FuNGI

Q4WDD1

Protein Details

Accession

Q4WDD1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MPKFVPRQRKQKHRQNSSNDAAVD	Hydrophilic
31-75	LPISKSEREARKQKLREELRAQHTKISAKKQKRLDKYIENKLKKE	Hydrophilic
176-199	GPDGFPVLKKRKRAPKAKPAAVSV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-66	EARKQKLREELRAQHTKISAKKQKRLDK
183-194	LKKRKRAPKAKP

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR011709 DEAD-box_helicase_OB_fold IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR002464 DNA/RNA_helicase_DEAH_CS IPR007502 Helicase-assoc_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005524 F:ATP binding GO:0004386 F:helicase activity GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	afm:AFUA_6G04330 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF04408 HA2 PF00271 Helicase_C PF07717 OB_NTP_bind
PROSITE	View protein in PROSITE PS00690 DEAH_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17982 DEXHc_DHX37 cd18791 SF2_C_RHA

Amino Acid Sequences

MPKFVPRQRKQKHRQNSSNDAAVDTNAVEILPISKSEREARKQKLREELRAQHTKISAKKQKRLDKYIENKLKKEENVELLKKLEKIKVDTSALQSSKELGKRKREDENIVPTTTTKDVSTSHNQNSDSELSGDETDDSFVDPKGTTKRKLAETAPAPPIPAPVIGGGLKRPLELGPDGFPVLKKRKRAPKAKPAAVSVPEVPWEGFNSDDGNDSAGSSDEEPEDSEIDAETKNVQDGEKDASSDNDESDEEDSGSDNEEEDEEDEDDEEGVVDDEEAESLAQLRIKPRQSAFKEWARQQINEVVGFKPSGPITAEEQPFVRESKRPVRNTVAEEEPLPLELQVTKGDPNRKAFSVQVDRSEEVQNSRLGLPVVGEEQKIMEAIHNNSSIVIWGATGSGKTTQLPQFLFEAGYGHPDSPNPGMIAVTQPRRVAAVSMAKRVADELGQYSDRVAYQIRFESNVSSKTAIKFMTDGILIREIAEDFALKKYSVIVIDEAHERSVNTDILIGMVSRIIDLRKAMSEEDPSIKPLKLVVMSATLRISDFTQNPSLFRQGPPPLVQAEGRQYPVTVHFARRTHRDYVEEAYRKVCRGHRKLPPGGMLVFLTGQNEIRHLAKRLKQTFKPTQRGEATQAKVQLSANDAPLEAEDLDLGGADLSHLGNEDDESDLEITGLDENPEEDEEFNLGEEAMDSSTRVHVLPLYSQLPTKEQLKVFEPPPEGSRLIVLATNVAETSLTIPGIKYVFDCGRAKEKQYDLETGVQKFQIGWISKASANQRAGRAGRTGPGHCYRLYSSAIYEGEFAEYTDPEILRTPIEGVVLQMKSMGLHNVINFPFPTPPSRQGLAKAEKLLKNLGALSANGKITQIGHRLSTYPLSPRFSKMLHIGHQHGCMPYVIALVSALAVGDLFIPENQIDPATSKEEDKSDGVYKNSDRLEDTAREQRHKDYTRAERLFSKHDDTSDAMKYLSAICAYAYASNGDSFCDQMFLRAKAFKEATQLRQQLTDIVRANNPGLIGAYEPRLPEPTDKQIKALKQIVTAGFIDNVAIRADLAPVPPEMDRTPKRAIDVPYLTLFRSREGRATELQEKAVYVHPSSVLARLSPKEMPQYLVYSHLQQSAPSLLSDQVPRIRMYPLAAPSGLQLSAIAHGTPLIEYGKPIGKIEPMDGVPQRRACWVIPSLVGEAGGTSWPLPAKKVIQRKDIKDGWVIEKFTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.93
2	0.91
3	0.91
4	0.86
5	0.82
6	0.72
7	0.63
8	0.52
9	0.42
10	0.34
11	0.24
12	0.17
13	0.1
14	0.09
15	0.07
16	0.07
17	0.08
18	0.07
19	0.09
20	0.12
21	0.14
22	0.18
23	0.27
24	0.36
25	0.44
26	0.53
27	0.62
28	0.69
29	0.75
30	0.78
31	0.8
32	0.79
33	0.8
34	0.8
35	0.8
36	0.79
37	0.81
38	0.75
39	0.7
40	0.67
41	0.65
42	0.62
43	0.63
44	0.64
45	0.64
46	0.71
47	0.76
48	0.81
49	0.83
50	0.85
51	0.83
52	0.83
53	0.83
54	0.86
55	0.87
56	0.83
57	0.77
58	0.75
59	0.74
60	0.66
61	0.62
62	0.58
63	0.56
64	0.58
65	0.58
66	0.54
67	0.49
68	0.5
69	0.48
70	0.46
71	0.42
72	0.37
73	0.39
74	0.41
75	0.45
76	0.46
77	0.46
78	0.46
79	0.5
80	0.46
81	0.42
82	0.37
83	0.34
84	0.36
85	0.38
86	0.42
87	0.41
88	0.51
89	0.58
90	0.63
91	0.7
92	0.7
93	0.72
94	0.72
95	0.75
96	0.68
97	0.61
98	0.56
99	0.47
100	0.43
101	0.37
102	0.29
103	0.19
104	0.17
105	0.18
106	0.24
107	0.33
108	0.37
109	0.41
110	0.45
111	0.46
112	0.45
113	0.47
114	0.43
115	0.35
116	0.28
117	0.23
118	0.19
119	0.19
120	0.19
121	0.15
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.11
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.1
130	0.14
131	0.24
132	0.3
133	0.33
134	0.39
135	0.46
136	0.5
137	0.55
138	0.54
139	0.54
140	0.52
141	0.56
142	0.55
143	0.48
144	0.44
145	0.38
146	0.37
147	0.28
148	0.23
149	0.16
150	0.11
151	0.13
152	0.13
153	0.14
154	0.14
155	0.17
156	0.17
157	0.16
158	0.17
159	0.15
160	0.17
161	0.18
162	0.19
163	0.17
164	0.19
165	0.2
166	0.2
167	0.21
168	0.25
169	0.33
170	0.36
171	0.41
172	0.49
173	0.59
174	0.68
175	0.78
176	0.8
177	0.81
178	0.87
179	0.87
180	0.83
181	0.77
182	0.74
183	0.65
184	0.59
185	0.49
186	0.39
187	0.32
188	0.29
189	0.24
190	0.18
191	0.17
192	0.14
193	0.13
194	0.12
195	0.12
196	0.12
197	0.13
198	0.13
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.09
206	0.1
207	0.09
208	0.1
209	0.1
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.12
225	0.17
226	0.16
227	0.17
228	0.16
229	0.17
230	0.2
231	0.2
232	0.19
233	0.14
234	0.14
235	0.14
236	0.15
237	0.14
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.11
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.07
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.03
267	0.05
268	0.06
269	0.08
270	0.1
271	0.14
272	0.21
273	0.24
274	0.3
275	0.32
276	0.41
277	0.45
278	0.52
279	0.55
280	0.57
281	0.62
282	0.6
283	0.66
284	0.6
285	0.55
286	0.49
287	0.48
288	0.42
289	0.37
290	0.34
291	0.25
292	0.22
293	0.22
294	0.19
295	0.16
296	0.13
297	0.12
298	0.12
299	0.14
300	0.17
301	0.25
302	0.25
303	0.23
304	0.24
305	0.23
306	0.23
307	0.23
308	0.2
309	0.17
310	0.23
311	0.32
312	0.41
313	0.43
314	0.48
315	0.54
316	0.57
317	0.58
318	0.56
319	0.49
320	0.41
321	0.38
322	0.34
323	0.26
324	0.21
325	0.17
326	0.12
327	0.09
328	0.08
329	0.09
330	0.08
331	0.09
332	0.12
333	0.17
334	0.24
335	0.28
336	0.34
337	0.36
338	0.36
339	0.37
340	0.35
341	0.39
342	0.42
343	0.4
344	0.4
345	0.41
346	0.4
347	0.41
348	0.42
349	0.34
350	0.27
351	0.27
352	0.21
353	0.19
354	0.19
355	0.17
356	0.15
357	0.13
358	0.11
359	0.1
360	0.12
361	0.11
362	0.11
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.08
369	0.1
370	0.12
371	0.16
372	0.16
373	0.16
374	0.15
375	0.15
376	0.14
377	0.11
378	0.08
379	0.05
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.13
389	0.16
390	0.19
391	0.2
392	0.2
393	0.2
394	0.2
395	0.19
396	0.14
397	0.13
398	0.09
399	0.12
400	0.12
401	0.11
402	0.1
403	0.1
404	0.13
405	0.12
406	0.13
407	0.1
408	0.1
409	0.09
410	0.09
411	0.14
412	0.16
413	0.19
414	0.2
415	0.2
416	0.2
417	0.21
418	0.2
419	0.17
420	0.16
421	0.22
422	0.22
423	0.26
424	0.26
425	0.25
426	0.25
427	0.25
428	0.21
429	0.12
430	0.1
431	0.08
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.08
441	0.1
442	0.13
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.18
447	0.19
448	0.2
449	0.19
450	0.19
451	0.2
452	0.19
453	0.22
454	0.18
455	0.16
456	0.14
457	0.13
458	0.13
459	0.11
460	0.1
461	0.09
462	0.1
463	0.1
464	0.09
465	0.09
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.09
477	0.1
478	0.1
479	0.09
480	0.09
481	0.11
482	0.13
483	0.13
484	0.12
485	0.11
486	0.1
487	0.1
488	0.12
489	0.1
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.06
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.05
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.08
507	0.09
508	0.1
509	0.12
510	0.13
511	0.17
512	0.16
513	0.17
514	0.18
515	0.17
516	0.16
517	0.14
518	0.14
519	0.11
520	0.11
521	0.1
522	0.13
523	0.13
524	0.14
525	0.13
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.12
530	0.11
531	0.12
532	0.14
533	0.18
534	0.18
535	0.19
536	0.2
537	0.22
538	0.2
539	0.2
540	0.23
541	0.21
542	0.23
543	0.24
544	0.24
545	0.21
546	0.21
547	0.21
548	0.16
549	0.18
550	0.17
551	0.17
552	0.15
553	0.14
554	0.14
555	0.15
556	0.19
557	0.16
558	0.17
559	0.21
560	0.24
561	0.26
562	0.31
563	0.34
564	0.33
565	0.33
566	0.33
567	0.3
568	0.32
569	0.38
570	0.34
571	0.31
572	0.29
573	0.28
574	0.27
575	0.28
576	0.29
577	0.3
578	0.35
579	0.43
580	0.48
581	0.55
582	0.58
583	0.58
584	0.56
585	0.47
586	0.4
587	0.33
588	0.25
589	0.17
590	0.14
591	0.11
592	0.08
593	0.06
594	0.07
595	0.06
596	0.07
597	0.08
598	0.09
599	0.1
600	0.13
601	0.18
602	0.22
603	0.31
604	0.39
605	0.45
606	0.47
607	0.54
608	0.62
609	0.65
610	0.69
611	0.61
612	0.61
613	0.57
614	0.55
615	0.52
616	0.49
617	0.42
618	0.35
619	0.37
620	0.3
621	0.28
622	0.26
623	0.21
624	0.17
625	0.16
626	0.15
627	0.12
628	0.12
629	0.1
630	0.1
631	0.1
632	0.07
633	0.05
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.03
638	0.03
639	0.02
640	0.02
641	0.02
642	0.03
643	0.02
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.05
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.06
669	0.06
670	0.05
671	0.05
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.05
680	0.05
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.07
686	0.08
687	0.11
688	0.12
689	0.12
690	0.13
691	0.14
692	0.15
693	0.16
694	0.18
695	0.19
696	0.19
697	0.21
698	0.23
699	0.26
700	0.26
701	0.29
702	0.29
703	0.25
704	0.25
705	0.26
706	0.24
707	0.2
708	0.19
709	0.13
710	0.12
711	0.11
712	0.1
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.06
717	0.06
718	0.05
719	0.04
720	0.06
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.07
726	0.07
727	0.08
728	0.06
729	0.1
730	0.1
731	0.15
732	0.17
733	0.18
734	0.25
735	0.27
736	0.29
737	0.31
738	0.33
739	0.34
740	0.36
741	0.37
742	0.31
743	0.37
744	0.37
745	0.32
746	0.31
747	0.25
748	0.22
749	0.19
750	0.18
751	0.17
752	0.15
753	0.15
754	0.15
755	0.17
756	0.18
757	0.23
758	0.24
759	0.25
760	0.28
761	0.3
762	0.3
763	0.33
764	0.33
765	0.31
766	0.3
767	0.24
768	0.24
769	0.25
770	0.24
771	0.25
772	0.29
773	0.29
774	0.27
775	0.29
776	0.26
777	0.26
778	0.27
779	0.21
780	0.17
781	0.19
782	0.19
783	0.17
784	0.16
785	0.13
786	0.12
787	0.11
788	0.11
789	0.07
790	0.07
791	0.07
792	0.09
793	0.08
794	0.08
795	0.09
796	0.1
797	0.09
798	0.1
799	0.1
800	0.09
801	0.09
802	0.09
803	0.08
804	0.13
805	0.13
806	0.12
807	0.11
808	0.1
809	0.1
810	0.11
811	0.11
812	0.07
813	0.09
814	0.1
815	0.14
816	0.15
817	0.15
818	0.15
819	0.15
820	0.15
821	0.15
822	0.19
823	0.19
824	0.23
825	0.27
826	0.29
827	0.29
828	0.32
829	0.39
830	0.41
831	0.4
832	0.41
833	0.43
834	0.43
835	0.43
836	0.4
837	0.32
838	0.28
839	0.24
840	0.21
841	0.15
842	0.13
843	0.13
844	0.14
845	0.14
846	0.13
847	0.13
848	0.12
849	0.12
850	0.16
851	0.19
852	0.17
853	0.18
854	0.18
855	0.19
856	0.21
857	0.21
858	0.19
859	0.21
860	0.24
861	0.27
862	0.28
863	0.3
864	0.32
865	0.3
866	0.31
867	0.32
868	0.33
869	0.34
870	0.37
871	0.39
872	0.39
873	0.4
874	0.39
875	0.33
876	0.28
877	0.23
878	0.19
879	0.14
880	0.11
881	0.09
882	0.07
883	0.06
884	0.05
885	0.05
886	0.04
887	0.04
888	0.03
889	0.03
890	0.03
891	0.03
892	0.03
893	0.04
894	0.04
895	0.05
896	0.05
897	0.06
898	0.06
899	0.07
900	0.07
901	0.08
902	0.11
903	0.13
904	0.14
905	0.15
906	0.17
907	0.18
908	0.2
909	0.2
910	0.21
911	0.23
912	0.26
913	0.26
914	0.29
915	0.28
916	0.32
917	0.32
918	0.29
919	0.25
920	0.25
921	0.29
922	0.27
923	0.3
924	0.33
925	0.36
926	0.39
927	0.4
928	0.42
929	0.47
930	0.48
931	0.48
932	0.5
933	0.55
934	0.62
935	0.62
936	0.59
937	0.56
938	0.55
939	0.56
940	0.51
941	0.47
942	0.38
943	0.37
944	0.37
945	0.33
946	0.34
947	0.31
948	0.27
949	0.21
950	0.19
951	0.19
952	0.17
953	0.16
954	0.11
955	0.08
956	0.08
957	0.09
958	0.09
959	0.1
960	0.09
961	0.09
962	0.1
963	0.11
964	0.11
965	0.12
966	0.11
967	0.11
968	0.1
969	0.12
970	0.1
971	0.15
972	0.2
973	0.2
974	0.23
975	0.26
976	0.27
977	0.32
978	0.34
979	0.3
980	0.34
981	0.39
982	0.42
983	0.48
984	0.51
985	0.45
986	0.45
987	0.44
988	0.41
989	0.37
990	0.37
991	0.31
992	0.3
993	0.3
994	0.3
995	0.3
996	0.25
997	0.23
998	0.16
999	0.13
1000	0.11
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.14
1007	0.16
1008	0.17
1009	0.21
1010	0.25
1011	0.34
1012	0.41
1013	0.41
1014	0.45
1015	0.49
1016	0.51
1017	0.54
1018	0.55
1019	0.46
1020	0.4
1021	0.44
1022	0.4
1023	0.37
1024	0.34
1025	0.27
1026	0.21
1027	0.18
1028	0.16
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.09
1032	0.08
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.09
1036	0.09
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.12
1041	0.12
1042	0.15
1043	0.15
1044	0.24
1045	0.26
1046	0.31
1047	0.37
1048	0.37
1049	0.4
1050	0.43
1051	0.46
1052	0.46
1053	0.46
1054	0.44
1055	0.42
1056	0.42
1057	0.39
1058	0.37
1059	0.33
1060	0.27
1061	0.29
1062	0.27
1063	0.29
1064	0.31
1065	0.35
1066	0.35
1067	0.42
1068	0.45
1069	0.41
1070	0.41
1071	0.36
1072	0.33
1073	0.31
1074	0.32
1075	0.27
1076	0.21
1077	0.21
1078	0.2
1079	0.21
1080	0.22
1081	0.23
1082	0.19
1083	0.17
1084	0.22
1085	0.22
1086	0.25
1087	0.25
1088	0.28
1089	0.32
1090	0.33
1091	0.34
1092	0.32
1093	0.34
1094	0.31
1095	0.33
1096	0.32
1097	0.29
1098	0.3
1099	0.32
1100	0.29
1101	0.26
1102	0.28
1103	0.26
1104	0.25
1105	0.21
1106	0.2
1107	0.16
1108	0.19
1109	0.21
1110	0.23
1111	0.25
1112	0.26
1113	0.27
1114	0.27
1115	0.28
1116	0.26
1117	0.27
1118	0.28
1119	0.26
1120	0.28
1121	0.27
1122	0.25
1123	0.25
1124	0.26
1125	0.22
1126	0.16
1127	0.13
1128	0.1
1129	0.12
1130	0.12
1131	0.11
1132	0.08
1133	0.09
1134	0.09
1135	0.09
1136	0.1
1137	0.1
1138	0.09
1139	0.1
1140	0.14
1141	0.19
1142	0.2
1143	0.22
1144	0.22
1145	0.24
1146	0.25
1147	0.27
1148	0.28
1149	0.24
1150	0.29
1151	0.33
1152	0.36
1153	0.39
1154	0.41
1155	0.4
1156	0.38
1157	0.4
1158	0.34
1159	0.36
1160	0.34
1161	0.31
1162	0.3
1163	0.32
1164	0.3
1165	0.27
1166	0.26
1167	0.19
1168	0.16
1169	0.13
1170	0.11
1171	0.09
1172	0.07
1173	0.09
1174	0.12
1175	0.13
1176	0.15
1177	0.2
1178	0.28
1179	0.36
1180	0.46
1181	0.52
1182	0.59
1183	0.68
1184	0.72
1185	0.77
1186	0.74
1187	0.69
1188	0.65
1189	0.63
1190	0.6
1191	0.57

Q4WDD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer