Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9XD20

Protein Details
Accession A0A0C9XD20    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-66VKRPEKKPTVWARQNKGVNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-52KRPEK
295-317RAMEKRKRELEERRKLIEAKRRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025066  CCDC174-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF13300  DUF4078  
Amino Acid Sequences MSHASKAKAKGVSASSFFDLKAELSKKEAEFAKSKAAGKSLAIVGGVKRPEKKPTVWARQNKGVNSRASRDVELEAISKPTLESARAALERKAKIYDKLKRGKTGGLTDRQYDALLVDFDTMPNASYESGSEDEDESLTVPRPPNDEHDPIIEYEDEFGRVRTARRSEVPRNLVPAREEEVDQDEDIIIRNPVNHFPVYEPSAERVTEIEKAFAEENNPLGVHFDASKEIRAKGAGFYQFSADEETRKAQMEELKASREETERARQGTGALDLKPGEVEGMDEVDVPGSTGTKSRAMEKRKRELEERRKLIEAKRRKVDMPAANMMDSSTEPAVPGPSTTSASVPVPNDPFATLEVQSSSKAKDSGKAKTTAFPDAYAAPVLEADAFLSQLEEVFLVSMKKNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.37
3 0.35
4 0.34
5 0.27
6 0.23
7 0.18
8 0.23
9 0.22
10 0.21
11 0.23
12 0.29
13 0.29
14 0.34
15 0.38
16 0.35
17 0.36
18 0.38
19 0.44
20 0.44
21 0.47
22 0.44
23 0.42
24 0.38
25 0.34
26 0.36
27 0.28
28 0.23
29 0.2
30 0.18
31 0.17
32 0.21
33 0.24
34 0.24
35 0.29
36 0.31
37 0.39
38 0.43
39 0.45
40 0.49
41 0.56
42 0.63
43 0.67
44 0.74
45 0.74
46 0.78
47 0.8
48 0.76
49 0.73
50 0.67
51 0.65
52 0.61
53 0.58
54 0.56
55 0.53
56 0.49
57 0.43
58 0.38
59 0.31
60 0.28
61 0.24
62 0.18
63 0.16
64 0.15
65 0.13
66 0.11
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.18
73 0.21
74 0.23
75 0.24
76 0.3
77 0.31
78 0.32
79 0.36
80 0.33
81 0.38
82 0.46
83 0.51
84 0.53
85 0.61
86 0.64
87 0.65
88 0.65
89 0.62
90 0.58
91 0.58
92 0.55
93 0.54
94 0.51
95 0.47
96 0.46
97 0.42
98 0.36
99 0.27
100 0.19
101 0.13
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.15
130 0.17
131 0.22
132 0.27
133 0.29
134 0.27
135 0.28
136 0.28
137 0.25
138 0.25
139 0.2
140 0.13
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.11
148 0.12
149 0.17
150 0.2
151 0.21
152 0.27
153 0.35
154 0.41
155 0.48
156 0.53
157 0.48
158 0.51
159 0.48
160 0.44
161 0.37
162 0.32
163 0.27
164 0.22
165 0.21
166 0.16
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.18
229 0.14
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.18
238 0.2
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.25
243 0.25
244 0.25
245 0.22
246 0.22
247 0.21
248 0.27
249 0.29
250 0.3
251 0.3
252 0.28
253 0.27
254 0.26
255 0.25
256 0.2
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.12
263 0.08
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.09
279 0.14
280 0.15
281 0.23
282 0.3
283 0.39
284 0.48
285 0.55
286 0.64
287 0.67
288 0.71
289 0.72
290 0.75
291 0.77
292 0.79
293 0.76
294 0.7
295 0.66
296 0.66
297 0.65
298 0.63
299 0.63
300 0.61
301 0.63
302 0.63
303 0.6
304 0.62
305 0.63
306 0.6
307 0.56
308 0.54
309 0.47
310 0.44
311 0.42
312 0.36
313 0.28
314 0.21
315 0.17
316 0.11
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.1
324 0.12
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.17
330 0.21
331 0.19
332 0.23
333 0.23
334 0.23
335 0.23
336 0.21
337 0.21
338 0.19
339 0.21
340 0.16
341 0.15
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.18
346 0.18
347 0.18
348 0.22
349 0.22
350 0.27
351 0.32
352 0.39
353 0.43
354 0.47
355 0.46
356 0.48
357 0.5
358 0.51
359 0.47
360 0.38
361 0.35
362 0.3
363 0.3
364 0.24
365 0.21
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.09
370 0.08
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.09