FuNGI

A0A0U1LQF2

Protein Details

Accession

A0A0U1LQF2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
943-964	IDDQQKPKNKARKEAERGGRGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
948-988	KPKNKARKEAERGGRGGGGPRGRGGRGGGGRGRGRGRGRGF

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001810 F-box_dom IPR027141 LSm4/Sm_D1/D3 IPR010920 LSM_dom_sf IPR047575 Sm IPR034102 Sm_D1 IPR001163 Sm_dom_euk/arc
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0120114 C:Sm-like protein family complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM
PROSITE	View protein in PROSITE PS50181 FBOX PS52002 SM
CDD	cd01724 Sm_D1

Amino Acid Sequences

MDDDSLAEEITTAVSQSSNSDIEEGEREEVDDGISLPGSEGDPSPSQHPAQHAQTQTLPTLGEAPQPQAGTENAVEQQPGASLVPSTAESTPKAAEPRLNLLDLPLDILKEILKEITLTNDLTALALTCSALHSLAIPAMYSRFDIVWPEPGPSSDQPVGVDALSYGLATLVMGDHAFRELPATISLSDRHHCHHCGCDQRDHQTASQPSTITTRFGSIRFGNYYAQYTKKFSVGNGPSEWVHEYAITKETGKMLGTLVALAVARMVNLESFVWDMPTGVMRDVFLALASLGTRSNHECRLEKVWIRWHDNSENNNIRNLLNLPEDAESSSLQSLLHRYGHVEYPSFSVLPPLKSLTVLKIDEPTYLEEMSVLIDRSRSRLTEMRICMSTRCNSQDWVYPMDIRPPLGNPNQRRTVPGWPKRGGVLSILLNDWESGMEGSGGENKENKNSANVSTAPTVVASPDSSDDIAHTVQGLGDMTIDDRQDDPKEKQDANETSRDNRNPSVSEQSKRTKANNSRKLTLGTLELENVVLSAPVMTKALDWTCLTTLTLLHCEENDSLWRALRKVYTPPTNPKLSDPQETTTLKNYPLNLKHLHTDRVSPYLMLFLKDTIAPNSLESVFFQEDSSYESIVSIEAIYKHVLRRQKASLKKLLIDRSRRSETLSVSHGHWRQWMLSREALSFVTSGRMSQLRELGIGMHRRDWHIFLRRLTNIPHLRALYLPNMYDPSFLKRDKPRELALQILDIVALRPEMQLCYVGIESKCFEILETTTKDKIPDDDSYVDPQWSAGSEADSEGEDQSNIQGPGNETDEDDETSSLGSTDEEDDGSSEEDEANGVGKAETYFNLREILYYDDKISIFKARHGCLFLMKCMNETVTIELKNGTILSGTIASVSPQMNTALRTVKMTPKGRDPISLDTINIRGSTIRYFILPESLPLDALLIDDQQKPKNKARKEAERGGRGGGGPRGRGGRGGGGRGRGRGRGRGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.09
4	0.12
5	0.12
6	0.13
7	0.14
8	0.13
9	0.16
10	0.19
11	0.19
12	0.17
13	0.16
14	0.17
15	0.16
16	0.16
17	0.14
18	0.11
19	0.1
20	0.09
21	0.09
22	0.08
23	0.08
24	0.09
25	0.09
26	0.09
27	0.09
28	0.13
29	0.15
30	0.17
31	0.2
32	0.23
33	0.24
34	0.26
35	0.31
36	0.34
37	0.38
38	0.44
39	0.43
40	0.43
41	0.45
42	0.45
43	0.4
44	0.34
45	0.28
46	0.21
47	0.22
48	0.19
49	0.2
50	0.19
51	0.21
52	0.23
53	0.23
54	0.23
55	0.21
56	0.21
57	0.19
58	0.18
59	0.19
60	0.17
61	0.17
62	0.17
63	0.15
64	0.15
65	0.11
66	0.12
67	0.1
68	0.08
69	0.08
70	0.08
71	0.1
72	0.1
73	0.13
74	0.13
75	0.15
76	0.15
77	0.18
78	0.19
79	0.21
80	0.23
81	0.23
82	0.26
83	0.27
84	0.34
85	0.35
86	0.35
87	0.31
88	0.29
89	0.28
90	0.24
91	0.23
92	0.15
93	0.12
94	0.11
95	0.12
96	0.11
97	0.09
98	0.1
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.09
103	0.13
104	0.15
105	0.14
106	0.14
107	0.14
108	0.14
