Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WDC9

Protein Details
Accession Q4WDC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
827-846TTPPHSHKSSPQPSKRLVNDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR033712  Pumilio_RNA-bd  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003730  F:mRNA 3'-UTR binding  
GO:0000288  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG afm:AFUA_6G04310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
CDD cd07920  Pumilio  
Amino Acid Sequences MSGSSMNSDRSRGPHAGMGKGFGAGKSSWNTNIWGDSNLKSGFDDQNLAETGFEGKSGSGSLLPSSESDGWSSRPNLPWNTVNTTSASLSRGQNNGMTASPISTRPNDRSAPALSDTVDSTSYFSIPRSSGIGSSSGGGNHKTYLNAGADGISPCGDGLSFGNFGGLRSGDGRRHPNSSAFGGSPVGTGFPMKQGFTTLDTTRPDEITGSLTMSSLPQALPDTMSQPLARNGFAHASHNSASITSQRPTHASHPSFHSESQGFEGRFGGSSMDLSAEINTLQLNEGGFSGHPVSRPPYLSHSSYDGSLQRFKYQSAADESSYEAVGGYAGDGLSELPLGHHAGRSRLGEGSLSPTDLARMESTFYSALEAGAVPGSHYRNGSATRLSENQALALERKLRAMQHDQDLAHGAANSLQRIPYNTPAYDLAGYQAARLNALSGFYPVAQLGGLGSAGIIPRGHRDQDPAQVVRSPLLEEFRANSKGNKRYELKDIYNHIVEFSGDQHGSRFIQQKLETANSDEKEQVFREIQPNCLQLMTDVFGNYVVQKLFEHGNQSQKKILANQMKGHVLALSTQMYGCRVVQKALEHILTDQQASMVKELENHVLKCVRDQNGNHVIQKAIERVPSQYVQFIINAFKGQVSRLAAHPYGCRVIQRMLEHCEEVDRESILAELHACTAHLIPDQFGNYVIQHVIENGEEKDRSRMINVVLSQLLMYSKHKFASNVVEKSIEFGEESQRQQIISTLTSANERGESPLLGLMRDQYGNYVIQKVLGQLKGEEREGLIDQIRPLLSQLKKFSYGKQIVAIEKLIFDSTTLGANSLPPASSTTPPHSHKSSPQPSKRLVNDVENSRAPVVGAAPPTPPPTDNQGHTHGPAESKNLAKSTVTSLSVSESASADSNGSVPVSAST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.41
4 0.38
5 0.37
6 0.31
7 0.31
8 0.29
9 0.23
10 0.23
11 0.16
12 0.2
13 0.2
14 0.23
15 0.24
16 0.25
17 0.28
18 0.27
19 0.31
20 0.28
21 0.28
22 0.28
23 0.26
24 0.3
25 0.28
26 0.27
27 0.23
28 0.26
29 0.26
30 0.25
31 0.27
32 0.21
33 0.25
34 0.26
35 0.25
36 0.2
37 0.17
38 0.17
39 0.14
40 0.14
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.16
53 0.17
54 0.16
55 0.18
56 0.19
57 0.2
58 0.24
59 0.27
60 0.28
61 0.32
62 0.38
63 0.4
64 0.43
65 0.47
66 0.47
67 0.51
68 0.48
69 0.44
70 0.39
71 0.37
72 0.34
73 0.3
74 0.26
75 0.23
76 0.25
77 0.29
78 0.28
79 0.28
80 0.28
81 0.28
82 0.28
83 0.24
84 0.22
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.2
90 0.23
91 0.28
92 0.3
93 0.36
94 0.37
95 0.37
96 0.39
97 0.37
98 0.37
99 0.34
100 0.31
101 0.25
102 0.24
103 0.23
104 0.21
105 0.19
106 0.15
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.16
118 0.17
119 0.18
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.12
154 0.1
155 0.12
156 0.16
157 0.18
158 0.25
159 0.32
160 0.33
161 0.37
162 0.38
163 0.4
164 0.4
165 0.39
166 0.36
167 0.29
168 0.28
169 0.24
170 0.22
171 0.18
172 0.14
173 0.12
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.12
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.17
183 0.19
184 0.23
185 0.2
186 0.23
187 0.25
188 0.28
189 0.28
190 0.27
191 0.24
192 0.2
193 0.19
194 0.17
195 0.15
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.17
219 0.19
220 0.19
221 0.21
222 0.17
223 0.19
224 0.19
225 0.2
226 0.18
227 0.15
228 0.15
229 0.16
230 0.19
231 0.17
232 0.19
233 0.19
234 0.22
235 0.25
236 0.3
237 0.35
238 0.33
239 0.35
240 0.38
241 0.42
242 0.42
243 0.39
244 0.38
245 0.29
246 0.28
247 0.29
248 0.3
249 0.24
250 0.22
251 0.22
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.13
256 0.07
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.14
281 0.16
282 0.18
283 0.19
284 0.23
285 0.26
286 0.28
287 0.28
288 0.29
289 0.27
290 0.25
291 0.26
292 0.24
293 0.22
294 0.25
295 0.25
296 0.26
297 0.26
298 0.25
299 0.26
300 0.24
301 0.24
302 0.26
303 0.27
304 0.23
305 0.23
306 0.23
307 0.2
308 0.19
309 0.15
310 0.09
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.06
326 0.06
327 0.08
328 0.09
329 0.11
330 0.14
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.13
336 0.13
337 0.16
338 0.13
339 0.13
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.12
367 0.14
368 0.15
369 0.15
370 0.15
371 0.17
372 0.19
373 0.2
374 0.2
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.16
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.17
387 0.23
388 0.24
389 0.26
390 0.29
391 0.28
392 0.27
393 0.28
394 0.24
395 0.18
396 0.15
397 0.11
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.12
405 0.14
406 0.16
407 0.19
408 0.18
409 0.2
410 0.2
411 0.21
412 0.19
413 0.17
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.1
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.05
427 0.06
428 0.05
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.02
438 0.02
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.06
445 0.08
446 0.1
447 0.1
448 0.14
449 0.16
450 0.23
451 0.27
452 0.25
453 0.24
454 0.25
455 0.24
456 0.21
457 0.19
458 0.13
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.09
463 0.11
464 0.14
465 0.17
466 0.17
467 0.2
468 0.26
469 0.33
470 0.35
471 0.4
472 0.4
473 0.39
474 0.46
475 0.48
476 0.43
477 0.41
478 0.42
479 0.39
480 0.37
481 0.34
482 0.27
483 0.2
484 0.18
485 0.13
486 0.1
487 0.1
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.1
492 0.11
493 0.14
494 0.18
495 0.16
496 0.22
497 0.22
498 0.25
499 0.26
500 0.28
501 0.24
502 0.22
503 0.26
504 0.21
505 0.22
506 0.21
507 0.19
508 0.19
509 0.19
510 0.18
511 0.15
512 0.16
513 0.21
514 0.21
515 0.23
516 0.25
517 0.25
518 0.23
519 0.21
520 0.19
521 0.13
522 0.13
523 0.11
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.08
535 0.1
536 0.1
537 0.15
538 0.16
539 0.26
540 0.28
541 0.3
542 0.31
543 0.31
544 0.31
545 0.3
546 0.35
547 0.34
548 0.35
549 0.37
550 0.38
551 0.37
552 0.36
553 0.33
554 0.25
555 0.17
556 0.14
557 0.12
558 0.1
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.1
565 0.12
566 0.12
567 0.13
568 0.15
569 0.16
570 0.18
571 0.2
572 0.2
573 0.16
574 0.16
575 0.18
576 0.16
577 0.15
578 0.12
579 0.1
580 0.12
581 0.12
582 0.13
583 0.11
584 0.1
585 0.11
586 0.13
587 0.19
588 0.2
589 0.19
590 0.21
591 0.24
592 0.23
593 0.26
594 0.31
595 0.28
596 0.3
597 0.31
598 0.37
599 0.43
600 0.46
601 0.43
602 0.38
603 0.35
604 0.31
605 0.32
606 0.26
607 0.19
608 0.19
609 0.18
610 0.19
611 0.22
612 0.22
613 0.21
614 0.19
615 0.18
616 0.17
617 0.17
618 0.16
619 0.14
620 0.13
621 0.12
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.1
626 0.13
627 0.14
628 0.15
629 0.16
630 0.21
631 0.21
632 0.22
633 0.23
634 0.22
635 0.22
636 0.21
637 0.2
638 0.18
639 0.2
640 0.23
641 0.26
642 0.27
643 0.3
644 0.31
645 0.3
646 0.27
647 0.26
648 0.22
649 0.2
650 0.17
651 0.12
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.08
656 0.08
657 0.07
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.07
663 0.07
664 0.08
665 0.1
666 0.1
667 0.1
668 0.12
669 0.13
670 0.12
671 0.13
672 0.12
673 0.1
674 0.11
675 0.11
676 0.09
677 0.08
678 0.09
679 0.09
680 0.08
681 0.1
682 0.1
683 0.13
684 0.13
685 0.14
686 0.18
687 0.19
688 0.19
689 0.19
690 0.21
691 0.19
692 0.24
693 0.24
694 0.23
695 0.21
696 0.2
697 0.18
698 0.16
699 0.15
700 0.11
701 0.13
702 0.14
703 0.16
704 0.19
705 0.21
706 0.21
707 0.23
708 0.32
709 0.39
710 0.37
711 0.37
712 0.36
713 0.34
714 0.36
715 0.33
716 0.23
717 0.14
718 0.13
719 0.19
720 0.21
721 0.23
722 0.24
723 0.24
724 0.24
725 0.23
726 0.25
727 0.21
728 0.17
729 0.18
730 0.16
731 0.16
732 0.18
733 0.18
734 0.16
735 0.15
736 0.15
737 0.15
738 0.15
739 0.14
740 0.13
741 0.15
742 0.15
743 0.14
744 0.13
745 0.12
746 0.14
747 0.14
748 0.13
749 0.12
750 0.13
751 0.15
752 0.17
753 0.17
754 0.15
755 0.16
756 0.16
757 0.18
758 0.22
759 0.22
760 0.21
761 0.21
762 0.27
763 0.29
764 0.29
765 0.26
766 0.21
767 0.21
768 0.21
769 0.22
770 0.18
771 0.17
772 0.16
773 0.19
774 0.19
775 0.16
776 0.17
777 0.23
778 0.25
779 0.29
780 0.35
781 0.36
782 0.42
783 0.44
784 0.48
785 0.51
786 0.52
787 0.47
788 0.48
789 0.47
790 0.43
791 0.44
792 0.4
793 0.3
794 0.25
795 0.24
796 0.19
797 0.14
798 0.12
799 0.11
800 0.1
801 0.13
802 0.12
803 0.11
804 0.11
805 0.12
806 0.13
807 0.12
808 0.12
809 0.09
810 0.14
811 0.17
812 0.21
813 0.25
814 0.31
815 0.38
816 0.42
817 0.48
818 0.49
819 0.5
820 0.55
821 0.61
822 0.64
823 0.67
824 0.72
825 0.74
826 0.76
827 0.8
828 0.76
829 0.74
830 0.68
831 0.65
832 0.64
833 0.62
834 0.62
835 0.54
836 0.52
837 0.43
838 0.39
839 0.3
840 0.23
841 0.19
842 0.17
843 0.17
844 0.16
845 0.17
846 0.2
847 0.23
848 0.24
849 0.22
850 0.22
851 0.27
852 0.32
853 0.35
854 0.38
855 0.41
856 0.43
857 0.44
858 0.43
859 0.37
860 0.34
861 0.32
862 0.32
863 0.31
864 0.31
865 0.33
866 0.32
867 0.32
868 0.29
869 0.29
870 0.3
871 0.31
872 0.29
873 0.26
874 0.25
875 0.27
876 0.28
877 0.26
878 0.21
879 0.16
880 0.15
881 0.16
882 0.16
883 0.12
884 0.11
885 0.12
886 0.11
887 0.1
888 0.09