Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WDR9

Protein Details
Accession Q4WDR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-84SFDRHSWTCKAKHRKCDRCRPTCQACTDQHydrophilic
116-140TSIPPRVPGRRRDRIRARRAQQEGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-134PGRRRDRIRARR
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 10, nucl 4, cyto 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000976  F:transcription cis-regulatory region binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG afm:AFUA_5G00435  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MTGRPPSPSPIFPSLCIPTPTRNVDPQSYPSFARRMVANPPPIHLLSFVFQAAADSFDRHSWTCKAKHRKCDRCRPTCQACTDQGIPCDGYEVRLRWGSGIASRGLYAGAEAPVDTSIPPRVPGRRRDRIRARRAQQEGEIRTQVTEVTSSQDYAQEDSRPSPASFSFSSPGHSKDDEQLFQDFHDEQILLKLRLPALCQKSEALYRICIALQASLSGKPAACSLEYLEVGLNKFRAELSESEGNLEDGTLTAGLLLCTLGVMHGIPWTMHLRGMYTILRMHDVEGPQKHQERGAFRAHLFEVMGIMDLPTFSIGRRHPHLGFWRRYCCKGKSPAEIETGVEVVTGLPRSLLTIFAFIGKGTTEICFWDWPGAQGTFIQCQLWEAYRLAGVWVVRHGGPGFPRPSGTEATLDPAMRRGVTLTSTSVIVSRLLSSVDAVCRATLDPERWDTLIINAIAYPVCVAGLQSGILQRDPAMKELVRKNLLLTAEGPIWNRQYRLLLNLLEEYWTYPVGAVDIDQLAQARGVELGLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.44
4 0.39
5 0.37
6 0.42
7 0.47
8 0.46
9 0.49
10 0.5
11 0.52
12 0.54
13 0.54
14 0.52
15 0.48
16 0.46
17 0.43
18 0.42
19 0.37
20 0.35
21 0.31
22 0.29
23 0.34
24 0.4
25 0.44
26 0.41
27 0.43
28 0.45
29 0.43
30 0.4
31 0.33
32 0.27
33 0.2
34 0.21
35 0.19
36 0.14
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.13
44 0.14
45 0.18
46 0.17
47 0.21
48 0.24
49 0.31
50 0.38
51 0.47
52 0.57
53 0.63
54 0.73
55 0.8
56 0.85
57 0.88
58 0.91
59 0.92
60 0.9
61 0.91
62 0.89
63 0.88
64 0.85
65 0.81
66 0.76
67 0.69
68 0.65
69 0.61
70 0.54
71 0.46
72 0.4
73 0.34
74 0.27
75 0.26
76 0.2
77 0.18
78 0.19
79 0.19
80 0.2
81 0.22
82 0.22
83 0.2
84 0.22
85 0.21
86 0.18
87 0.19
88 0.17
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.13
93 0.12
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.1
105 0.1
106 0.13
107 0.17
108 0.25
109 0.32
110 0.42
111 0.5
112 0.58
113 0.64
114 0.72
115 0.79
116 0.82
117 0.86
118 0.86
119 0.82
120 0.82
121 0.8
122 0.74
123 0.69
124 0.67
125 0.6
126 0.55
127 0.5
128 0.4
129 0.35
130 0.31
131 0.25
132 0.16
133 0.14
134 0.09
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.18
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.2
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.2
152 0.2
153 0.21
154 0.22
155 0.19
156 0.23
157 0.22
158 0.24
159 0.23
160 0.23
161 0.22
162 0.25
163 0.3
164 0.28
165 0.28
166 0.27
167 0.24
168 0.22
169 0.23
170 0.17
171 0.12
172 0.12
173 0.1
174 0.08
175 0.14
176 0.17
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.18
181 0.19
182 0.21
183 0.23
184 0.25
185 0.25
186 0.25
187 0.24
188 0.24
189 0.26
190 0.28
191 0.21
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.14
197 0.12
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.13
227 0.17
228 0.17
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.15
233 0.14
234 0.09
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.12
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.18
272 0.18
273 0.2
274 0.23
275 0.25
276 0.24
277 0.24
278 0.27
279 0.25
280 0.28
281 0.3
282 0.28
283 0.26
284 0.28
285 0.26
286 0.23
287 0.2
288 0.15
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.09
301 0.11
302 0.16
303 0.19
304 0.24
305 0.24
306 0.3
307 0.39
308 0.44
309 0.5
310 0.51
311 0.57
312 0.55
313 0.61
314 0.62
315 0.57
316 0.55
317 0.58
318 0.58
319 0.57
320 0.58
321 0.56
322 0.53
323 0.49
324 0.41
325 0.32
326 0.26
327 0.17
328 0.13
329 0.09
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.08
345 0.09
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.06
351 0.07
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.15
359 0.14
360 0.13
361 0.15
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.14
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.11
381 0.1
382 0.12
383 0.12
384 0.12
385 0.15
386 0.21
387 0.22
388 0.21
389 0.22
390 0.22
391 0.25
392 0.25
393 0.24
394 0.2
395 0.18
396 0.21
397 0.23
398 0.21
399 0.18
400 0.18
401 0.18
402 0.15
403 0.15
404 0.12
405 0.11
406 0.13
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.14
413 0.13
414 0.12
415 0.11
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.1
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.15
429 0.17
430 0.18
431 0.21
432 0.24
433 0.27
434 0.26
435 0.27
436 0.23
437 0.21
438 0.24
439 0.19
440 0.16
441 0.14
442 0.15
443 0.13
444 0.13
445 0.11
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.08
454 0.11
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.19
460 0.2
461 0.21
462 0.23
463 0.23
464 0.32
465 0.38
466 0.46
467 0.42
468 0.41
469 0.4
470 0.4
471 0.39
472 0.33
473 0.27
474 0.22
475 0.22
476 0.24
477 0.25
478 0.24
479 0.29
480 0.3
481 0.29
482 0.28
483 0.31
484 0.31
485 0.34
486 0.35
487 0.31
488 0.3
489 0.32
490 0.29
491 0.25
492 0.23
493 0.2
494 0.16
495 0.15
496 0.12
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.08
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.1
508 0.11
509 0.1
510 0.08
511 0.08