109	0.13
110	0.12
111	0.08
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.05
116	0.06
117	0.07
118	0.07
119	0.06
120	0.07
121	0.08
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.1
128	0.09
129	0.1
130	0.09
131	0.1
132	0.13
133	0.14
134	0.2
135	0.2
136	0.21
137	0.21
138	0.21
139	0.26
140	0.24
141	0.29
142	0.24
143	0.24
144	0.22
145	0.23
146	0.23
147	0.18
148	0.17
149	0.1
150	0.09
151	0.08
152	0.07
153	0.05
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.04
158	0.03
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.09
169	0.1
170	0.12
171	0.12
172	0.13
173	0.17
174	0.18
175	0.21
176	0.22
177	0.25
178	0.28
179	0.3
180	0.31
181	0.34
182	0.37
183	0.44
184	0.47
185	0.52
186	0.52
187	0.55
188	0.59
189	0.56
190	0.51
191	0.49
192	0.49
193	0.43
194	0.42
195	0.35
196	0.3
197	0.32
198	0.31
199	0.24
200	0.21
201	0.21
202	0.2
203	0.2
204	0.24
205	0.21
206	0.25
207	0.26
208	0.27
209	0.25
210	0.25
211	0.29
212	0.27
213	0.3
214	0.28
215	0.3
216	0.29
217	0.31
218	0.3
219	0.26
220	0.33
221	0.33
222	0.35
223	0.32
224	0.33
225	0.29
226	0.3
227	0.31
228	0.21
229	0.18
230	0.14
231	0.14
232	0.13
233	0.15
234	0.14
235	0.13
236	0.14
237	0.15
238	0.15
239	0.14
240	0.13
241	0.11
242	0.12
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.07
250	0.05
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.09
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.08
272	0.06
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.08
281	0.12
282	0.16
283	0.2
284	0.24
285	0.25
286	0.27
287	0.33
288	0.38
289	0.37
290	0.39
291	0.43
292	0.46
293	0.52
294	0.51
295	0.51
296	0.51
297	0.54
298	0.53
299	0.53
300	0.54
301	0.48
302	0.46
303	0.42
304	0.35
305	0.31
306	0.29
307	0.22
308	0.16
309	0.15
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.12
314	0.12
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.1
322	0.11
323	0.12
324	0.11
325	0.13
326	0.15
327	0.19
328	0.19
329	0.18
330	0.16
331	0.17
332	0.18
333	0.17
334	0.15
335	0.16
336	0.17
337	0.17
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.17
342	0.18
343	0.15
344	0.18
345	0.18
346	0.17
347	0.19
348	0.19
349	0.19
350	0.19
351	0.18
352	0.15
353	0.14
354	0.13
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.07
360	0.06
361	0.08
362	0.08
363	0.11
364	0.13
365	0.12
366	0.16
367	0.2
368	0.24
369	0.3
370	0.32
371	0.32
372	0.32
373	0.33
374	0.3
375	0.29
376	0.28
377	0.24
378	0.25
379	0.23
380	0.23
381	0.24
382	0.28
383	0.27
384	0.27
385	0.25
386	0.23
387	0.22
388	0.26
389	0.25
390	0.2
391	0.18
392	0.16
393	0.2
394	0.25
395	0.32
396	0.32
397	0.38
398	0.43
399	0.43
400	0.45
