Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WU42

Protein Details
Accession Q4WU42    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
264-285IPRFMIKKLQARNERRKGRGFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-168EGRKRTGGRARGRGRGRGRGGRFGRGGR
207-218GKPRAPRPQKQR
274-281ARNERRKG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048255  P:mRNA stabilization  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG afm:AFUA_5G07120  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSAAAENQADNKAPTTTEATNGTAPAPAQATDAAAVSADEGRRLYIGNLAYATTEGELKEFFKNYKIESTSIPVNPRTNRPVGYAFVDLATAHEATAAIEELSGKEILQRKVSVQLARKPEPAEAKAEGAASGGEGASGTEGRKRTGGRARGRGRGRGRGGRFGRGGRNGSATNEAPTNVPGQVEPQTEVANEATNAGAAESSKQAGKPRAPRPQKQRGPPEDGIPSKTKVMVANLPYDLTEDKLKEIFADYQPVSAKIALRPIPRFMIKKLQARNERRKGRGFGFVTLGSEELQEKAVKEMNGKEIEGREIAVKVAIDSPGKEDDAVPTGEQTEAAAPAAKEQENTPPAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.22
3 0.21
4 0.23
5 0.25
6 0.26
7 0.27
8 0.27
9 0.24
10 0.2
11 0.19
12 0.17
13 0.15
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.1
25 0.09
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.11
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.09
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.11
46 0.14
47 0.16
48 0.16
49 0.2
50 0.22
51 0.24
52 0.31
53 0.31
54 0.3
55 0.3
56 0.33
57 0.34
58 0.36
59 0.37
60 0.34
61 0.38
62 0.4
63 0.44
64 0.45
65 0.43
66 0.41
67 0.41
68 0.4
69 0.36
70 0.36
71 0.31
72 0.25
73 0.21
74 0.2
75 0.16
76 0.13
77 0.12
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.1
93 0.17
94 0.19
95 0.22
96 0.22
97 0.22
98 0.28
99 0.33
100 0.34
101 0.33
102 0.38
103 0.43
104 0.45
105 0.47
106 0.42
107 0.42
108 0.42
109 0.37
110 0.34
111 0.28
112 0.26
113 0.23
114 0.22
115 0.18
116 0.13
117 0.11
118 0.07
119 0.06
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.13
131 0.14
132 0.2
133 0.28
134 0.36
135 0.4
136 0.5
137 0.54
138 0.6
139 0.62
140 0.64
141 0.6
142 0.59
143 0.57
144 0.55
145 0.53
146 0.54
147 0.53
148 0.49
149 0.48
150 0.42
151 0.41
152 0.38
153 0.37
154 0.29
155 0.3
156 0.25
157 0.24
158 0.24
159 0.2
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.08
192 0.12
193 0.17
194 0.23
195 0.31
196 0.39
197 0.49
198 0.56
199 0.63
200 0.69
201 0.75
202 0.77
203 0.77
204 0.79
205 0.75
206 0.76
207 0.69
208 0.64
209 0.6
210 0.54
211 0.49
212 0.41
213 0.36
214 0.28
215 0.27
216 0.24
217 0.19
218 0.2
219 0.22
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.21
224 0.19
225 0.19
226 0.16
227 0.13
228 0.14
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.14
235 0.16
236 0.15
237 0.2
238 0.19
239 0.21
240 0.22
241 0.22
242 0.21
243 0.19
244 0.19
245 0.15
246 0.22
247 0.24
248 0.28
249 0.3
250 0.31
251 0.35
252 0.38
253 0.4
254 0.37
255 0.43
256 0.45
257 0.51
258 0.55
259 0.6
260 0.65
261 0.72
262 0.8
263 0.79
264 0.81
265 0.8
266 0.8
267 0.76
268 0.7
269 0.69
270 0.61
271 0.53
272 0.48
273 0.43
274 0.36
275 0.31
276 0.27
277 0.18
278 0.16
279 0.14
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.13
285 0.17
286 0.17
287 0.2
288 0.24
289 0.29
290 0.3
291 0.3
292 0.31
293 0.28
294 0.3
295 0.27
296 0.24
297 0.18
298 0.16
299 0.16
300 0.14
301 0.12
302 0.11
303 0.13
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.17
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.2
314 0.21
315 0.18
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.15
320 0.13
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.13
325 0.11
326 0.15
327 0.2
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.29
332 0.29