Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WHA7

Protein Details
Accession Q4WHA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-139YKEVDEKMDKRRKARREARERQEREEYEBasic
903-926SCRTTNATPRTGKKSRRCGQVRLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-134KRRKARREARERQE
Subcellular Location(s) nucl 8.5, mito_nucl 8.333, mito 7, cyto_mito 6.833, pero 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000244  P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly  
KEGG afm:AFUA_2G06070  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13428  TPR_14  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MASGRKDFLNQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQAALAKRAQLLGAAPPTAYGAGREKGGREEKEEEEEDERFQDPDNEVGLFAYGQFDQEDDEADRIYKEVDEKMDKRRKARREARERQEREEYERKNPKIQQQFADLKRSLASVSEEQWANLPEVGDLTGKNRRAKQNLRQRFYAVPDSVIASARDSTQFETTIADDGTQTDVRGGAADGTMTNFADISAARDKVLKVRLDQAARGSTADSSSGSATNIDPKGYLTSLTQSELKAGEVEIGDIKRVRVLLESVTKTNPKHAPGWIALARLEELAGRIVAARNIIAKGCELCPKSEDAWLENIRLNEGHNAKVIAANAIKNNDRSTRLWIEAMRLESDTRAKKNVLRQAILHVPQSVTIWKEAVNLEEDPADARLLLAKAVEMIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSHEVWIAAARLQEQMGTFDKVNVMKRAVQALARENAMLKREEWIAEAEKCEEEGAILTCGAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMDDAKGSIARGKYETAKAIYAYALRVFVNRRSIWLAAADLERNHGSKEALWQVLEKAVEACPQSEELWLQLAKEKWQAGEIDDARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADADQTDQARELLATARREAGTDRVWIKSVAFERQLGNIDEALDLVNQGLQLYPKADKLWMMKGQIYEYQNKYPQAREAYSTGTRACPKSVPLWLLASRLEEKSGAVVKARSVLDRARLAVPKSAELWTESVRVERRANNIGQAKVLMAKALQEVPTSGLLWSESIWHLEPRAQRKARSLEAIKKLENDPILFITVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVSDSDHGDGWAWYYKFLLQHGTEVRSSSSVSDLLQSCRTTNATPRTGKKSRRCGQVRLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.31
4 0.26
5 0.24
6 0.2
7 0.16
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.07
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.2
20 0.23
21 0.25
22 0.29
23 0.3
24 0.29
25 0.32
26 0.34
27 0.32
28 0.38
29 0.37
30 0.32
31 0.31
32 0.28
33 0.26
34 0.3
35 0.3
36 0.26
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.24
42 0.19
43 0.17
44 0.18
45 0.2
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.17
51 0.16
52 0.13
53 0.15
54 0.16
55 0.19
56 0.21
57 0.21
58 0.29
59 0.37
60 0.36
61 0.37
62 0.41
63 0.41
64 0.46
65 0.47
66 0.42
67 0.37
68 0.36
69 0.31
70 0.28
71 0.26
72 0.2
73 0.19
74 0.2
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.18
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.2
103 0.28
104 0.32
105 0.43
106 0.51
107 0.55
108 0.62
109 0.68
110 0.71
111 0.74
112 0.8
113 0.8
114 0.82
115 0.88
116 0.9
117 0.92
118 0.87
119 0.83
120 0.83
121 0.75
122 0.72
123 0.71
124 0.64
125 0.64
126 0.69
127 0.66
128 0.64
129 0.67
130 0.68
131 0.69
132 0.71
133 0.64
134 0.63
135 0.69
136 0.64
137 0.67
138 0.57
139 0.48
140 0.42
141 0.39
142 0.3
143 0.22
144 0.23
145 0.17
146 0.19
147 0.23
148 0.23
149 0.22
150 0.24
151 0.23
152 0.2
153 0.18
154 0.16
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.13
161 0.19
162 0.24
163 0.3
164 0.37
165 0.44
166 0.53
167 0.62
168 0.68
169 0.73
170 0.78
171 0.77
172 0.73
173 0.68
174 0.63
175 0.59
176 0.57
177 0.46
178 0.37
179 0.32
180 0.31
181 0.28
182 0.25
183 0.2
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.1
199 0.1
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.09
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.15
225 0.16
226 0.21
227 0.27
228 0.26
229 0.24
230 0.3
231 0.36
232 0.36
233 0.37
234 0.36
235 0.32
236 0.3
237 0.29
238 0.22
239 0.17
240 0.15
241 0.14
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.16
250 0.16
251 0.15
252 0.14
253 0.14
254 0.16
255 0.16
256 0.16
257 0.1
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.14
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.09
280 0.11
281 0.13
282 0.2
283 0.22
284 0.23
285 0.26
286 0.29
287 0.28
288 0.34
289 0.34
290 0.29
291 0.3
292 0.3
293 0.32
294 0.29
295 0.35
296 0.29
297 0.26
298 0.24
299 0.22
300 0.2
301 0.15
302 0.14
303 0.08
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.17
321 0.16
322 0.17
323 0.18
324 0.2
325 0.21
326 0.22
327 0.22
328 0.17
329 0.23
330 0.23
331 0.24
332 0.23
333 0.22
334 0.19
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.15
341 0.16
342 0.15
343 0.17
344 0.16
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.16
350 0.17
351 0.17
352 0.19
353 0.19
354 0.22
355 0.22
356 0.27
357 0.28
358 0.28
359 0.28
360 0.27
361 0.27
362 0.26
363 0.25
364 0.19
365 0.16
366 0.15
367 0.14
368 0.2
369 0.21
370 0.2
371 0.21
372 0.22
373 0.25
374 0.32
375 0.38
376 0.37
377 0.34
378 0.33
379 0.35
380 0.4
381 0.38
382 0.31
383 0.25
384 0.2
385 0.19
386 0.19
387 0.16
388 0.11
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.07
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.13
437 0.19
438 0.22
439 0.18
440 0.19
441 0.21
442 0.21
443 0.22
444 0.21
445 0.17
446 0.16
447 0.18
448 0.18
449 0.17
450 0.16
451 0.16
452 0.15
453 0.14
454 0.12
455 0.09
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.07
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.1
465 0.1
466 0.13
467 0.15
468 0.17
469 0.16
470 0.16
471 0.17
472 0.18
473 0.19
474 0.18
475 0.17
476 0.17
477 0.19
478 0.19
479 0.16
480 0.16
481 0.15
482 0.15
483 0.15
484 0.14
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.14
492 0.14
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.12
497 0.11
498 0.09
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.03
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.09
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.14
532 0.14
533 0.14
534 0.14
535 0.15
536 0.11
537 0.11
538 0.11
539 0.13
540 0.16
541 0.17
542 0.19
543 0.18
544 0.18
545 0.17
546 0.16
547 0.15
548 0.13
549 0.12
550 0.1
551 0.1
552 0.09
553 0.11
554 0.12
555 0.15
556 0.21
557 0.2
558 0.21
559 0.23
560 0.23
561 0.22
562 0.2
563 0.17
564 0.13
565 0.14
566 0.13
567 0.1
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.11
573 0.1
574 0.1
575 0.15
576 0.17
577 0.17
578 0.17
579 0.18
580 0.17
581 0.19
582 0.18
583 0.13
584 0.1
585 0.1
586 0.12
587 0.12
588 0.12
589 0.1
590 0.11
591 0.12
592 0.12
593 0.11
594 0.09
595 0.12
596 0.11
597 0.11
598 0.13
599 0.14
600 0.15
601 0.19
602 0.19
603 0.16
604 0.18
605 0.18
606 0.16
607 0.23
608 0.23
609 0.23
610 0.23
611 0.23
612 0.21
613 0.21
614 0.2
615 0.13
616 0.15
617 0.16
618 0.23
619 0.28
620 0.36
621 0.4
622 0.42
623 0.43
624 0.43
625 0.4
626 0.31
627 0.26
628 0.18
629 0.16
630 0.13
631 0.11
632 0.08
633 0.07
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.04
638 0.05
639 0.06
640 0.07
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.1
645 0.1
646 0.09
647 0.08
648 0.08
649 0.11
650 0.15
651 0.16
652 0.17
653 0.19
654 0.19
655 0.2
656 0.21
657 0.2
658 0.18
659 0.22
660 0.23
661 0.22
662 0.23
663 0.22
664 0.21
665 0.23
666 0.23
667 0.23
668 0.23
669 0.23
670 0.23
671 0.26
672 0.29
673 0.24
674 0.23
675 0.18
676 0.17
677 0.15
678 0.14
679 0.11
680 0.08
681 0.07
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.06
688 0.07
689 0.09
690 0.1
691 0.11
692 0.12
693 0.13
694 0.16
695 0.19
696 0.26
697 0.28
698 0.3
699 0.31
700 0.31
701 0.33
702 0.35
703 0.35
704 0.35
705 0.34
706 0.38
707 0.4
708 0.43
709 0.43
710 0.39
711 0.42
712 0.41
713 0.39
714 0.36
715 0.33
716 0.35
717 0.35
718 0.35
719 0.3
720 0.29
721 0.32
722 0.3
723 0.31
724 0.26
725 0.27
726 0.29
727 0.33
728 0.3
729 0.27
730 0.3
731 0.29
732 0.29
733 0.28
734 0.27
735 0.25
736 0.23
737 0.22
738 0.17
739 0.16
740 0.19
741 0.22
742 0.19
743 0.18
744 0.18
745 0.18
746 0.24
747 0.25
748 0.22
749 0.21
750 0.23
751 0.27
752 0.29
753 0.31
754 0.3
755 0.33
756 0.34
757 0.36
758 0.34
759 0.3
760 0.3
761 0.28
762 0.24
763 0.22
764 0.23
765 0.2
766 0.21
767 0.19
768 0.23
769 0.24
770 0.28
771 0.31
772 0.33
773 0.36
774 0.4
775 0.41
776 0.44
777 0.47
778 0.43
779 0.4
780 0.35
781 0.3
782 0.27
783 0.26
784 0.18
785 0.12
786 0.12
787 0.14
788 0.16
789 0.16
790 0.13
791 0.14
792 0.16
793 0.17
794 0.16
795 0.13
796 0.11
797 0.11
798 0.11
799 0.1
800 0.11
801 0.1
802 0.12
803 0.14
804 0.15
805 0.15
806 0.2
807 0.27
808 0.32
809 0.42
810 0.44
811 0.46
812 0.54
813 0.6
814 0.61
815 0.63
816 0.63
817 0.62
818 0.67
819 0.69
820 0.63
821 0.59
822 0.55
823 0.51
824 0.47
825 0.38
826 0.31
827 0.27
828 0.27
829 0.22
830 0.21
831 0.19
832 0.17
833 0.16
834 0.14
835 0.13
836 0.12
837 0.16
838 0.23
839 0.23
840 0.25
841 0.31
842 0.34
843 0.34
844 0.35
845 0.39
846 0.42
847 0.42
848 0.43
849 0.38
850 0.35
851 0.36
852 0.35
853 0.31
854 0.23
855 0.22
856 0.22
857 0.23
858 0.24
859 0.22
860 0.21
861 0.19
862 0.17
863 0.16
864 0.2
865 0.18
866 0.16
867 0.17
868 0.2
869 0.21
870 0.23
871 0.27
872 0.21
873 0.29
874 0.33
875 0.36
876 0.34
877 0.34
878 0.34
879 0.28
880 0.28
881 0.21
882 0.19
883 0.16
884 0.16
885 0.21
886 0.22
887 0.24
888 0.29
889 0.29
890 0.27
891 0.29
892 0.32
893 0.29
894 0.35
895 0.4
896 0.44
897 0.51
898 0.58
899 0.64
900 0.7
901 0.77
902 0.79
903 0.81
904 0.81
905 0.84
906 0.83