Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U1LJ71

Protein Details
Accession A0A0U1LJ71    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
568-610AENLKLIGRHKRKRRDDEEGEPRRNREGRRGKKKRHQVDSDGEBasic
649-671ALDASMKKPQRRRRKADGIDLEQHydrophilic
778-802VIVFYTKSKRPEQRIKRQAERLLADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
575-604GRHKRKRRDDEEGEPRRNREGRRGKKKRHQ
614-627GKAARRKSAKSKRA
641-663RRRRALDRALDASMKKPQRRRRK
894-908RMKARQLNAGKASRK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025574  Nucleoporin_FG_rpt  
IPR024864  Nup54/Nup57/Nup44  
IPR025712  Nup54_alpha-helical_dom  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF13634  Nucleoporin_FG  
PF13874  Nup54  
PF18570  Nup54_57_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSLFGAQPQQQQSGGLFGNTANKTPSLFGNTQQQSTGGSLFGNTQSKPATGTGLFGSSVNQPQQQSSGLFGSTQTQTQNQPTGSLFGGQQTQAPTQTQTQPQAGGGLFGSTTQQKPAGSLFGGTTQQPQQAGTGLFGATSNAQQQPQQQQQPQQQQSLFGGGSLFSNQQQQTQQQPQLGQTMNQSQLGSSLWSPGRAITGVHRTVPAQMEIIRDKWDPTNQTSPFRTYLYNFVGEDQAPFFQPGLDDDVTKWEEALKSRPEPGYVPVLVKGFWELGKRAQRQKDFLSIMQTRLHEINQCLTDLLSRHDLKISVRIADCRRKHLVLSQRCLSLAAKTQVLRNRGYAMDDAEEELKKKLIQLERGIFDPSITGRAEEIWARMLAIREHAKRLTTEIERAGSSATDDANETLDENVIKIAKKILEDYASQIHHLQKELAAIQKEFDEAQEAPLPSLLRRDVPFTLAIYLACSRRRTGFIDTPLFRVVGEPVREQLSTMSASPEAQPASPAADRDELQEELDDLNDTGDAGAGEADLSDDESVLSEVDEAQFEDFNPDDVDIEDRPALDVDAENLKLIGRHKRKRRDDEEGEPRRNREGRRGKKKRHQVDSDGEDGDGKAARRKSAKSKRAATPEDDETLSPEERRRRALDRALDASMKKPQRRRRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTDAARLDAEARREGQPAMRKLKMLPEVMNLLNRNQYTASLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGELPAYNIQRDLLDALGRLPINKDTLVASGIGKVIVFYTKSKRPEQRIKRQAERLLADWTRPILQRSDDYSKRVYEEVEFDPTRLVNRANIAQRTAEEARAMELLPPRLANRARREMGHTSYNIVPRSTVVQDSKFARPVGASGEDRFRRMKARQLNAGKASRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.2
3 0.16
4 0.15
5 0.24
6 0.23
7 0.24
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.23
12 0.26
13 0.25
14 0.26
15 0.28
16 0.36
17 0.39
18 0.39
19 0.38
20 0.34
21 0.29
22 0.29
23 0.26
24 0.16
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.19
29 0.21
30 0.19
31 0.21
32 0.22
33 0.23
34 0.25
35 0.23
36 0.22
37 0.19
38 0.21
39 0.19
40 0.19
41 0.19
42 0.17
43 0.18
44 0.17
45 0.22
46 0.23
47 0.26
48 0.25
49 0.26
50 0.28
51 0.29
52 0.26
53 0.24
54 0.23
55 0.19
56 0.18
57 0.17
58 0.2
59 0.18
60 0.2
61 0.19
62 0.2
63 0.24
64 0.29
65 0.34
66 0.3
67 0.31
68 0.3
69 0.3
70 0.27
71 0.25
72 0.2
73 0.17
74 0.2
75 0.17
76 0.19
77 0.2
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.22
82 0.25
83 0.32
84 0.35
85 0.37
86 0.37
87 0.36
88 0.34
89 0.35
90 0.3
91 0.24
92 0.18
93 0.14
94 0.11
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.17
101 0.16
102 0.18
103 0.2
104 0.2
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.18
111 0.2
112 0.2
113 0.22
114 0.22
115 0.21
116 0.18
117 0.2
118 0.2
119 0.17
120 0.15
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.17
131 0.24
132 0.32
133 0.4
134 0.47
135 0.48
136 0.54
137 0.63
138 0.71
139 0.7
140 0.67
141 0.59
142 0.54
143 0.5
144 0.45
145 0.35
146 0.24
147 0.2
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.1
153 0.16
154 0.16
155 0.2
156 0.24
157 0.27
158 0.34
