FuNGI

A0A0U1LZX2

Protein Details

Accession

A0A0U1LZX2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-53	RPKAADPLVRPKKRPPPGRNNIRPSGGA	Hydrophilic
525-544	GTDTSRKKPKHTSAQAGRVS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-61	KIRRPKAADPLVRPKKRPPPGRNNIRPSGGANGTRPPPP
411-434	RERREKEARKVLGKKVRKALQKRE
476-481	AKDKEK
497-515	GRPKHTDALKKAAIGRKRG

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPTDPNFARTATGAGAPPVMKIRRPKAADPLVRPKKRPPPGRNNIRPSGGANGTRPPPPPGAAQPKLNAIPEPPLSRLQRSKVRDDVTVNGFSGPPLSNTVTDYPLVTTKRALREGLKFHVAKFLSKKSMDPRDEAQFTRPVRLQRRDPRFRPPEPDLTKSEDTKMLDAGNSPGEAEREEFEARKAAREKEREENLAQIAPSANNPQKRTNPLKPKTQQVMKADMTAEEIAKARVKYEEALPWHLEDFDNKNTWVGNYEAALSETYAMFVLEPTGNMRMVPIDKWYRFNAKNAFKSLTIEEAEKFMSKKIKDPRWFMEKQQEAVEKKELEQFAKQRKVYRGKAVVGAGLDGDDMDFEEDRFADDEEVDTGLFEEDEDTKASEKRIKQDQLKANIFDLKEEKDYDEEESRERREKEARKVLGKKVRKALQKREKNFDYSSGSDVNPYSDEESSEEDSETERQKEADKKAEEEKAAKDKEKESGASNKGTGTNTPSGRPKHTDALKKAAIGRKRGGSPNLSDASGTDTSRKKPKHTSAQAGRVSPSPSSVLAATKKRSRVGGAVSGSDIEGGALSGGDMSDTSKAKKLKLNLSLGGSRSGTPLSSRPGSPAPPRAGTPDGVKGPARGSTPRPVAGAAAGQPSFPTPAEIHAAIPASGILSRDLLKIFHPRIGESKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGVLKDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.17
3	0.16
4	0.19
5	0.18
6	0.18
7	0.24
8	0.25
9	0.27
10	0.36
11	0.42
12	0.48
13	0.54
14	0.57
15	0.6
16	0.68
17	0.71
18	0.71
19	0.76
20	0.77
21	0.78
22	0.78
23	0.77
24	0.77
25	0.79
26	0.81
27	0.8
28	0.81
29	0.85
30	0.92
31	0.93
32	0.91
33	0.87
34	0.8
35	0.71
36	0.62
37	0.59
38	0.53
39	0.47
40	0.4
41	0.4
42	0.39
43	0.41
44	0.41
45	0.38
46	0.35
47	0.33
48	0.36
49	0.39
50	0.46
51	0.47
52	0.5
53	0.48
54	0.51
55	0.52
56	0.48
57	0.4
58	0.31
59	0.32
60	0.32
61	0.33
62	0.3
63	0.34
64	0.37
65	0.43
66	0.48
67	0.5
68	0.54
69	0.56
70	0.61
71	0.61
72	0.61
73	0.58
74	0.55
75	0.54
76	0.5
77	0.47
78	0.4
79	0.32
80	0.29
81	0.24
82	0.23
83	0.17
84	0.13
85	0.15
86	0.16
87	0.16
88	0.19
89	0.21
90	0.21
91	0.2
92	0.2
93	0.17
94	0.21
95	0.22
96	0.2
97	0.22
98	0.27
99	0.33
100	0.35
101	0.36
102	0.36
103	0.42
104	0.47
105	0.48
106	0.5
107	0.44
108	0.42
109	0.47
110	0.42
111	0.4
112	0.4
113	0.42
114	0.41
115	0.41
116	0.46
117	0.47
118	0.57
119	0.54
120	0.52
121	0.5
122	0.51
123	0.54
124	0.5
125	0.45
126	0.42
127	0.4
128	0.41
129	0.4
130	0.41
131	0.46
132	0.52
133	0.59
134	0.62
135	0.72
136	0.77
137	0.77
138	0.79
139	0.79
140	0.76
141	0.74
142	0.7
143	0.7
144	0.65
145	0.66
146	0.59
147	0.58
148	0.56
149	0.5
150	0.46
151	0.4
152	0.35
153	0.31
154	0.29
155	0.22
156	0.18
157	0.18
158	0.17
159	0.13
160	0.12
161	0.11
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.11
166	0.1
167	0.12
168	0.14
169	0.14
170	0.14
171	0.2
172	0.19
173	0.25
174	0.28
175	0.31
176	0.38
177	0.44
178	0.48
179	0.52
180	0.57
181	0.54
182	0.51
183	0.48
184	0.41
185	0.36
186	0.31
187	0.23
188	0.18
189	0.14
190	0.15
191	0.18
192	0.21
193	0.25
194	0.28
195	0.34
196	0.38
197	0.46
198	0.54
199	0.57
200	0.64
201	0.64
202	0.72
203	0.7
204	0.73
205	0.73
206	0.71
207	0.68
208	0.61
209	0.64
210	0.54
211	0.52
212	0.43
213	0.34
214	0.3
215	0.23
216	0.19
217	0.12
218	0.12
219	0.11
220	0.14
221	0.14
222	0.12
223	0.13
224	0.14
225	0.14
226	0.16
227	0.21
228	0.2
229	0.24
230	0.24
231	0.23
232	0.23
233	0.22
234	0.19
235	0.16
236	0.18
237	0.18
238	0.19
239	0.18
240	0.18
241	0.18
242	0.18
243	0.17
244	0.13
245	0.1
246	0.09
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.04
258	0.04
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.13
271	0.19
272	0.2
273	0.23
274	0.26
275	0.33
276	0.33
277	0.39
278	0.43
279	0.44
280	0.47
281	0.48
282	0.47
