Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9Y9R5

Protein Details
Accession A0A0C9Y9R5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-285AYFVGKSKNAPKPRAKKEEKVYLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-55QKPRGGPAARGGK
85-108KAVEGGRGRGRGGRGGPGRGGRGR
268-281SKNAPKPRAKKEEK
288-327ARFERPDRGGRGRGRGGDRGGDRGDRGRGGRGRGGARGGR
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 12, nucl 8.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVASKNPFALLDAEDASRPSSPVAVPVTDAPTPPTAPARGSQKPRGGPAARGGKYYSRGGKPAAKDVNPNQTVEELPTAEGERKAVEGGRGRGRGGRGGPGRGGRGRQYDRHSQTGRIDTDKRIHQSWGGDDGNTELKAEEAATVDAAVESTANDWAGDAPVASEWGVPDAGADAWAAPAPDAAAVTTPVAEGERPEGRQRREREPEEEDNTLTLDQYLAQQKEKDSVVPKLENTRKANEGADANIWKDVVPLAKNEEENAYFVGKSKNAPKPRAKKEEKVYLEIDARFERPDRGGRGRGRGGDRGGDRGDRGRGGRGRGGARGGRQNGSPVINVDDQTAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.16
6 0.15
7 0.12
8 0.13
9 0.12
10 0.17
11 0.19
12 0.18
13 0.19
14 0.21
15 0.25
16 0.23
17 0.24
18 0.21
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.23
23 0.2
24 0.21
25 0.26
26 0.32
27 0.37
28 0.44
29 0.51
30 0.55
31 0.57
32 0.6
33 0.63
34 0.58
35 0.53
36 0.54
37 0.56
38 0.49
39 0.47
40 0.46
41 0.41
42 0.43
43 0.46
44 0.45
45 0.38
46 0.39
47 0.42
48 0.46
49 0.44
50 0.5
51 0.5
52 0.44
53 0.48
54 0.51
55 0.57
56 0.52
57 0.49
58 0.41
59 0.35
60 0.33
61 0.28
62 0.24
63 0.14
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.15
75 0.18
76 0.23
77 0.3
78 0.3
79 0.31
80 0.33
81 0.33
82 0.33
83 0.29
84 0.32
85 0.28
86 0.29
87 0.31
88 0.31
89 0.34
90 0.32
91 0.33
92 0.29
93 0.35
94 0.37
95 0.4
96 0.43
97 0.49
98 0.51
99 0.58
100 0.55
101 0.5
102 0.51
103 0.52
104 0.48
105 0.43
106 0.42
107 0.36
108 0.4
109 0.41
110 0.39
111 0.34
112 0.32
113 0.3
114 0.29
115 0.27
116 0.29
117 0.24
118 0.21
119 0.19
120 0.2
121 0.19
122 0.17
123 0.15
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.07
182 0.1
183 0.11
184 0.18
185 0.24
186 0.28
187 0.36
188 0.4
189 0.46
190 0.53
191 0.56
192 0.55
193 0.56
194 0.59
195 0.55
196 0.52
197 0.43
198 0.34
199 0.31
200 0.25
201 0.18
202 0.11
203 0.06
204 0.05
205 0.09
206 0.14
207 0.15
208 0.17
209 0.18
210 0.19
211 0.22
212 0.23
213 0.23
214 0.2
215 0.24
216 0.28
217 0.28
218 0.29
219 0.36
220 0.41
221 0.45
222 0.45
223 0.44
224 0.42
225 0.41
226 0.41
227 0.34
228 0.29
229 0.23
230 0.23
231 0.2
232 0.18
233 0.17
234 0.16
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.16
242 0.19
243 0.19
244 0.2
245 0.22
246 0.19
247 0.19
248 0.19
249 0.16
250 0.13
251 0.15
252 0.17
253 0.15
254 0.18
255 0.26
256 0.34
257 0.41
258 0.5
259 0.58
260 0.66
261 0.75
262 0.82
263 0.81
264 0.81
265 0.82
266 0.84
267 0.79
268 0.73
269 0.64
270 0.58
271 0.55
272 0.47
273 0.41
274 0.33
275 0.29
276 0.26
277 0.26
278 0.24
279 0.23
280 0.29
281 0.32
282 0.37
283 0.44
284 0.48
285 0.55
286 0.57
287 0.6
288 0.58
289 0.57
290 0.52
291 0.51
292 0.48
293 0.45
294 0.42
295 0.37
296 0.34
297 0.34
298 0.35
299 0.31
300 0.31
301 0.35
302 0.37
303 0.4
304 0.42
305 0.44
306 0.43
307 0.42
308 0.47
309 0.43
310 0.45
311 0.49
312 0.48
313 0.44
314 0.42
315 0.43
316 0.41
317 0.39
318 0.35
319 0.27
320 0.28
321 0.28
322 0.28
323 0.26
324 0.23
325 0.21
326 0.21