Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BQP4

Protein Details
Accession Q6BQP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
388-418VGIINYPNKKGKRRSKKKDKKSEDTNFSTKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-408KKGKRRSKKKDKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013961  RAI1  
IPR039039  RAI1-like_fam  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
KEGG dha:DEHA2E03476g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08652  RAI1  
Amino Acid Sequences MDYVKSPEFIGLLEESNVTKEPCYEKLCYCRNKELQIALDRSEARYFDVSSGLFMADSLESPRINAKINVDLSSGYRKFRVLSRTSSTLDNIRGTKYVAMEEFERNENKKLDENIVTSRHTLLDLLHLPFQKSAIIQNIVAFNGQVFMEAEQRPQRRADASSMTGYNFEEVMTCAENEIHNSKPFEFIPAVNNAIKYNSMINHTFPETGLSVLVSCEIDSIKRRSEELAALYDKIEFKYKILENNIEMKSRKIGSRNNLIKAILQCYLAGTNDLVVGYRDDNFNLKYVEKLNVSELLETSNNPLLNRAFLDKWFWFIAQFISKAVKMPRGLALRHHQLIFNKNDNVISIESFRLSPYRLEKTILSRFVKWRRYLATMQKHQLSVEANVGIINYPNKKGKRRSKKKDKKSEDTNFSTKITDHSNSISKFEDNEQNETNHITKVLEHVSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.17
5 0.15
6 0.14
7 0.17
8 0.21
9 0.26
10 0.31
11 0.33
12 0.38
13 0.47
14 0.56
15 0.6
16 0.63
17 0.66
18 0.68
19 0.7
20 0.69
21 0.65
22 0.63
23 0.63
24 0.59
25 0.5
26 0.49
27 0.44
28 0.41
29 0.38
30 0.31
31 0.26
32 0.25
33 0.24
34 0.2
35 0.22
36 0.19
37 0.17
38 0.18
39 0.14
40 0.12
41 0.1
42 0.11
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.16
50 0.17
51 0.19
52 0.22
53 0.22
54 0.28
55 0.3
56 0.31
57 0.28
58 0.27
59 0.26
60 0.33
61 0.32
62 0.26
63 0.25
64 0.25
65 0.26
66 0.31
67 0.37
68 0.32
69 0.37
70 0.42
71 0.46
72 0.47
73 0.47
74 0.44
75 0.4
76 0.39
77 0.36
78 0.31
79 0.28
80 0.27
81 0.26
82 0.25
83 0.22
84 0.21
85 0.17
86 0.17
87 0.18
88 0.2
89 0.22
90 0.24
91 0.27
92 0.27
93 0.3
94 0.3
95 0.3
96 0.32
97 0.32
98 0.33
99 0.33
100 0.33
101 0.35
102 0.36
103 0.35
104 0.31
105 0.29
106 0.24
107 0.2
108 0.18
109 0.12
110 0.15
111 0.17
112 0.18
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.22
117 0.22
118 0.17
119 0.14
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.18
125 0.19
126 0.18
127 0.17
128 0.14
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.11
136 0.12
137 0.16
138 0.22
139 0.24
140 0.25
141 0.26
142 0.27
143 0.25
144 0.27
145 0.28
146 0.25
147 0.26
148 0.27
149 0.27
150 0.25
151 0.23
152 0.21
153 0.17
154 0.12
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.16
169 0.16
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.18
174 0.16
175 0.16
176 0.17
177 0.19
178 0.18
179 0.18
180 0.15
181 0.15
182 0.14
183 0.12
184 0.12
185 0.1
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.14
193 0.14
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.06
206 0.09
207 0.12
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.16
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.14
221 0.13
222 0.15
223 0.11
224 0.1
225 0.17
226 0.18
227 0.21
228 0.24
229 0.25
230 0.24
231 0.32
232 0.33
233 0.3
234 0.29
235 0.25
236 0.25
237 0.25
238 0.26
239 0.24
240 0.28
241 0.3
242 0.41
243 0.46
244 0.45
245 0.45
246 0.43
247 0.41
248 0.37
249 0.33
250 0.24
251 0.18
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.11
256 0.1
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.18
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.2
280 0.2
281 0.19
282 0.17
283 0.16
284 0.15
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.17
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.17
295 0.15
296 0.15
297 0.2
298 0.18
299 0.2
300 0.2
301 0.19
302 0.16
303 0.15
304 0.18
305 0.16
306 0.16
307 0.14
308 0.16
309 0.16
310 0.19
311 0.21
312 0.23
313 0.21
314 0.23
315 0.28
316 0.3
317 0.31
318 0.33
319 0.39
320 0.4
321 0.43
322 0.41
323 0.38
324 0.38
325 0.45
326 0.45
327 0.43
328 0.38
329 0.36
330 0.35
331 0.33
332 0.31
333 0.25
334 0.2
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.13
341 0.14
342 0.17
343 0.21
344 0.27
345 0.27
346 0.3
347 0.32
348 0.38
349 0.45
350 0.49
351 0.46
352 0.45
353 0.52
354 0.59
355 0.65
356 0.6
357 0.59
358 0.55
359 0.58
360 0.6
361 0.62
362 0.63
363 0.63
364 0.67
365 0.65
366 0.61
367 0.54
368 0.5
369 0.42
370 0.33
371 0.28
372 0.22
373 0.18
374 0.17
375 0.17
376 0.14
377 0.13
378 0.16
379 0.16
380 0.21
381 0.29
382 0.35
383 0.44
384 0.55
385 0.64
386 0.7
387 0.79
388 0.85
389 0.89
390 0.94
391 0.96
392 0.97
393 0.96
394 0.95
395 0.95
396 0.94
397 0.92
398 0.89
399 0.84
400 0.75
401 0.66
402 0.58
403 0.47
404 0.4
405 0.37
406 0.3
407 0.27
408 0.29
409 0.35
410 0.35
411 0.37
412 0.37
413 0.31
414 0.32
415 0.35
416 0.39
417 0.35
418 0.4
419 0.4
420 0.38
421 0.39
422 0.4
423 0.36
424 0.28
425 0.25
426 0.2
427 0.18
428 0.22
429 0.24