283	0.39
284	0.4
285	0.35
286	0.29
287	0.22
288	0.18
289	0.15
290	0.14
291	0.14
292	0.13
293	0.13
294	0.12
295	0.17
296	0.16
297	0.23
298	0.31
299	0.4
300	0.45
301	0.5
302	0.54
303	0.56
304	0.58
305	0.54
306	0.54
307	0.48
308	0.43
309	0.42
310	0.42
311	0.35
312	0.36
313	0.37
314	0.27
315	0.26
316	0.29
317	0.25
318	0.21
319	0.24
320	0.28
321	0.33
322	0.4
323	0.41
324	0.42
325	0.49
326	0.56
327	0.55
328	0.57
329	0.53
330	0.47
331	0.49
332	0.43
333	0.36
334	0.27
335	0.23
336	0.15
337	0.09
338	0.08
339	0.04
340	0.04
341	0.02
342	0.02
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.08
368	0.09
369	0.11
370	0.15
371	0.17
372	0.22
373	0.3
374	0.37
375	0.41
376	0.5
377	0.55
378	0.59
379	0.6
380	0.55
381	0.48
382	0.45
383	0.39
384	0.32
385	0.27
386	0.19
387	0.18
388	0.17
389	0.17
390	0.14
391	0.15
392	0.16
393	0.17
394	0.16
395	0.18
396	0.2
397	0.23
398	0.28
399	0.28
400	0.29
401	0.35
402	0.42
403	0.49
404	0.55
405	0.57
406	0.6
407	0.65
408	0.69
409	0.7
410	0.69
411	0.65
412	0.64
413	0.66
414	0.66
415	0.68
416	0.71
417	0.72
418	0.75
419	0.75
420	0.76
421	0.72
422	0.68
423	0.61
424	0.54
425	0.49
426	0.41
427	0.38
428	0.3
429	0.27
430	0.24
431	0.23
432	0.19
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.1
437	0.11
438	0.11
439	0.14
440	0.15
441	0.15
442	0.14
443	0.12
444	0.13
445	0.16
446	0.18
447	0.16
448	0.14
449	0.14
450	0.19
451	0.26
452	0.3
453	0.36
454	0.35
455	0.37
456	0.42
457	0.46
458	0.43
459	0.39
460	0.39
461	0.39
462	0.4
463	0.4
464	0.37
465	0.35
466	0.38
467	0.37
468	0.34
469	0.29
470	0.34
471	0.35
472	0.33
473	0.32
474	0.29
475	0.29
476	0.28
477	0.25
478	0.22
479	0.25
480	0.24
481	0.28
482	0.33
483	0.33
484	0.37
485	0.41
486	0.4
487	0.42
488	0.48
489	0.54
490	0.51
491	0.56
492	0.53
493	0.51
494	0.52
495	0.5
496	0.47
497	0.44
498	0.44
499	0.41
500	0.44
501	0.47
502	0.45
503	0.43
504	0.41
505	0.43
506	0.4
507	0.35
508	0.3
509	0.25
510	0.26
511	0.24
512	0.22
513	0.21
514	0.22
515	0.27
516	0.37
517	0.39
518	0.4
519	0.48
520	0.57
521	0.62
522	0.68
523	0.74
524	0.74
525	0.81
526	0.8
527	0.71
528	0.63
529	0.55
530	0.48
531	0.37
532	0.29
533	0.21
534	0.17
535	0.16
536	0.16
537	0.17
538	0.22
539	0.28
540	0.32
541	0.36
542	0.4
543	0.41
544	0.42
545	0.41
546	0.39
547	0.39
548	0.41
549	0.37
550	0.34
551	0.31
552	0.29
553	0.26
554	0.21
555	0.15
556	0.07
557	0.05
558	0.04
559	0.04
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.04
567	0.08
568	0.1
569	0.12
570	0.18
571	0.21
572	0.25
573	0.31
574	0.38
575	0.43
576	0.5
577	0.54
578	0.52
579	0.55
580	0.55
581	0.51
582	0.47
583	0.38
584	0.3
585	0.26
586	0.22
587	0.18
588	0.16
589	0.18
590	0.21
591	0.23
592	0.23
593	0.26
594	0.3
595	0.35
596	0.4
597	0.45
598	0.44
599	0.43
600	0.44
601	0.45
602	0.43
603	0.4
604	0.37
605	0.36
606	0.33
607	0.33
608	0.33
609	0.29
610	0.28
611	0.3
612	0.29
613	0.26
614	0.29
615	0.34
616	0.38
617	0.39
618	0.38
619	0.35
620	0.33
621	0.29
622	0.27
623	0.2
624	0.21
625	0.19
626	0.17
627	0.17
628	0.17
629	0.18
630	0.16
631	0.17
632	0.12
633	0.15
634	0.2
635	0.2
636	0.2
637	0.2
638	0.21
639	0.17
640	0.17
641	0.14
642	0.1
643	0.1
644	0.11
645	0.09
646	0.1
647	0.11
648	0.13
649	0.14
650	0.14
651	0.17
652	0.26
653	0.27
654	0.29
655	0.29
656	0.3
657	0.36
658	0.42
659	0.46
660	0.41
661	0.5
662	0.58
663	0.61
664	0.62
665	0.56
666	0.5
667	0.45
668	0.48
669	0.45
670	0.39
671	0.37
672	0.35
673	0.35
674	0.33
675	0.32
676	0.25
677	0.19
678	0.17
679	0.18
680	0.21
681	0.22
682	0.23
683	0.27
684	0.3
685	0.28
686	0.32

A0A0U1LZX2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer