Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1M5B3

Protein Details
Accession A0A0U1M5B3    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
444-465PASPRLEKPKPTQRTKKLGTIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-363RREQPKAKGLGKIGGPK
417-462PAVPKRKGGLGKIGGKKPEPVKDEPSEPASPRLEKPKPTQRTKKLG
544-567RKREELKRQMHAMSKAPQKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 8.833, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MPHRWYRLPGSHEESIPLLLYKFIATSQGYEFYLTDLTHIWSERLEHGQILHKAEEKETSIDPSEDANQFAVFLQKIRDALGGVQSSGVDVAPGKSDGLEITTTTELPGGLNSLQWTFVLSKEPPSEITGHLLLPLLRSEQGHRRRERELLDYLAEKDKVLFKIFDKMDASQLTNIFPGIAGPRNAKLNTSGLLKHIKGASRFDESEWEKSFPGEDSDAMAVEGITDLVSGILKVPAAKGTSSGAEAWWYTLDENKQGIRRPLAKRKPPIQTEPAVSENVKGKGELLGLEDSTEDEGEFQRQETPPHLKHEKRGTSEQPPADGYGTTDSDEEAEPAPKTKSIQPQSRREQPKAKGLGKIGGPKANPEPLPRPQSPTISTASSDALQATHTEEETESDSPSPQRRSVVPPPSTQLEKPAVPKRKGGLGKIGGKKPEPVKDEPSEPASPRLEKPKPTQRTKKLGTIGSKRAAQTIELPSRDTGAARGGITASEDESDDLDSGPRVAQPGPNRNEPHHPSSETPSPVPKKPSSELEEELTAQQKADRKREELKRQMHAMSKAPQKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.31
4 0.24
5 0.17
6 0.13
7 0.13
8 0.11
9 0.1
10 0.09
11 0.13
12 0.13
13 0.15
14 0.17
15 0.2
16 0.2
17 0.21
18 0.21
19 0.18
20 0.2
21 0.17
22 0.15
23 0.13
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.15
28 0.14
29 0.17
30 0.2
31 0.23
32 0.22
33 0.2
34 0.22
35 0.3
36 0.33
37 0.34
38 0.33
39 0.34
40 0.34
41 0.35
42 0.36
43 0.3
44 0.29
45 0.27
46 0.28
47 0.25
48 0.25
49 0.24
50 0.22
51 0.25
52 0.23
53 0.22
54 0.19
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.15
67 0.16
68 0.21
69 0.19
70 0.17
71 0.17
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.12
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.1
86 0.1
87 0.08
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.15
107 0.15
108 0.2
109 0.21
110 0.23
111 0.22
112 0.23
113 0.25
114 0.21
115 0.24
116 0.2
117 0.17
118 0.17
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.15
127 0.24
128 0.34
129 0.42
130 0.47
131 0.49
132 0.52
133 0.57
134 0.56
135 0.52
136 0.46
137 0.4
138 0.37
139 0.35
140 0.33
141 0.32
142 0.28
143 0.22
144 0.2
145 0.22
146 0.21
147 0.22
148 0.21
149 0.18
150 0.27
151 0.27
152 0.3
153 0.27
154 0.26
155 0.28
156 0.28
157 0.29
158 0.22
159 0.23
160 0.19
161 0.17
162 0.16
163 0.12
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.16
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.2
177 0.21
178 0.2
179 0.19
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.24
184 0.25
185 0.24
186 0.27
187 0.27
188 0.27
189 0.28
190 0.25
191 0.31
192 0.3
193 0.33
194 0.32
195 0.31
196 0.26
197 0.25
198 0.25
199 0.18
200 0.17
201 0.13
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.03
212 0.03
213 0.02
214 0.02
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.12
242 0.14
243 0.17
244 0.19
245 0.21
246 0.24
247 0.31
248 0.37
249 0.46
250 0.53
251 0.58
252 0.63
253 0.69
254 0.72
255 0.69
256 0.67
257 0.62
258 0.56
259 0.5
260 0.45
261 0.39
262 0.32
263 0.27
264 0.23
265 0.22
266 0.2
267 0.18
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.11
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.15
291 0.22
292 0.24
293 0.31
294 0.38
295 0.36
296 0.42
297 0.51
298 0.53
299 0.5
300 0.54
301 0.52
302 0.51
303 0.56
304 0.5
305 0.42
306 0.36
307 0.32
308 0.27
309 0.22
310 0.16
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.13
326 0.17
327 0.26
328 0.33
329 0.42
330 0.49
331 0.58
332 0.65
333 0.73
334 0.74
335 0.7
336 0.71
337 0.66
338 0.67
339 0.66
340 0.62
341 0.56
342 0.51
343 0.49
344 0.44
345 0.46
346 0.39
347 0.35
348 0.31
349 0.3
350 0.31
351 0.32
352 0.3
353 0.27
354 0.3
355 0.33
356 0.4
357 0.38
358 0.42
359 0.4
360 0.43
361 0.41
362 0.39
363 0.35
364 0.29
365 0.28
366 0.23
367 0.21
368 0.17
369 0.15
370 0.12
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.1
380 0.12
381 0.13
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.16
386 0.22
387 0.24
388 0.23
389 0.25
390 0.28
391 0.35
392 0.44
393 0.49
394 0.47
395 0.46
396 0.48
397 0.49
398 0.49
399 0.42
400 0.38
401 0.33
402 0.32
403 0.37
404 0.43
405 0.48
406 0.47
407 0.5
408 0.47
409 0.52
410 0.53
411 0.48
412 0.48
413 0.47
414 0.54
415 0.57
416 0.6
417 0.54
418 0.51
419 0.54
420 0.51
421 0.51
422 0.47
423 0.44
424 0.47
425 0.47
426 0.5
427 0.47
428 0.47
429 0.43
430 0.39
431 0.4
432 0.37
433 0.36
434 0.36
435 0.43
436 0.43
437 0.45
438 0.53
439 0.58
440 0.64
441 0.72
442 0.79
443 0.78
444 0.83
445 0.82
446 0.81
447 0.78
448 0.75
449 0.73
450 0.71
451 0.69
452 0.64
453 0.63
454 0.55
455 0.51
456 0.45
457 0.37
458 0.34
459 0.36
460 0.38
461 0.34
462 0.36
463 0.33
464 0.34
465 0.33
466 0.27
467 0.19
468 0.15
469 0.17
470 0.15
471 0.15
472 0.13
473 0.13
474 0.14
475 0.13
476 0.11
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.12
491 0.17
492 0.25
493 0.35
494 0.4
495 0.48
496 0.51
497 0.53
498 0.62
499 0.63
500 0.61
501 0.58
502 0.56
503 0.51
504 0.54
505 0.58
506 0.52
507 0.48
508 0.51
509 0.5
510 0.53
511 0.57
512 0.55
513 0.54
514 0.55
515 0.61
516 0.57
517 0.57
518 0.55
519 0.51
520 0.48
521 0.43
522 0.41
523 0.35
524 0.3
525 0.23
526 0.24
527 0.26
528 0.32
529 0.4
530 0.43
531 0.46
532 0.56
533 0.66
534 0.74
535 0.77
536 0.78
537 0.76
538 0.76
539 0.76
540 0.74
541 0.68
542 0.64
543 0.63
544 0.64
545 0.66
546 0.7
547 0.74