401	0.43
402	0.47
403	0.5
404	0.53
405	0.55
406	0.5
407	0.51
408	0.49
409	0.47
410	0.37
411	0.27
412	0.22
413	0.15
414	0.14
415	0.13
416	0.12
417	0.11
418	0.1
419	0.09
420	0.06
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.03
426	0.04
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.11
431	0.11
432	0.13
433	0.15
434	0.15
435	0.14
436	0.15
437	0.16
438	0.17
439	0.17
440	0.17
441	0.17
442	0.17
443	0.14
444	0.13
445	0.11
446	0.08
447	0.08
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.04
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.08
472	0.1
473	0.13
474	0.15
475	0.2
476	0.25
477	0.25
478	0.25
479	0.31
480	0.34
481	0.34
482	0.38
483	0.33
484	0.32
485	0.38
486	0.38
487	0.33
488	0.3
489	0.29
490	0.25
491	0.26
492	0.31
493	0.3
494	0.31
495	0.34
496	0.38
497	0.42
498	0.43
499	0.44
500	0.44
501	0.5
502	0.59
503	0.63
504	0.62
505	0.58
506	0.57
507	0.56
508	0.47
509	0.38
510	0.29
511	0.2
512	0.16
513	0.14
514	0.12
515	0.1
516	0.09
517	0.07
518	0.05
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.03
523	0.03
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.06
528	0.06
529	0.08
530	0.08
531	0.09
532	0.09
533	0.1
534	0.1
535	0.08
536	0.09
537	0.08
538	0.1
539	0.1
540	0.09
541	0.09
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.11
546	0.12
547	0.11
548	0.13
549	0.14
550	0.12
551	0.14
552	0.15
553	0.16
554	0.2
555	0.26
556	0.32
557	0.37
558	0.44
559	0.47
560	0.49
561	0.48
562	0.45
563	0.47
564	0.42
565	0.43
566	0.38
567	0.34
568	0.37
569	0.38
570	0.36
571	0.32
572	0.3
573	0.26
574	0.26
575	0.25
576	0.26
577	0.28
578	0.31
579	0.3
580	0.3
581	0.33
582	0.34
583	0.36
584	0.29
585	0.31
586	0.28
587	0.28
588	0.27
589	0.22
590	0.19
591	0.2
592	0.2
593	0.16
594	0.15
595	0.11
596	0.12
597	0.13
598	0.14
599	0.1
600	0.11
601	0.11
602	0.1
603	0.12
604	0.12
605	0.11
606	0.11
607	0.13
608	0.12
609	0.12
610	0.12
611	0.1
612	0.1
613	0.13
614	0.13
615	0.09
616	0.09
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.07
625	0.08
626	0.1
627	0.11
628	0.15
629	0.21
630	0.22
631	0.27
632	0.34
633	0.42
634	0.49
635	0.55
636	0.58
637	0.56
638	0.58
639	0.59
640	0.59
641	0.58
642	0.59
643	0.57
644	0.57
645	0.58
646	0.54
647	0.52
648	0.47
649	0.41
650	0.37
651	0.34
652	0.28
653	0.26
654	0.33
655	0.31
656	0.28
657	0.28
658	0.25
659	0.25
660	0.31
661	0.33
662	0.29
663	0.3
664	0.31
665	0.29
666	0.29
667	0.27
668	0.2
669	0.16
670	0.12
671	0.12
672	0.1
673	0.1
674	0.11
675	0.13
676	0.13
677	0.15
678	0.18
679	0.15
680	0.16
681	0.16
682	0.15
683	0.18
684	0.22
685	0.21
686	0.22
687	0.23
688	0.25
689	0.27
690	0.28
691	0.31
692	0.35
693	0.39
694	0.38
695	0.44
696	0.44
697	0.45
698	0.45
699	0.47
700	0.43
701	0.41
702	0.42
703	0.35
704	0.33
705	0.32
706	0.32
707	0.26
708	0.22
709	0.2
710	0.17
711	0.19
712	0.18
713	0.18
714	0.17
715	0.19
716	0.23
717	0.24
718	0.3
719	0.37
720	0.45
721	0.5
722	0.54
723	0.52
724	0.54
725	0.56
726	0.53
727	0.45
728	0.39
729	0.31
730	0.26
731	0.22
732	0.14
733	0.12
734	0.07
735	0.06
736	0.05
737	0.05
738	0.06
739	0.07
740	0.07
741	0.08
742	0.08
743	0.1
744	0.1
745	0.14
746	0.13
747	0.15
748	0.15
749	0.15
750	0.15
751	0.13
752	0.13
753	0.1
754	0.12
755	0.17
756	0.2
757	0.23
758	0.24
759	0.25
760	0.26
761	0.25
762	0.27
763	0.25
764	0.24
765	0.25
766	0.26
767	0.28
768	0.32
769	0.32
770	0.28
771	0.24
772	0.21
773	0.16
774	0.14
775	0.14
776	0.09
777	0.09
778	0.09
779	0.1
780	0.1
781	0.1
782	0.1
783	0.09
784	0.09
785	0.08
786	0.08
787	0.09
788	0.13
789	0.13
790	0.12
791	0.14
792	0.15
793	0.18
794	0.21
795	0.19
796	0.15
797	0.17
798	0.18
799	0.18
800	0.17
801	0.14
802	0.11
803	0.11
804	0.1
805	0.08
806	0.07
807	0.06
808	0.06
809	0.08
810	0.09
811	0.09
812	0.09
813	0.09
814	0.1
815	0.11
816	0.1
817	0.08
818	0.08
819	0.07
820	0.07
821	0.07
822	0.07
823	0.06
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.07
828	0.08
829	0.09
830	0.13
831	0.14
832	0.15
833	0.17
834	0.16
835	0.16
836	0.16
837	0.22
838	0.21
839	0.21
840	0.21
841	0.22
842	0.22
843	0.23
844	0.23
845	0.23
846	0.2
847	0.25
848	0.31
849	0.31
850	0.35
851	0.37
852	0.36
853	0.38
854	0.4
855	0.38
856	0.38
857	0.36
858	0.33
859	0.32
860	0.32
861	0.25
862	0.24
863	0.23
864	0.21
865	0.21
866	0.21
867	0.2
868	0.19
869	0.19
870	0.17
871	0.13
872	0.08
873	0.08
874	0.09
875	0.09
876	0.09
877	0.09
878	0.09
879	0.09
880	0.12
881	0.13
882	0.11
883	0.11
884	0.14
885	0.14
886	0.16
887	0.18
888	0.2
889	0.2
890	0.23
891	0.26
892	0.32
893	0.4
894	0.46
895	0.48
896	0.52
897	0.6
898	0.58
899	0.61
900	0.57
901	0.55
902	0.54
903	0.51
904	0.43
905	0.38
906	0.38
907	0.33
908	0.28
909	0.21
910	0.16
911	0.16
912	0.18
913	0.17
914	0.16
915	0.15
916	0.18
917	0.18
918	0.22
919	0.2
920	0.19
921	0.19
922	0.19
923	0.18
924	0.16
925	0.16
926	0.1
927	0.1
928	0.1
929	0.09
930	0.12
931	0.17
932	0.22
933	0.28
934	0.37
935	0.43
936	0.52
937	0.59
938	0.63
939	0.69
940	0.75
941	0.79
942	0.8
943	0.84
944	0.85
945	0.83
946	0.77
947	0.69
948	0.62
949	0.52
950	0.47
951	0.44
952	0.38
953	0.32
954	0.34
955	0.35
956	0.33
957	0.34
958	0.31
959	0.33
960	0.33
961	0.38
962	0.38
963	0.43
964	0.45
965	0.49
966	0.51
967	0.49
968	0.5

A0A0U1LQF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer