Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9YQB6

Protein Details
Accession A0A0C9YQB6    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-114DVDNTLKWIKRSKKKEKELAKKRQEEIDNHydrophilic
169-188AEEERRQKIKELKIKKRDYTBasic
268-294EGDFGFKKPKTKKKRPSRRAPAVEDILBasic
674-699AQPLAKGKTEKAKKKKENQASKPAADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-108IKRSKKKEKELAKKR
274-287KKPKTKKKRPSRRA
601-627SHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKK
679-690KGKTEKAKKKKE
770-786KRKAGQEAAGSPPPKRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.333, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSMEESISLEETNKIRISLGLKPLTDDKAPADDKDKQAEDNYAKQRDREAKERQAKTIQNGIAKVRNRRELNASLKGATLGDAEGDVDNTLKWIKRSKKKEKELAKKRQEEIDNRDKASEPEYSERDLVGLKVSHDFDGMDEGEAHILTLKDSRILDNEEDELQNVEMAEEERRQKIKELKIKKRDYTGYDDDEFTEGNQGVMKRSVLAKYDEDIEGVREMDFRLGSSITSSKKEQAEQRQAAAAAVNKSLLTIDYAKNLETKDYLQEGDFGFKKPKTKKKRPSRRAPAVEDILESKMDVDQEPIVPRVRDLDANFVDDDELQAALARSRRAKLLKTKKLTPEELARKITERREQEVDASLKVEVVDDDKEETGLTFDDTSEFVRAVGSNQSLVKPKPEPKEIPVPNGRSVSQRSPSRDQAMVSGDIALDELEAGEVRVKDEEDEDYDIAMMEAVDGLIRSVEAEGLATDQDKSSLADGVGTSSEETFSTGMASTLSILRQQGIIAQPSAELKERERRQLERDRFVADQRLRDAQREIDRLQARGSNKDQAQREYDNRLREQQDARDKMDAFKDYKPDVNIVYYDEFGRALTPKEAWKALSHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKKEAMASGDTPLSMNKAFQQRQEKAGQAHFVLSVGNRGAVPQAEDFLDAQPLAKGKTEKAKKKKENQASKPAADAGFMTVPAPPVQIVPAGSSPGPSGLNSMSASPVPRAGFSRISSAVDTPSQSQGGTPVPADRAKVAFGLGLKRKAGQEAAGSPPPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.39
10 0.43
11 0.43
12 0.4
13 0.34
14 0.28
15 0.31
16 0.33
17 0.32
18 0.34
19 0.38
20 0.41
21 0.47
22 0.46
23 0.4
24 0.41
25 0.47
26 0.46
27 0.48
28 0.53
29 0.53
30 0.53
31 0.52
32 0.59
33 0.6
34 0.62
35 0.61
36 0.62
37 0.64
38 0.73
39 0.75
40 0.73
41 0.72
42 0.71
43 0.67
44 0.67
45 0.6
46 0.55
47 0.54
48 0.53
49 0.52
50 0.52
51 0.56
52 0.55
53 0.6
54 0.58
55 0.59
56 0.61
57 0.62
58 0.64
59 0.63
60 0.58
61 0.49
62 0.46
63 0.43
64 0.35
65 0.27
66 0.2
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.11
78 0.12
79 0.15
80 0.24
81 0.34
82 0.44
83 0.56
84 0.66
85 0.74
86 0.82
87 0.89
88 0.91
89 0.92
90 0.93
91 0.93
92 0.92
93 0.9
94 0.83
95 0.82
96 0.79
97 0.76
98 0.74
99 0.74
100 0.69
101 0.61
102 0.59
103 0.51
104 0.45
105 0.39
106 0.34
107 0.28
108 0.29
109 0.31
110 0.32
111 0.32
112 0.3
113 0.28
114 0.24
115 0.2
116 0.17
117 0.15
118 0.13
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.13
125 0.16
126 0.16
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.21
143 0.21
144 0.21
145 0.22
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.17
150 0.14
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.13
158 0.16
159 0.21
160 0.23
161 0.25
162 0.31
163 0.38
164 0.46
165 0.51
166 0.59
167 0.65
168 0.73
169 0.81
170 0.79
171 0.78
172 0.75
173 0.7
174 0.67
175 0.63
176 0.58
177 0.51
178 0.47
179 0.4
180 0.35
181 0.3
182 0.21
183 0.18
184 0.12
185 0.1
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.12
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.23
199 0.21
200 0.19
201 0.17
202 0.16
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.14
216 0.15
217 0.18
218 0.2
219 0.24
220 0.26
221 0.31
222 0.36
223 0.42
224 0.5
225 0.49
226 0.49
227 0.46
228 0.43
229 0.39
230 0.33
231 0.26
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.14
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.14
254 0.16
255 0.15
256 0.19
257 0.18
258 0.17
259 0.2
260 0.21
261 0.29
262 0.36
263 0.46
264 0.52
265 0.63
266 0.72
267 0.79
268 0.88
269 0.91
270 0.93
271 0.94
272 0.94
273 0.91
274 0.87
275 0.82
276 0.74
277 0.63
278 0.53
279 0.43
280 0.33
281 0.24
282 0.18
283 0.11
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.11
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.15
297 0.17
298 0.16
299 0.22
300 0.21
301 0.22
302 0.22
303 0.19
304 0.18
305 0.15
306 0.14
307 0.07
308 0.06
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.08
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.18
318 0.2
319 0.26
320 0.35
321 0.44
322 0.51
323 0.55
324 0.61
325 0.65
326 0.68
327 0.65
328 0.57
329 0.56
330 0.54
331 0.54
332 0.49
333 0.42
334 0.39
335 0.4
336 0.42
337 0.39
338 0.34
339 0.33
340 0.35
341 0.35
342 0.34
343 0.35
344 0.31
345 0.25
346 0.22
347 0.17
348 0.14
349 0.13
350 0.12
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.14
380 0.14
381 0.16
382 0.19
383 0.25
384 0.29
385 0.34
386 0.35
387 0.35
388 0.46
389 0.44
390 0.46
391 0.46
392 0.44
393 0.41
394 0.41
395 0.38
396 0.31
397 0.33
398 0.31
399 0.32
400 0.33
401 0.36
402 0.39
403 0.42
404 0.42
405 0.4
406 0.36
407 0.31
408 0.29
409 0.24
410 0.19
411 0.15
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.06
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.02
420 0.02
421 0.03
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.07
438 0.05
439 0.03
440 0.02
441 0.02
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.04
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.1
490 0.11
491 0.13
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.14
497 0.13
498 0.12
499 0.14
500 0.24
501 0.27
502 0.35
503 0.39
504 0.41
505 0.46
506 0.56
507 0.6
508 0.57
509 0.55
510 0.51
511 0.47
512 0.46
513 0.47
514 0.39
515 0.35
516 0.31
517 0.37
518 0.34
519 0.35
520 0.35
521 0.32
522 0.36
523 0.37
524 0.35
525 0.36
526 0.37
527 0.36
528 0.36
529 0.34
530 0.29
531 0.31
532 0.33
533 0.32
534 0.33
535 0.39
536 0.41
537 0.4
538 0.43
539 0.43
540 0.43
541 0.45
542 0.47
543 0.46
544 0.45
545 0.48
546 0.45
547 0.45
548 0.45
549 0.45
550 0.5
551 0.49
552 0.49
553 0.47
554 0.45
555 0.43
556 0.43
557 0.39
558 0.32
559 0.31
560 0.34
561 0.31
562 0.34
563 0.33
564 0.3
565 0.27
566 0.25
567 0.23
568 0.2
569 0.2
570 0.17
571 0.16
572 0.14
573 0.13
574 0.11
575 0.12
576 0.1
577 0.11
578 0.11
579 0.13
580 0.16
581 0.19
582 0.21
583 0.21
584 0.24
585 0.29
586 0.34
587 0.4
588 0.41
589 0.46
590 0.47
591 0.48
592 0.53
593 0.5
594 0.51
595 0.51
596 0.54
597 0.51
598 0.56
599 0.59
600 0.6
601 0.67
602 0.67
603 0.66
604 0.68
605 0.66
606 0.68
607 0.73
608 0.74
609 0.75
610 0.75
611 0.74
612 0.72
613 0.72
614 0.61
615 0.53
616 0.45
617 0.39
618 0.33
619 0.3
620 0.23
621 0.2
622 0.2
623 0.19
624 0.18
625 0.14
626 0.12
627 0.15
628 0.25
629 0.27
630 0.34
631 0.44
632 0.44
633 0.5
634 0.54
635 0.53
636 0.48
637 0.49
638 0.45
639 0.36
640 0.34
641 0.28
642 0.23
643 0.2
644 0.15
645 0.14
646 0.11
647 0.11
648 0.1
649 0.1
650 0.12
651 0.11
652 0.13
653 0.11
654 0.12
655 0.12
656 0.13
657 0.14
658 0.13
659 0.14
660 0.11
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.12
665 0.16
666 0.17
667 0.2
668 0.3
669 0.4
670 0.49
671 0.59
672 0.69
673 0.75
674 0.84
675 0.9
676 0.91
677 0.92
678 0.91
679 0.91
680 0.88
681 0.79
682 0.71
683 0.64
684 0.53
685 0.43
686 0.34
687 0.26
688 0.19
689 0.18
690 0.15
691 0.12
692 0.13
693 0.13
694 0.13
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.12
699 0.11
700 0.13
701 0.14
702 0.16
703 0.15
704 0.16
705 0.15
706 0.15
707 0.16
708 0.13
709 0.15
710 0.13
711 0.16
712 0.16
713 0.16
714 0.16
715 0.16
716 0.18
717 0.16
718 0.2
719 0.18
720 0.2
721 0.22
722 0.25
723 0.28
724 0.28
725 0.33
726 0.31
727 0.33
728 0.32
729 0.3
730 0.29
731 0.27
732 0.27
733 0.24
734 0.25
735 0.23
736 0.21
737 0.2
738 0.2
739 0.21
740 0.21
741 0.19
742 0.18
743 0.22
744 0.24
745 0.25
746 0.25
747 0.23
748 0.23
749 0.22
750 0.2
751 0.18
752 0.19
753 0.27
754 0.31
755 0.34
756 0.34
757 0.37
758 0.38
759 0.4
760 0.39
761 0.33
762 0.32
763 0.32
764 0.38
765 0.42
766 0.42