159 0.41
160 0.44
161 0.4
162 0.42
163 0.4
164 0.43
165 0.4
166 0.33
167 0.29
168 0.31
169 0.3
170 0.3
171 0.28
172 0.21
173 0.21
174 0.2
175 0.18
176 0.12
177 0.16
178 0.14
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.16
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.22
187 0.23
188 0.24
189 0.24
190 0.23
191 0.26
192 0.28
193 0.23
194 0.17
195 0.17
196 0.2
197 0.21
198 0.22
199 0.22
200 0.21
201 0.22
202 0.24
203 0.28
204 0.27
205 0.31
206 0.39
207 0.39
208 0.45
209 0.46
210 0.46
211 0.43
212 0.4
213 0.37
214 0.3
215 0.33
216 0.3
217 0.3
218 0.26
219 0.25
220 0.25
221 0.23
222 0.22
223 0.17
224 0.14
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.18
236 0.19
237 0.18
238 0.17
239 0.13
240 0.15
241 0.17
242 0.23
243 0.23
244 0.25
245 0.29
246 0.3
247 0.3
248 0.29
249 0.29
250 0.29
251 0.25
252 0.24
253 0.21
254 0.21
255 0.2
256 0.18
257 0.16
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.2
263 0.28
264 0.34
265 0.41
266 0.48
267 0.51
268 0.54
269 0.56
270 0.57
271 0.51
272 0.46
273 0.46
274 0.4
275 0.38
276 0.37
277 0.34
278 0.28
279 0.26
280 0.26
281 0.21
282 0.2
283 0.22
284 0.19
285 0.19
286 0.17
287 0.16
288 0.16
289 0.14
290 0.15
291 0.17
292 0.17
293 0.17
294 0.19
295 0.2
296 0.19
297 0.25
298 0.24
299 0.21
300 0.21
301 0.27
302 0.32
303 0.4
304 0.41
305 0.4
306 0.43
307 0.41
308 0.41
309 0.42
310 0.46
311 0.45
312 0.49
313 0.46
314 0.43
315 0.42
316 0.42
317 0.35
318 0.28
319 0.25
320 0.21
321 0.2
322 0.2
323 0.25
324 0.28
325 0.31
326 0.29
327 0.25
328 0.25
329 0.22
330 0.24
331 0.2
332 0.17
333 0.15
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.11
343 0.16
344 0.19
345 0.23
346 0.29
347 0.33
348 0.33
349 0.34
350 0.34
351 0.28
352 0.23
353 0.19
354 0.13
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.1
361 0.09
362 0.1
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.09
369 0.13
370 0.18
371 0.18
372 0.21
373 0.22
374 0.21
375 0.21
376 0.23
377 0.24
378 0.2
379 0.21
380 0.2
381 0.21
382 0.2
383 0.19
384 0.17
385 0.12
386 0.1
387 0.09
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.09
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.13
410 0.15
411 0.18
412 0.17
413 0.17
414 0.18
415 0.19
416 0.18
417 0.18
418 0.16
419 0.12
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.09
430 0.09
431 0.07
432 0.09
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.13
437 0.13
438 0.1
439 0.13
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.14
444 0.13
445 0.14
446 0.15
447 0.13
448 0.13
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.11
453 0.12
454 0.14
455 0.14
456 0.14
457 0.16
458 0.19
459 0.21
460 0.25
461 0.28
462 0.31
463 0.38
464 0.38
465 0.38
466 0.36
467 0.32
468 0.26
469 0.21
470 0.17
471 0.14
472 0.15
473 0.13
474 0.14
475 0.15
476 0.15
477 0.15
478 0.13
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.11
487 0.09
488 0.08
489 0.09
490 0.08
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.12
497 0.14
498 0.16
499 0.13
500 0.13
501 0.12
502 0.11
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.03
511 0.04
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.02
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.03
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.09
544 0.08
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.1
560 0.13
561 0.21
562 0.29
563 0.38
564 0.47
565 0.58
566 0.68
567 0.77
568 0.82
569 0.82
570 0.79
571 0.81
572 0.82
573 0.81
574 0.79
575 0.71
576 0.65
577 0.61
578 0.59
579 0.51
580 0.5
581 0.52
582 0.55
583 0.64
584 0.73
585 0.77
586 0.82
587 0.91
588 0.9
589 0.89
590 0.85
591 0.8
592 0.79
593 0.73
594 0.67
595 0.57
596 0.46
597 0.37
598 0.29
599 0.23
600 0.16
601 0.12
602 0.13
603 0.14
604 0.18
605 0.22
606 0.27
607 0.37
608 0.47
609 0.55
610 0.58
611 0.65
612 0.69
613 0.74
614 0.73
615 0.66
616 0.61
617 0.55
618 0.49
619 0.41
620 0.34
621 0.27
622 0.26
623 0.22
624 0.19
625 0.21
626 0.25
627 0.27
628 0.32
629 0.34
630 0.36
631 0.43
632 0.49
633 0.51
634 0.49
635 0.5
636 0.48
637 0.46
638 0.42
639 0.37
640 0.37
641 0.37
642 0.37
643 0.43
644 0.51
645 0.6
646 0.7
647 0.76
648 0.79
649 0.83
650 0.84
651 0.86
652 0.85
653 0.79
654 0.73
655 0.64
656 0.54
657 0.43
658 0.35
659 0.25
660 0.15
661 0.09
662 0.05
663 0.05
664 0.06
665 0.07
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.09
670 0.14
671 0.17
672 0.23
673 0.25
674 0.3
675 0.31
676 0.31
677 0.33
678 0.3
679 0.29
680 0.24
681 0.24
682 0.2
683 0.2
684 0.2
685 0.24
686 0.3
687 0.35
688 0.4
689 0.39
690 0.39
691 0.39
692 0.46
693 0.46
694 0.41
695 0.35
696 0.31
697 0.34
698 0.34
699 0.38
700 0.31
701 0.26
702 0.28
703 0.26
704 0.25
705 0.21
706 0.2
707 0.17
708 0.17
709 0.17
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.14
714 0.14
715 0.12
716 0.11
717 0.1
718 0.07
719 0.08
720 0.06
721 0.07
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.07
727 0.07
728 0.09
729 0.14
730 0.13
731 0.14
732 0.14
733 0.14
734 0.14
735 0.16
736 0.15
737 0.1
738 0.1
739 0.11
740 0.1
741 0.11
742 0.11
743 0.1
744 0.1
745 0.1
746 0.1
747 0.14
748 0.14
749 0.13
750 0.14
751 0.15
752 0.16
753 0.16
754 0.17
755 0.14
756 0.15
757 0.15
758 0.14
759 0.13
760 0.12
761 0.12
762 0.11
763 0.1
764 0.08
765 0.08
766 0.1
767 0.11
768 0.14
769 0.21
770 0.28
771 0.33
772 0.42
773 0.51
774 0.59
775 0.68
776 0.75
777 0.79
778 0.82
779 0.86
780 0.87
781 0.87
782 0.83
783 0.8
784 0.73
785 0.64
786 0.63
787 0.54
788 0.46
789 0.39
790 0.35
791 0.31
792 0.3
793 0.29
794 0.24
795 0.27
796 0.3
797 0.36
798 0.43
799 0.42
800 0.45
801 0.46
802 0.45
803 0.44
804 0.4
805 0.34
806 0.28
807 0.29
808 0.28
809 0.33
810 0.31
811 0.28
812 0.29
813 0.28
814 0.27
815 0.24
816 0.23
817 0.17
818 0.22
819 0.29
820 0.35
821 0.37
822 0.37
823 0.36
824 0.35
825 0.39
826 0.37
827 0.31
828 0.25
829 0.22
830 0.22
831 0.21
832 0.21
833 0.18
834 0.2
835 0.22
836 0.22
837 0.23
838 0.22
839 0.29
840 0.35
841 0.4
842 0.44
843 0.51
844 0.53
845 0.54
846 0.6
847 0.59
848 0.59
849 0.57
850 0.49
851 0.44
852 0.46
853 0.49
854 0.44
855 0.37
856 0.32
857 0.27
858 0.3
859 0.29
860 0.3
861 0.29
862 0.3
863 0.35
864 0.39
865 0.44
866 0.44
867 0.41
868 0.36
869 0.31
870 0.3
871 0.29
872 0.31
873 0.28
874 0.27
875 0.37
876 0.38
877 0.41
878 0.42
879 0.39
880 0.41
881 0.42
882 0.48
883 0.49
884 0.55
885 0.63
886 0.69
887 0.75
888 0.75