Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WD75

Protein Details
Accession Q4WD75    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-62VSPKTGKSTPGRKRKLPIEHPEKLSKSHydrophilic
447-468TNVPVASKRRTGRKIRAETDGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-69GKSTPGRKRKLPIEHPEKLSKSSKTSKPK
455-456RR
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG afm:AFUA_6G03760  -  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MTRRVTRSAAAREAALFAAKAQDVKPQLTDSNGPDVSPKTGKSTPGRKRKLPIEHPEKLSKSSKTSKPKGSLPSLNVNDDLPHNLGSVSQPHESINVEPKLNKQDPGIEEEEDLDNLASDLQKTVDKATEGLPQQIKISKKKNPYGLTPGATPFPEWARPTPEECEEVNRLLSSAHGEVIPPSKIPEPSLTVTGCGEVPSVLDALIRTLLSGATTGRNSALAFGGLVQRFGILEEGIGKGSVNWDAVRQAPLKDVFEAIKRGGLAEIKSRKIKAILDMVYQENQERKEFLVKGESDGSSDLMPGEKEYEIACADQNFLSLNHLHTLSTEDAMTELVKYPGIGPKTAACVILFCLQRPCFAVDTHIFRICKWLGWVPPGKATEVTAFSHLEVRIPDYLKYSLHQLLIRHGKTCPRCRAITGQSSAGWEDGCVIDHLVTRTGKKKEGNTNVPVASKRRTGRKIRAETDGSDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.25
3 0.18
4 0.12
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.14
9 0.2
10 0.23
11 0.25
12 0.27
13 0.26
14 0.27
15 0.3
16 0.34
17 0.3
18 0.35
19 0.33
20 0.31
21 0.31
22 0.31
23 0.33
24 0.31
25 0.29
26 0.28
27 0.31
28 0.38
29 0.45
30 0.54
31 0.58
32 0.66
33 0.73
34 0.73
35 0.78
36 0.8
37 0.82
38 0.81
39 0.82
40 0.81
41 0.81
42 0.8
43 0.81
44 0.74
45 0.69
46 0.65
47 0.58
48 0.56
49 0.58
50 0.61
51 0.63
52 0.69
53 0.72
54 0.72
55 0.75
56 0.75
57 0.74
58 0.73
59 0.67
60 0.68
61 0.63
62 0.58
63 0.51
64 0.44
65 0.36
66 0.3
67 0.28
68 0.19
69 0.16
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.19
80 0.2
81 0.21
82 0.25
83 0.25
84 0.25
85 0.26
86 0.3
87 0.38
88 0.39
89 0.37
90 0.31
91 0.34
92 0.34
93 0.39
94 0.37
95 0.28
96 0.26
97 0.27
98 0.26
99 0.19
100 0.17
101 0.11
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.2
117 0.2
118 0.26
119 0.25
120 0.24
121 0.26
122 0.29
123 0.32
124 0.34
125 0.41
126 0.42
127 0.5
128 0.56
129 0.62
130 0.61
131 0.62
132 0.62
133 0.6
134 0.55
135 0.47
136 0.42
137 0.35
138 0.32
139 0.26
140 0.19
141 0.16
142 0.18
143 0.18
144 0.2
145 0.24
146 0.26
147 0.28
148 0.3
149 0.29
150 0.28
151 0.27
152 0.29
153 0.25
154 0.24
155 0.22
156 0.18
157 0.16
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.12
167 0.12
168 0.09
169 0.11
170 0.13
171 0.13
172 0.15
173 0.16
174 0.17
175 0.18
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.14
182 0.1
183 0.09
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.03
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.14
244 0.16
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.11
252 0.17
253 0.21
254 0.24
255 0.27
256 0.27
257 0.27
258 0.28
259 0.28
260 0.24
261 0.27
262 0.25
263 0.24
264 0.25
265 0.26
266 0.24
267 0.23
268 0.21
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.14
274 0.19
275 0.2
276 0.19
277 0.23
278 0.22
279 0.23
280 0.25
281 0.24
282 0.19
283 0.18
284 0.18
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.14
313 0.13
314 0.13
315 0.11
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.09
326 0.13
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.15
331 0.2
332 0.21
333 0.2
334 0.15
335 0.14
336 0.17
337 0.22
338 0.2
339 0.17
340 0.23
341 0.23
342 0.24
343 0.26
344 0.26
345 0.21
346 0.21
347 0.26
348 0.23
349 0.3
350 0.33
351 0.36
352 0.33
353 0.31
354 0.38
355 0.33
356 0.3
357 0.27
358 0.28
359 0.25
360 0.33
361 0.39
362 0.34
363 0.4
364 0.39
365 0.37
366 0.33
367 0.31
368 0.28
369 0.24
370 0.24
371 0.2
372 0.2
373 0.19
374 0.23
375 0.21
376 0.19
377 0.17
378 0.19
379 0.21
380 0.22
381 0.22
382 0.21
383 0.23
384 0.22
385 0.23
386 0.25
387 0.24
388 0.26
389 0.28
390 0.25
391 0.33
392 0.42
393 0.42
394 0.38
395 0.37
396 0.43
397 0.49
398 0.58
399 0.59
400 0.55
401 0.56
402 0.59
403 0.65
404 0.65
405 0.65
406 0.59
407 0.52
408 0.47
409 0.47
410 0.43
411 0.35
412 0.26
413 0.16
414 0.14
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.13
421 0.15
422 0.18
423 0.2
424 0.24
425 0.32
426 0.36
427 0.41
428 0.45
429 0.52
430 0.58
431 0.66
432 0.7
433 0.67
434 0.7
435 0.66
436 0.64
437 0.6
438 0.54
439 0.49
440 0.49
441 0.5
442 0.54
443 0.6
444 0.66
445 0.72
446 0.78
447 0.83
448 0.8
449 0.81
450 0.75