Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9XYF4

Protein Details
Accession A0A0C9XYF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-331DGDLGEIRRRNKRKRAKAASLAKSNVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-164RKGRERVRERLNEGIEEKRRRAR
312-323RRRNKRKRAKAA
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MHPQPGIFSVPSSYGVPHKSSRAWNYPADVSDMSIYHIVGPSSRTHGDESNRKEISGRVVKEMIDRRDHGRHFTESTSALHSTSIQLSTQPETYALYNIRLFPLSLERSAMLAQVELEERHTLECIQVAYDEERERVEEEWRKGRERVRERLNEGIEEKRRRAREEKDGEGTLGDASLDTHFRLPITRKLRNKLGTSPPPTPLPPFSSVNGPREHVSCLPITSGPFLNPHSLSVDELPSPFPFPLTSTSIPNGSASTRALGAGIGSAGGRKRPKGGGVHQSQVVGGLGKSLAIFMSQSVKESEVDGDLGEIRRRNKRKRAKAASLAKSNVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.27
4 0.29
5 0.31
6 0.35
7 0.42
8 0.49
9 0.52
10 0.53
11 0.52
12 0.53
13 0.53
14 0.48
15 0.44
16 0.36
17 0.29
18 0.26
19 0.23
20 0.2
21 0.17
22 0.16
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.11
27 0.13
28 0.13
29 0.18
30 0.19
31 0.2
32 0.22
33 0.27
34 0.34
35 0.42
36 0.46
37 0.5
38 0.49
39 0.48
40 0.46
41 0.42
42 0.44
43 0.44
44 0.38
45 0.33
46 0.35
47 0.35
48 0.42
49 0.47
50 0.43
51 0.39
52 0.4
53 0.41
54 0.48
55 0.49
56 0.46
57 0.43
58 0.42
59 0.39
60 0.38
61 0.35
62 0.29
63 0.29
64 0.27
65 0.23
66 0.19
67 0.17
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.11
73 0.12
74 0.14
75 0.16
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.16
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.18
91 0.17
92 0.16
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.16
98 0.1
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.17
125 0.21
126 0.24
127 0.31
128 0.34
129 0.36
130 0.39
131 0.43
132 0.46
133 0.47
134 0.52
135 0.53
136 0.57
137 0.57
138 0.6
139 0.56
140 0.48
141 0.42
142 0.41
143 0.39
144 0.36
145 0.35
146 0.35
147 0.36
148 0.38
149 0.42
150 0.41
151 0.44
152 0.48
153 0.49
154 0.47
155 0.46
156 0.41
157 0.35
158 0.29
159 0.19
160 0.12
161 0.08
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.09
171 0.12
172 0.2
173 0.27
174 0.34
175 0.4
176 0.45
177 0.53
178 0.56
179 0.56
180 0.55
181 0.57
182 0.58
183 0.58
184 0.55
185 0.5
186 0.46
187 0.44
188 0.39
189 0.32
190 0.28
191 0.27
192 0.26
193 0.25
194 0.31
195 0.34
196 0.35
197 0.34
198 0.31
199 0.28
200 0.27
201 0.29
202 0.21
203 0.2
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.14
214 0.17
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.11
231 0.14
232 0.19
233 0.2
234 0.22
235 0.23
236 0.24
237 0.24
238 0.23
239 0.2
240 0.15
241 0.15
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.06
254 0.07
255 0.13
256 0.16
257 0.17
258 0.22
259 0.24
260 0.3
261 0.36
262 0.44
263 0.48
264 0.51
265 0.54
266 0.51
267 0.49
268 0.43
269 0.36
270 0.28
271 0.19
272 0.13
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.18
289 0.19
290 0.13
291 0.14
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.16
296 0.18
297 0.22
298 0.27
299 0.37
300 0.47
301 0.56
302 0.64
303 0.73
304 0.8
305 0.87
306 0.92
307 0.92
308 0.92
309 0.93
310 0.92
311 0.89