVLLTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTAELNVRTGCLKALSFVFEYVGPQSAYYCDSVVTMLEDALTDRDLVHRQTASTIVKHLALGVAGLGCEDSMLHLMNLVWPNCFETSPHVIGAVMDAIEAMRVTLGPGVLLSYVLQGLFHPARKVREVYWRTYNALYLGAEDALVPFYPDLSELSEGKNVYDRHPLQVFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.35
3	0.29
4	0.32
5	0.32
6	0.32
7	0.23
8	0.21
9	0.2
10	0.2
11	0.2
12	0.15
13	0.15
14	0.12
15	0.12
16	0.1
17	0.11
18	0.11
19	0.1
20	0.1
21	0.08
22	0.08
23	0.11
24	0.12
25	0.16
26	0.24
27	0.26
28	0.27
29	0.31
30	0.36
31	0.39
32	0.47
33	0.48
34	0.47
35	0.52
36	0.62
37	0.64
38	0.66
39	0.67
40	0.61
41	0.58
42	0.55
43	0.52
44	0.49
45	0.45
46	0.41
47	0.36
48	0.36
49	0.33
50	0.3
51	0.3
52	0.23
53	0.2
54	0.16
55	0.17
56	0.16
57	0.17
58	0.18
59	0.15
60	0.15
61	0.16
62	0.17
63	0.16
64	0.15
65	0.15
66	0.15
67	0.16
68	0.16
69	0.18
70	0.19
71	0.17
72	0.18
73	0.21
74	0.28
75	0.28
76	0.32
77	0.3
78	0.36
79	0.43
80	0.43
81	0.44
82	0.38
83	0.35
84	0.37
85	0.45
86	0.48
87	0.5
88	0.59
89	0.65
90	0.74
91	0.84
92	0.81
93	0.82
94	0.82
95	0.82
96	0.82
97	0.8
98	0.75
99	0.72
100	0.69
101	0.63
102	0.56
103	0.52
104	0.46
105	0.45
106	0.41
107	0.35
108	0.35
109	0.32
110	0.3
111	0.24
112	0.2
113	0.16
114	0.16
115	0.16
116	0.15
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.12
121	0.11
122	0.1
123	0.11
124	0.16
125	0.18
126	0.2
127	0.22
128	0.21
129	0.24
130	0.3
131	0.37
132	0.41
133	0.48
134	0.52
135	0.6
136	0.69
137	0.71
138	0.74
139	0.74
140	0.76
141	0.76
142	0.8
143	0.71
144	0.64
145	0.59
146	0.51
147	0.43
148	0.37
149	0.35
150	0.26
151	0.26
152	0.26
153	0.24
154	0.25
155	0.29
156	0.32
157	0.3
158	0.3
159	0.29
160	0.28
161	0.29
162	0.28
163	0.23
164	0.18
165	0.19
166	0.22
167	0.29
168	0.32
169	0.37
170	0.44
171	0.51
172	0.58
173	0.62
174	0.66
175	0.68
176	0.75
177	0.75
178	0.72
179	0.7
180	0.59
181	0.51
182	0.42
183	0.32
184	0.23
185	0.2
186	0.16
187	0.14
188	0.16
189	0.19
190	0.23
191	0.26
192	0.3
193	0.33
194	0.42
195	0.47
196	0.51
197	0.56
198	0.54
199	0.55
200	0.49
201	0.42
202	0.34
203	0.28
204	0.22
205	0.14
206	0.12
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.08
214	0.08
215	0.09
216	0.1
217	0.11
218	0.12
219	0.17
220	0.25
221	0.3
222	0.34
223	0.33
224	0.32
225	0.36
226	0.36
227	0.33
228	0.28
229	0.23
230	0.19
231	0.19
232	0.19
233	0.15
234	0.12
235	0.09
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.07
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.19
253	0.27
254	0.27
255	0.28
256	0.28
257	0.31
258	0.3
259	0.29
260	0.25
261	0.19
262	0.22
263	0.22
264	0.22
265	0.18
266	0.18
267	0.18
268	0.16
269	0.13
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.1
274	0.1
275	0.09
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.04
282	0.03
283	0.02
284	0.02
285	0.02
286	0.02
287	0.02
288	0.02
289	0.02
290	0.03
291	0.03
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.13
309	0.13
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.14
315	0.14
316	0.13
317	0.14
318	0.15
319	0.17
320	0.19
321	0.17
322	0.17
323	0.16
324	0.13
325	0.12
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.16
331	0.16
332	0.18
333	0.21
334	0.26
335	0.28
336	0.36
337	0.43
338	0.45
339	0.51
340	0.51
341	0.49
342	0.5
343	0.5
344	0.47
345	0.47
346	0.45
347	0.44
348	0.47
349	0.46
350	0.44
351	0.5
352	0.52
353	0.48
354	0.46
355	0.46
356	0.5
357	0.56
358	0.53
359	0.44
360	0.35
361	0.33
362	0.31
363	0.29
364	0.24
365	0.18
366	0.17
367	0.16
368	0.16
369	0.16
370	0.15
371	0.11
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.12
380	0.12
381	0.13
382	0.13
383	0.13
384	0.16
385	0.16
386	0.16
387	0.14
388	0.15
389	0.14
390	0.18
