FuNGI

A0A0U1M546

Protein Details

Accession

A0A0U1M546

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
133-152	RPGHQYRRKAIWNKNVQRQG	Hydrophilic
215-244	RRSNDNNYQRNKHRRRYRKRPEVKIGHGGT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
225-236	NKHRRRYRKRPE

Subcellular Location(s)

cysk 10, nucl 8.5, cyto_nucl 8.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019761 DNA-dir_RNA_pol-M_15_CS IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR002501 PsdUridine_synth_N IPR014780 tRNA_psdUridine_synth_TruB IPR034004 Zn_ribbon_RPA12_C IPR001222 Znf_TFIIS
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01096 TFIIS_C PF01509 TruB_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS01030 RNA_POL_M_15KD PS51133 ZF_TFIIS_2
CDD	cd10507 Zn-ribbon_RPA12

Amino Acid Sequences

MVVQFCIDCGNLLDETPQDHVTCELCGKVAKNQMFSHVQTSVSKGFPSKLRTKLTSYTQKVTAETLGSGPTIKMECPECPSNEVTWTEAQLRSADEGSTIFYRCVKCGHRNIEVGGIELCAPKDSLSVDELSRPGHQYRRKAIWNKNVQRQGLRGASRYFSCIYTYTGEEKLTSESIQAIHKPEGITSAGVLRDLQTHFNPSATFQPWIEREQERRSNDNNYQRNKHRRRYRKRPEVKIGHGGTLDPMATGVLITGIGQGTKHLHTFLGCTKTYETVVTFGVASDTYDCTGKTVRRAAYEHITRTMVEEALAKFRGKIMQRPPIFSAKRIDGKRLYEYAREGIEPPVEIKSVPVEVFDLELLEWYEPGSHEYKWPQEEMSGPERVLAEKLLDKDAAIPVASDAEAEAVEAQAAATKSPSSKRKASPLPEKSEVADEQGSISATKRVKTDGEELQSTTTTTTITTTTEADSLQTSKAVPGEEKEEAKEVQKTEMPVPGPAAARIRMTVSGGFYVRSLAHDLGKAVGSYGIMCSLVRTRQGDYTLDADKVINYSELEAGEEVWGPKVKQLLSEWQEKNQTE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.15
3	0.17
4	0.18
5	0.15
6	0.16
7	0.17
8	0.17
9	0.18
10	0.17
11	0.15
12	0.14
13	0.17
14	0.19
15	0.24
16	0.32
17	0.34
18	0.38
19	0.39
20	0.44
21	0.46
22	0.46
23	0.44
24	0.37
25	0.35
26	0.31
27	0.35
28	0.32
29	0.28
30	0.28
31	0.25
32	0.28
33	0.31
34	0.38
35	0.41
36	0.46
37	0.52
38	0.54
39	0.58
40	0.6
41	0.65
42	0.68
43	0.65
44	0.62
45	0.6
46	0.58
47	0.53
48	0.48
49	0.41
50	0.31
51	0.26
52	0.21
53	0.17
54	0.15
55	0.14
56	0.12
57	0.13
58	0.12
59	0.12
60	0.14
61	0.16
62	0.18
63	0.24
64	0.28
65	0.27
66	0.3
67	0.32
68	0.3
69	0.32
70	0.31
71	0.27
72	0.24
73	0.25
74	0.25
75	0.24
76	0.23
77	0.2
78	0.2
79	0.19
80	0.19
81	0.16
82	0.13
83	0.12
84	0.14
85	0.15
86	0.14
87	0.13
88	0.17
89	0.18
90	0.19
91	0.25
92	0.28
93	0.35
94	0.44
95	0.5
96	0.51
97	0.53
98	0.53
99	0.53
100	0.47
101	0.39
102	0.3
103	0.24
104	0.18
105	0.16
106	0.15
107	0.09
108	0.09
109	0.08
110	0.09
111	0.09
112	0.1
113	0.11
114	0.12
115	0.12
116	0.15
117	0.16
118	0.16
119	0.17
120	0.19
121	0.21
122	0.27
123	0.33
124	0.39
125	0.46
126	0.52
127	0.6
128	0.66
129	0.71
130	0.73
131	0.78
132	0.79
133	0.81
134	0.8
135	0.74
136	0.68
137	0.61
138	0.57
139	0.53
140	0.46
141	0.4
142	0.35
143	0.35
144	0.32
145	0.33
146	0.27
147	0.21
148	0.2
149	0.18
150	0.18
151	0.18
152	0.2
153	0.2
154	0.2
155	0.2
156	0.18
157	0.18
158	0.18
159	0.17
160	0.14
161	0.12
162	0.11
163	0.12
164	0.14
165	0.16
166	0.16
167	0.16
168	0.18
169	0.18
170	0.17
171	0.17
172	0.16
173	0.14
174	0.11
175	0.12
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.08
180	0.11
181	0.12
182	0.15
183	0.13
184	0.17
185	0.17
186	0.18
187	0.17
188	0.15
189	0.2
190	0.19
191	0.19
192	0.16
193	0.2
194	0.22
195	0.23
196	0.26
197	0.25
198	0.28
199	0.35
200	0.42
201	0.42
202	0.45
203	0.46
204	0.49
205	0.53
206	0.58
207	0.57
208	0.56
209	0.6
210	0.65
211	0.73
212	0.75
213	0.77
214	0.78
215	0.81
216	0.85
217	0.89
218	0.91
219	0.91
220	0.92
221	0.92
222	0.92
223	0.9
224	0.84
225	0.82
226	0.71
227	0.62
228	0.52
229	0.41
230	0.31
231	0.23
232	0.17
233	0.08
234	0.06
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.03
239	0.02
240	0.02
241	0.02
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.04
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.11
254	0.14
255	0.18
256	0.17
257	0.18
258	0.18
259	0.19
260	0.19
261	0.18
262	0.14
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.08
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.09
278	0.1
279	0.13
280	0.18
281	0.2
282	0.22
283	0.24
284	0.26
285	0.31
286	0.34
287	0.32
288	0.29
289	0.28
290	0.24
291	0.24
292	0.22
293	0.14
294	0.11
295	0.12
296	0.1
297	0.13
298	0.14
299	0.12
300	0.11
301	0.12
302	0.17
303	0.16
304	0.22
305	0.27
306	0.35
307	0.36
308	0.39
309	0.42
310	0.46
311	0.45
312	0.41
313	0.38
314	0.34
315	0.4
316	0.38
317	0.4
318	0.35
319	0.37
320	0.39
321	0.39
322	0.35
323	0.3
324	0.31
325	0.28
326	0.25
327	0.22
328	0.2
329	0.17
330	0.15
331	0.13
332	0.12
333	0.11
334	0.1
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.09
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.12
358	0.15
359	0.2
360	0.21
361	0.22
362	0.2
363	0.19
364	0.22
365	0.23
366	0.24
367	0.21
368	0.19
369	0.2
370	0.2
371	0.2
372	0.17
373	0.13
374	0.11
375	0.12
376	0.14
377	0.14
378	0.13
379	0.13
380	0.14
381	0.14
382	0.13
383	0.1
384	0.09
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.07
402	0.08
403	0.11
404	0.18
405	0.25
406	0.28
407	0.36
408	0.41
409	0.5
410	0.57
411	0.64
412	0.68
413	0.7
414	0.72
415	0.69
416	0.65
417	0.57
418	0.53
419	0.44
420	0.36
421	0.28
422	0.2
423	0.16
424	0.16
425	0.15
426	0.11
427	0.12
428	0.14
429	0.15
430	0.17
431	0.18
432	0.19
433	0.21
434	0.25
435	0.3
436	0.31
437	0.34
438	0.34
439	0.33
440	0.32
441	0.31
442	0.27
443	0.21
444	0.15
445	0.1
446	0.08
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.1
451	0.11
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.13
457	0.13
458	0.12
459	0.12
460	0.11
461	0.12
462	0.13
463	0.14
464	0.13
465	0.14
466	0.19
467	0.22
468	0.24
469	0.24
470	0.25
471	0.25
472	0.27
473	0.3
474	0.26
475	0.26
476	0.27
477	0.29
478	0.28
479	0.32
480	0.3
481	0.26
482	0.27
483	0.26
484	0.24
485	0.24
486	0.25
487	0.22
488	0.22
489	0.21
490	0.21
491	0.19
492	0.2
493	0.19
494	0.17
495	0.19
496	0.18
497	0.18
498	0.16
499	0.17
500	0.15
501	0.15
502	0.17
503	0.15
504	0.17
505	0.18
506	0.19
507	0.19
508	0.19
509	0.17
510	0.14
511	0.13
512	0.11
513	0.1
514	0.1
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.1
519	0.13
520	0.16
521	0.21
522	0.23
523	0.25
524	0.29
525	0.33
526	0.32
527	0.31
528	0.32
529	0.3
530	0.28
531	0.26
532	0.22
533	0.19
534	0.18
535	0.16
536	0.13
537	0.11
538	0.12
539	0.13
540	0.13
541	0.14
542	0.13
543	0.13
544	0.12
545	0.14
546	0.13
547	0.14
548	0.17
549	0.16
550	0.18
551	0.22
552	0.22
553	0.25
554	0.28
555	0.36
556	0.38
557	0.48
558	0.48
559	0.5

A0A0U1M546

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer