Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WHD7

Protein Details
Accession Q4WHD7    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-54KYSEKDAKPTKIKLKKAAKSAKAKKAAAHydrophilic
126-152RGCIRAKQEKARRKKEARDAANRAKEKBasic
199-226EGEEDKEPKKKKKKEEPKPKAPKPKGPVBasic
325-345THPLISTKKKYKYVRIKEMLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-56AKPTKIKLKKAAKSAKAKKAAAGH
131-152AKQEKARRKKEARDAANRAKEK
173-224AQKGAKKSAVKGMAEDGTKKGKKRKTEGEEDKEPKKKKKKEEPKPKAPKPKG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:1904802  P:RITS complex assembly  
GO:0031048  P:small ncRNA-mediated heterochromatin formation  
KEGG afm:AFUA_2G05770  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MGTNGDSGRASSVASNSGSLVDASGYKYSEKDAKPTKIKLKKAAKSAKAKKAAAGHRGEMEGANVITGNVEVPESPGSSPILPEIDEKTMAAFPTGKPREEDNLETVICKTCKRPVLKQNAVEHIRGCIRAKQEKARRKKEARDAANRAKEKDKDGDDDAAGGDKDGDDSIKAQKGAKKSAVKGMAEDGTKKGKKRKTEGEEDKEPKKKKKKEEPKPKAPKPKGPVDVEKQCGVILPNGAQCARSLTCKSHSMGAKRAVPGRSLPYDMLLQAYQKKNQARQQKAAIDANAPLQDDLDNNGPVDSDEEKDAVMAAILRSRPQPLVTHPLISTKKKYKYVRIKEMLSHALGGARGGGLFSTGDATPTNDGNPFQPMDDLPLASPVSVTGSDNAPDTAKKTPAPAPKKLPVAVSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.15
4 0.16
5 0.16
6 0.13
7 0.12
8 0.09
9 0.1
10 0.11
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.18
16 0.26
17 0.26
18 0.33
19 0.41
20 0.49
21 0.57
22 0.65
23 0.72
24 0.72
25 0.79
26 0.8
27 0.81
28 0.79
29 0.81
30 0.83
31 0.81
32 0.83
33 0.86
34 0.85
35 0.84
36 0.78
37 0.72
38 0.71
39 0.69
40 0.67
41 0.61
42 0.54
43 0.47
44 0.47
45 0.42
46 0.33
47 0.26
48 0.2
49 0.14
50 0.12
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.04
57 0.05
58 0.05
59 0.07
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.15
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.13
80 0.12
81 0.23
82 0.26
83 0.25
84 0.26
85 0.29
86 0.34
87 0.37
88 0.39
89 0.31
90 0.32
91 0.31
92 0.29
93 0.27
94 0.26
95 0.23
96 0.21
97 0.21
98 0.23
99 0.31
100 0.36
101 0.44
102 0.49
103 0.59
104 0.65
105 0.7
106 0.7
107 0.72
108 0.7
109 0.61
110 0.52
111 0.44
112 0.38
113 0.33
114 0.28
115 0.23
116 0.27
117 0.33
118 0.37
119 0.44
120 0.52
121 0.59
122 0.68
123 0.74
124 0.78
125 0.79
126 0.83
127 0.83
128 0.84
129 0.83
130 0.82
131 0.82
132 0.81
133 0.81
134 0.74
135 0.67
136 0.63
137 0.56
138 0.5
139 0.47
140 0.4
141 0.35
142 0.36
143 0.35
144 0.29
145 0.27
146 0.23
147 0.17
148 0.14
149 0.1
150 0.07
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.06
157 0.09
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.18
162 0.22
163 0.27
164 0.32
165 0.34
166 0.34
167 0.4
168 0.42
169 0.39
170 0.35
171 0.33
172 0.29
173 0.24
174 0.24
175 0.19
176 0.22
177 0.25
178 0.27
179 0.33
180 0.34
181 0.41
182 0.48
183 0.56
184 0.55
185 0.63
186 0.7
187 0.69
188 0.74
189 0.72
190 0.71
191 0.68
192 0.66
193 0.64
194 0.65
195 0.65
196 0.66
197 0.73
198 0.77
199 0.81
200 0.88
201 0.89
202 0.9
203 0.93
204 0.92
205 0.91
206 0.86
207 0.83
208 0.77
209 0.76
210 0.72
211 0.66
212 0.63
213 0.6
214 0.6
215 0.54
216 0.49
217 0.4
218 0.33
219 0.29
220 0.23
221 0.17
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.17
234 0.21
235 0.24
236 0.25
237 0.27
238 0.31
239 0.31
240 0.36
241 0.39
242 0.39
243 0.39
244 0.43
245 0.38
246 0.35
247 0.33
248 0.32
249 0.28
250 0.26
251 0.23
252 0.2
253 0.2
254 0.18
255 0.18
256 0.13
257 0.13
258 0.18
259 0.21
260 0.23
261 0.28
262 0.32
263 0.38
264 0.44
265 0.53
266 0.53
267 0.56
268 0.61
269 0.59
270 0.6
271 0.56
272 0.51
273 0.41
274 0.35
275 0.32
276 0.25
277 0.21
278 0.15
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.13
290 0.12
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.08
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.09
302 0.09
303 0.11
304 0.12
305 0.15
306 0.16
307 0.17
308 0.2
309 0.21
310 0.3
311 0.3
312 0.32
313 0.3
314 0.37
315 0.41
316 0.44
317 0.47
318 0.48
319 0.54
320 0.6
321 0.67
322 0.69
323 0.74
324 0.8
325 0.82
326 0.8
327 0.77
328 0.72
329 0.72
330 0.66
331 0.55
332 0.45
333 0.34
334 0.28
335 0.24
336 0.19
337 0.13
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.09
349 0.11
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.16
356 0.19
357 0.18
358 0.17
359 0.18
360 0.17
361 0.21
362 0.22
363 0.21
364 0.17
365 0.2
366 0.19
367 0.17
368 0.17
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.14
375 0.15
376 0.16
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.17
381 0.21
382 0.23
383 0.23
384 0.27
385 0.34
386 0.43
387 0.49
388 0.56
389 0.59
390 0.63
391 0.69
392 0.67