391	0.2
392	0.18
393	0.19
394	0.19
395	0.19
396	0.19
397	0.19
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.15
402	0.16
403	0.18
404	0.17
405	0.18
406	0.19
407	0.2
408	0.17
409	0.16
410	0.14
411	0.14
412	0.15
413	0.14
414	0.12
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.06
420	0.05
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.08
430	0.1
431	0.12
432	0.12
433	0.14
434	0.15
435	0.15
436	0.15
437	0.13
438	0.11
439	0.08
440	0.08
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.08
454	0.11
455	0.11
456	0.11
457	0.14
458	0.14
459	0.16
460	0.16
461	0.15
462	0.12
463	0.12
464	0.13
465	0.12
466	0.11
467	0.12
468	0.11
469	0.11
470	0.12
471	0.12
472	0.1
473	0.08
474	0.08
475	0.06
476	0.05
477	0.04
478	0.03
479	0.03
480	0.04
481	0.03
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.09
486	0.13
487	0.19
488	0.25
489	0.28
490	0.31
491	0.38
492	0.48
493	0.54
494	0.59
495	0.6
496	0.61
497	0.64
498	0.68
499	0.63
500	0.57
501	0.49
502	0.45
503	0.41
504	0.34
505	0.28
506	0.21
507	0.19
508	0.15
509	0.12
510	0.07
511	0.05
512	0.04
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.04
517	0.04
518	0.05
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.09
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.11
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.08
531	0.09
532	0.13
533	0.14
534	0.12
535	0.13
536	0.14
537	0.15
538	0.15
539	0.13
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.04
550	0.02
551	0.02
552	0.02
553	0.02
554	0.02
555	0.02
556	0.02
557	0.02
558	0.03
559	0.03
560	0.04
561	0.06
562	0.06
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.07
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.1
572	0.2
573	0.21
574	0.22
575	0.22
576	0.22
577	0.2
578	0.21
579	0.22
580	0.13
581	0.13
582	0.12
583	0.11
584	0.11
585	0.1
586	0.09
587	0.06
588	0.04
589	0.03
590	0.04
591	0.03
592	0.04
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.08
598	0.08
599	0.09
600	0.1
601	0.09
602	0.09
603	0.1
604	0.09
605	0.07
606	0.07
607	0.08
608	0.09
609	0.09
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.13
614	0.12
615	0.12
616	0.12
617	0.15
618	0.13
619	0.13
620	0.12
621	0.13
622	0.14
623	0.12
624	0.15
625	0.14
626	0.16
627	0.22
628	0.27
629	0.3
630	0.29
631	0.29
632	0.27
633	0.27
634	0.24
635	0.19
636	0.14
637	0.12
638	0.12
639	0.13
640	0.11
641	0.11
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.14
646	0.13
647	0.15
648	0.16
649	0.16
650	0.16
651	0.16
652	0.16
653	0.15
654	0.16
655	0.18
656	0.2
657	0.19
658	0.2
659	0.27
660	0.3
661	0.35
662	0.43
663	0.45
664	0.47
665	0.53
666	0.51
667	0.45
668	0.45
669	0.39
670	0.35
671	0.3
672	0.25
673	0.2
674	0.21
675	0.21
676	0.16
677	0.14
678	0.1
679	0.09
680	0.09
681	0.07
682	0.05
683	0.04
684	0.05
685	0.05
686	0.07
687	0.07
688	0.06
689	0.07
690	0.08
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.07
695	0.07
696	0.09
697	0.1
698	0.14
699	0.15
700	0.16
701	0.18
702	0.18
703	0.18
704	0.18
705	0.2
706	0.19
707	0.21
708	0.21
709	0.18
710	0.18
711	0.17
712	0.15
713	0.13
714	0.08
715	0.07
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.05
724	0.05
725	0.06
726	0.06
727	0.06
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.06
734	0.07
735	0.07
736	0.06
737	0.06
738	0.07
739	0.07
740	0.1
741	0.12
742	0.12
743	0.11
744	0.1
745	0.11
746	0.1
747	0.09
748	0.07
749	0.04
750	0.03
751	0.03
752	0.03
753	0.03
754	0.03
755	0.03
756	0.03
757	0.03
758	0.05
759	0.06
760	0.07
761	0.08
762	0.09
763	0.09
764	0.12
765	0.17
766	0.15
767	0.16
768	0.15
769	0.18
770	0.18
771	0.18
772	0.17
773	0.14
774	0.16
775	0.17
776	0.19
777	0.24
778	0.29
779	0.31
780	0.38
781	0.43
782	0.49
783	0.54
784	0.56
785	0.49
786	0.49
787	0.5
788	0.44
789	0.42
790	0.33
791	0.28
792	0.23
793	0.21
794	0.16
795	0.14
796	0.12
797	0.09
798	0.13
799	0.13
800	0.14
801	0.14
802	0.15
803	0.16
804	0.15
805	0.15
806	0.13
807	0.14
808	0.13
809	0.13
810	0.13
811	0.12
812	0.12
813	0.1
814	0.09
815	0.07
816	0.07
817	0.07
818	0.06
819	0.07
820	0.07
821	0.07
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.06
828	0.04
829	0.04
830	0.04
831	0.04
832	0.03
833	0.03
834	0.03
835	0.03
836	0.03
837	0.02
838	0.02
839	0.02
840	0.02
841	0.02
842	0.03
843	0.04
844	0.05
845	0.11
846	0.13
847	0.13
848	0.15
849	0.18
850	0.18
851	0.21
852	0.22
853	0.23
854	0.23
855	0.24
856	0.27
857	0.28
858	0.33
859	0.36
860	0.44
861	0.45
862	0.5
863	0.52
864	0.58
865	0.58
866	0.57
867	0.54
868	0.52
869	0.49
870	0.43
871	0.41
872	0.35
873	0.32
874	0.27
875	0.24
876	0.15
877	0.12
878	0.12
879	0.1
880	0.08
881	0.08
882	0.1
883	0.09
884	0.13
885	0.12
886	0.12
887	0.13
888	0.15
889	0.16
890	0.18
891	0.18
892	0.16
893	0.22
894	0.23
895	0.22
896	0.19
897	0.18
898	0.21
899	0.2
900	0.21
901	0.15
902	0.18
903	0.21
904	0.21
905	0.24
906	0.21
907	0.26
908	0.33
909	0.42
910	0.47
911	0.46
912	0.51
913	0.56
914	0.61
915	0.56
916	0.49
917	0.41
918	0.33
919	0.3
920	0.25
921	0.18
922	0.12
923	0.12
924	0.13
925	0.12
926	0.13
927	0.12
928	0.12
929	0.12
930	0.12
931	0.1
932	0.09
933	0.08
934	0.09
935	0.1
936	0.1
937	0.13
938	0.14
939	0.15
940	0.17
941	0.26
942	0.31
943	0.37
944	0.41
945	0.41
946	0.41
947	0.41
948	0.4
949	0.32
950	0.29
951	0.23
952	0.19
953	0.14
954	0.12
955	0.12
956	0.11
957	0.1
958	0.05
959	0.05
960	0.05
961	0.07
962	0.07
963	0.08
964	0.1
965	0.11
966	0.11
967	0.13
968	0.18
969	0.19
970	0.2
971	0.22
972	0.22
973	0.22
974	0.23
975	0.23
976	0.21
977	0.21
978	0.24
979	0.22
980	0.22
981	0.22
982	0.21
983	0.2
984	0.18
985	0.16
986	0.13
987	0.14
988	0.16
989	0.16
990	0.16
991	0.16
992	0.15
993	0.16
994	0.15
995	0.16
996	0.13
997	0.12
998	0.12
999	0.12
1000	0.14
1001	0.13
1002	0.12
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.1
1008	0.09
1009	0.08
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.08
1013	0.09
1014	0.09
1015	0.07
1016	0.07
1017	0.11
1018	0.14
1019	0.16
1020	0.2
1021	0.2
1022	0.2
1023	0.21
1024	0.28
1025	0.28
1026	0.26
1027	0.27
1028	0.25
1029	0.25
1030	0.24
1031	0.23
1032	0.17
1033	0.13
1034	0.11
1035	0.09
1036	0.07
1037	0.06
1038	0.06
1039	0.05
1040	0.04
1041	0.04
1042	0.04
1043	0.04
1044	0.06
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.08
1048	0.08
1049	0.14
1050	0.2
1051	0.19
1052	0.19
1053	0.18
1054	0.22
1055	0.22
1056	0.22
1057	0.18
1058	0.19
1059	0.26
1060	0.27
1061	0.26
1062	0.24
1063	0.23
1064	0.22
1065	0.22
1066	0.17
1067	0.09
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.06
1071	0.07
1072	0.06
1073	0.05
1074	0.04
1075	0.04
1076	0.05
1077	0.06
1078	0.06
1079	0.06
1080	0.06
1081	0.07
1082	0.07
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.08
1087	0.07
1088	0.08
1089	0.07
1090	0.14
1091	0.18
1092	0.21
1093	0.25
1094	0.29
1095	0.35
1096	0.4
1097	0.43
1098	0.4
1099	0.47
1100	0.49
1101	0.51
1102	0.56
1103	0.55
1104	0.54
1105	0.52
1106	0.49
1107	0.39
1108	0.37
1109	0.3
1110	0.22
1111	0.19
1112	0.15
1113	0.14
1114	0.12
1115	0.11
1116	0.09
1117	0.09
1118	0.08
1119	0.07
1120	0.07
1121	0.08
1122	0.08
1123	0.09
1124	0.11
1125	0.15
1126	0.15
1127	0.18
1128	0.22
1129	0.22
1130	0.22
1131	0.28
1132	0.26
1133	0.26
1134	0.36
1135	0.35
1136	0.38

A0A0C9Y544

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer