Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WJY5

Protein Details
Accession Q4WJY5    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-428LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-265KKAAKK
406-419KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
KEGG afm:AFUA_1G04370  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAAQKVKKASSKATVEKSKAKTVAPPPELVASVAAFLSQFGFKSTSEALSKEQSKKAIAKVDSKEVPSLLDIFRSWQDRKSESSSDSESSSSSSEDESSDSDVEMNDAPKMQKKQSRESSPSSSSSSSSSSSSSSDSDADDEEDDDAAPAPAPAPKTTGTKRKAESSSSESSSESESEDEAPKAKKAKLSTKSDSSSSSESSDSEDEESDSSDSESSASSSDSDSDSGSDSDSSDSESVSSSDSSSDSDSDSESEKEPAKKAAKKILKTAAKTPLPESSSSSSSDSDSSSSDESSDESSSDEDQNTNSRSSSSSQNSSGSSKTVQPSDSDAKEPINKTTKKAQETSSSSASPAPGNGPATKKKHTGARPTPLAQLSELPHNHPSNAYVPYAYAEKAWKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.7
3 0.74
4 0.72
5 0.72
6 0.66
7 0.59
8 0.58
9 0.58
10 0.63
11 0.57
12 0.53
13 0.47
14 0.46
15 0.45
16 0.36
17 0.28
18 0.18
19 0.15
20 0.13
21 0.11
22 0.08
23 0.07
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.12
29 0.12
30 0.16
31 0.17
32 0.2
33 0.21
34 0.23
35 0.24
36 0.3
37 0.38
38 0.4
39 0.43
40 0.42
41 0.45
42 0.48
43 0.51
44 0.51
45 0.48
46 0.51
47 0.51
48 0.56
49 0.55
50 0.52
51 0.48
52 0.4
53 0.36
54 0.29
55 0.27
56 0.19
57 0.17
58 0.15
59 0.16
60 0.2
61 0.25
62 0.25
63 0.28
64 0.33
65 0.33
66 0.39
67 0.42
68 0.43
69 0.39
70 0.43
71 0.41
72 0.37
73 0.36
74 0.31
75 0.25
76 0.21
77 0.2
78 0.15
79 0.12
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.09
94 0.11
95 0.12
96 0.18
97 0.23
98 0.28
99 0.32
100 0.37
101 0.47
102 0.55
103 0.63
104 0.63
105 0.65
106 0.66
107 0.64
108 0.62
109 0.55
110 0.46
111 0.38
112 0.34
113 0.29
114 0.23
115 0.2
116 0.18
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.12
143 0.18
144 0.24
145 0.33
146 0.36
147 0.41
148 0.43
149 0.49
150 0.5
151 0.47
152 0.46
153 0.43
154 0.44
155 0.4
156 0.38
157 0.31
158 0.29
159 0.27
160 0.22
161 0.16
162 0.11
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.19
171 0.2
172 0.21
173 0.25
174 0.35
175 0.4
176 0.48
177 0.51
178 0.53
179 0.53
180 0.51
181 0.48
182 0.42
183 0.35
184 0.28
185 0.25
186 0.19
187 0.17
188 0.18
189 0.16
190 0.13
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.12
242 0.15
243 0.17
244 0.18
245 0.24
246 0.3
247 0.34
248 0.37
249 0.44
250 0.48
251 0.48
252 0.54
253 0.56
254 0.55
255 0.53
256 0.55
257 0.55
258 0.5
259 0.49
260 0.44
261 0.4
262 0.36
263 0.34
264 0.32
265 0.26
266 0.25
267 0.26
268 0.26
269 0.21
270 0.2
271 0.2
272 0.16
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.12
291 0.16
292 0.18
293 0.18
294 0.16
295 0.15
296 0.16
297 0.18
298 0.26
299 0.26
300 0.28
301 0.29
302 0.31
303 0.33
304 0.33
305 0.31
306 0.25
307 0.22
308 0.23
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.22
313 0.27
314 0.32
315 0.32
316 0.29
317 0.28
318 0.29
319 0.34
320 0.34
321 0.35
322 0.38
323 0.38
324 0.4
325 0.48
326 0.53
327 0.52
328 0.55
329 0.52
330 0.52
331 0.57
332 0.58
333 0.53
334 0.45
335 0.4
336 0.38
337 0.35
338 0.26
339 0.2
340 0.17
341 0.16
342 0.18
343 0.21
344 0.25
345 0.32
346 0.37
347 0.41
348 0.44
349 0.45
350 0.52
351 0.56
352 0.62
353 0.63
354 0.67
355 0.69
356 0.67
357 0.69
358 0.62
359 0.55
360 0.45
361 0.4
362 0.33
363 0.34
364 0.33
365 0.3
366 0.35
367 0.35
368 0.34
369 0.31
370 0.31
371 0.27
372 0.28
373 0.26
374 0.19
375 0.18
376 0.2
377 0.21
378 0.18
379 0.16
380 0.17
381 0.17
382 0.21
383 0.21
384 0.2
385 0.21
386 0.25
387 0.31
388 0.36
389 0.38
390 0.37
391 0.42
392 0.43
393 0.47
394 0.5
395 0.53
396 0.55
397 0.63
398 0.71
399 0.76
400 0.85
401 0.87
402 0.9
403 0.91
404 0.9
405 0.9
406 0.89
407 0.88
408 0.88
409 0.83
410 0.72
411 0.62
412 0.57
413 0.48
414 0.43
415 0.34
416 0.26
417 0.23